LncRNA Gene

ZFLNCG00088

Basic Information

Chromesome: chr1

Start: 6497668

End: 6501523

Transcript: ZFLNCT00127

Known as:

Genome Browser
Express profile Download
Express in top 10 samples
Sample Tissue Condition FPKM
SRR1004789 larvae impdh2 morpholino 16.33
SRR1004787 larvae impdh1a morpholino 14.57
SRR941753 posterior pectoral fin normal 10.64
SRR1104059 heart kctd10 mut 9.62
SRR527832 16-36 hpf normal 9.08
SRR1104058 heart normal 8.24
SRR1004785 larvae normal 8.07
SRR891512 blood normal 7.25
SRR1035239 liver transgenic mCherry control 7.22
SRR1205154 5dpf transgenic sqET20 7.05
Express in tissues
Correlated coding gene Download
gene correlation coefficent
si:dkey-159f12.2 0.55
Gene Ontology Download
GO P value
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GO:0043043 1.93e-02
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GO:0006518 2.27e-02
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GO:1990904 2.79e-02
GO:0030529 2.79e-02
GO:0005622 3.06e-02
GO:0003735 1.27e-02
GO:0005198 2.70e-02
KEGG Pathway

KEGG pathway of this lncRNA gene hava does not exist!

Conservation
Zebrafish lncRNA Transcript Human lncRNA Transcript Mouse lncRNA Transcript Methods
ZFLNCT00127 ENST00000452246; NONHSAT194235; ENSMUST00000056948; NONMMUT026971; Direct blastn
OMIM

OMIM of this lncRNA gene hava does not exist!

Sequence Download
>ZFLNCG00088
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TGGATAAAAATAAGAATTATACAACCTACCTTTGGTTTAATCCCTACCATTTTAAATCCCGTCTTGACAA
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TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTAAACGCACCTCATGTATACAACGTTATACACACACCACACCGTAT
TTACATTTAACGTTAAGCGTTTCAGTTTTTGACCTCGCTTTATAGCATGATGTAAAGGTTTAACAAGTAA
AACAAAACAAAAAATTAGTTAAACAAAACAAAAATTGAACAAAAATATGCGTCAGTCTTAGTCTACATTT
AAATGAAGCATTAGCCTTAAACATTACACATTTAACGTGACATAAAACAATAAAAAACAGTCCGTTACTA
GCGAACACAGCTAACGTTAGCTTGCTCAACCTAGCCACGAAGTCCAACTCCTCGGCTATAACTAAATATT
ATACCTACGTGGACAGATGCGAGTTCTCTATATATTCTCGCAGACTTCAACATGTGAATTAACAGCAAAA
TAAAAACAGTTTTGACAGTTTCACCTCCTTCTTGAGAGGGGCCTTCGCTGCTGTACTTCTCATTCGCCAT
CGCAG