LncRNA Gene

ZFLNCG00172

Basic Information

Chromesome: chr1

Start: 13282497

End: 13291136

Transcript: ZFLNCT00254

Known as:

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Express profile Download
Express in top 10 samples
Sample Tissue Condition FPKM
SRR941753 posterior pectoral fin normal 4.59
SRR800037 egg normal 4.51
SRR941749 anterior pectoral fin normal 4.30
SRR797917 embryo pbx2/4-MO and prdm1-/- 3.79
SRR516129 skin male and 5 month 3.69
SRR1048061 pineal gland dark 3.66
SRR797914 embryo pbx2/4-MO 3.33
SRR658539 bud Gata5/6 morphant 2.96
SRR1188156 embryo Control PBS 4 hpi 2.91
SRR1205157 5dpf transgenic sqET20 and neomycin treated 1h and GFP+ 2.90
Express in tissues
Correlated coding gene Download
gene correlation coefficent
supt4h1 0.63
si:dkey-159f12.2 0.56
LOC100535417 0.56
lamtor1 0.56
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Gene Ontology Download
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KEGG Pathway Download
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Conservation
Zebrafish lncRNA Transcript Human lncRNA Transcript Mouse lncRNA Transcript Methods
ZFLNCT00254 NONHSAT198601; Direct blastn
OMIM

OMIM of this lncRNA gene hava does not exist!

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>ZFLNCG00172
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TCATCGTAAGGACTTCATTCATTTAATTGAGATTTTATTCGTAGGCCTATGTGAAAAATGTTTGAATCAG
TCACCTTCATTACTGCAGTTTTACATAACGTTTGTAATTTCTGTATTTAATTTCTTTCTCTTTTTATAAC
AGGGATGCCCATCACTGTTCCTCCACCCAGTAAGTTCATATACCTTTAAAGGTTCAAGATGCACTTTAGT
TTTCTATTTTGATGATTTCTGGTGATTTCCAAAAATATTTATTTTTATTAAACCACAAAATTACCATATT
TTATCCATAACTTGTATATATACACACTATATATACTATATAGTTACTATAGTAGTTTAGGTTCTATTGG
ATTGCGACCCCTTGGGTAATTACATTATATTAAAGACACGGCAATAGCGTGTGATGCATCAGATTGGTTT
TATAACACCAGGTTAAACTTTCTGGCCAATTTACAGCCCTCACATACAAAAAAAAGAAATTAAACGTAGA
ATAGAGTTGGGTCTATTGGTGTGTGCGCCATTGCATGCGATGTTTACGTATTTATAACCACCTCAGAGGA
TATTGGGGGTTGCGAGTCACTGGCATCGTCATTTTGGGGGTCGCAAGCTGAAAAGTTTGGGAACCCCTGA
TCTATAGGGTTTGTTGCATGTTTTTCCCCACGATGCTGTCAAGGCCGATACAGCAAAGCTGTTGGTTTGT
TACAAGCATTTTTGTTGGGAGAGCTGTATAAGACTTGTAGAGTGAAAGACTTTGTCTTTTATCAGTTAAG
TTTGTTACCATTAAGACACATCGCCTATATTCGTGCTGCTGTGTTCGCCATACGTTTAAAATGCTCCAGA
TTACTGCTAATGGTTGGAATAGACAGGGCAAGAGACCTGCTGCATTGCTATCCACTATGTCTGCATTCAG
ACCTGGGGATTGAGGAGGAGAGAAGTCCTCTTCATTTATAGTGTTTTTCTAAACATGATTATCTTTATAA
TGGTATAACAAATAATGGTTATGTGTATGTGAAATTACGGATAACAAATGTAGCAGGACATTAAATTACT
TGCTGTTTATTTCTTTGCATTTTAACTTTGTAAATTTGTTTGCGTCTCATTTTGTGAACCAACTGACAAC
AGTTGTTCTCTCTCTCATCTTTTTCCCCTGCTCTGCTGGCCATGCTCACTCCTCCTCCTGCTCGCAGAGC
TCCACACCCTAACTAAGATAGACCTGAACTGAATAAGGGGGGTTTCTTAGCCCTTTAAATGTTCCAGTTT
GGAGAGGATTAATGATGATTATGTATGTGTTTTCACTGTTCTTGTGTTTAAAAATCTGGTGTTTGATTGT
GTTTGTAGATTTTCCTCCACCCACTGGAGGACCTCCTCCTTCACTTATTCCTACAATGGACAAGTAAGTG
TTTTTTGGGCTATTTAATTTGTTAATGCAGATAGGTCTGCCAGTCAAAAAAAGAGATGCTTAATTTCTTT
AAATAAATGATTACCTGTTGTCAAAAGTGACAGTAAAGACTGTTAATTGTTACAAAGATTGTTTCAAGCT
AATGTGGTTTGAATCATAAAAAAAAATCAGTTTTTAAAAATGCATCAAAGCAGCACTATGGTTTTCATCA
TTTGATAATATACTGTATGTTGCAAATCAGGCTGCTGATGGCAAATAGGTGCAGAAATGTAAGCCCTAAA
GGAAACAACAAATTCCATTTTAAAATAAAAATGTATTTAAATGTAAAGTGTAATAATAGATTCGAATTAA
TTTGCATTTAAAGCATTAAGAATAATGATTTCAATGTTTGCTTGTTTGTTTTTTTGCCAGGGGTCGTTTG
ATATCTTTTGTGAGTGTTTGTATGTTGGATTTCCATCTGTTTAATAAAAAATGTATATTATTTTAATGAA
ATAAATATCGCCCGGATTTGCATAAGAACAATTTATGGTTGCATAATTTTCTTTTCTGTGGTCTGCAAGC
ATGTATATCAACTTGCATTCAGTTTTTAAGACATCATTTTCTATAAAAGATATTCTGGATAGATATTACA
TTTCTTCTTACATTTTGAATAGACAACTAATAAAAATTAAAATGCAAATTCTTCTTCTTATTATTAAATT
GAGATTAAATGTTCATTGTAATCTATATAGGAAAAAATAAGTTATTTGATTGATTGTAGTTTTTTATGTA
TATAGTTCTTATTTGAACCTTTAAGCTGAATTATTGTCAGTTTGCAATATTCTATCATTTAAAGATTAGT
CATGCAAAATGAATGTCAACATTAAATATTTCAAAAACTCGACACCTCATTAATTGATGTGCTGTATTTA
GCAGTGGGCACCCAGGAGGATATGATGGACGTCCCGTCGCTCCATACCCGTTTCCTACAGGTAAGTGTGC
GAAACTCTCCCCAGACGATTGTATTCACCTAAAAACTTCATTTAATTTAGATCTCAGAACAGGTCACAAG
TATTTAAATGTGTCCCAGCCTTTATTAACCTCAATTAAGAATGATTGCACATTGGGCTCCTGTGTTCTGG
TTTTAGGTGGCTTTCCTCCACCTATGCAGGGAGCTGTTAACCCCTGGCCTGGTCTGATGGAGAATCCCAA
ACAGTGGGATTATTACCCCCGAAGAGACAAAGAGAGGGAAAAAGAGCGAGAAAGAGAGAGACAGAGAGAC
CGCGGCCACGAGAGAGACCACAGCCCCAACGCAGGGCCTTATAACAGGTGAAAGATGATGCTAATAAATG
TGATTTTTGCATAGTATTGGATATTAAAAGCAAGACACTGTAGGTGAATCAGGTAAAACAATTAACTAAT
ATTCACCTGTTGATTGATTACATTATGTAGAACTGCAAACATTTAGTTTAAAAAGGGGTATGTTAAATAT
GGAAATGAGCCATTATTTCATTAATTATGTTCTAATTTGCATGCAGTTCTAGCACATAAAGCATTGGAAG
TCAGGTTTAATTATTATTTTTTCTTTCATATTAGTCAGTTAATTTCAATAGTGGATTTTAAAAATCTCTT
TATTGCTTCATTATTCAGAAAATAGAGCAAACAGCCAGAAAAAAATCACTTTCAACATTGCTTGTACAAT
AAAATGGTGTACATTATCAAGCAAGTTATGTTTAAACTTATGTTTTGTATGTTTCATAAAGTTATGTTTT
AGAGATTAATATTATAGATTAGATCTTTTTAATTGATTAACAGAAAATAGGGATTGTAATTATTTTTTCA
GGGGTTTTCACCTTTATTGTATAGGACAGTAGAGAGTATTGACAAGAAAGCATGGGGAGCAGAGAGAGGG
AAGGATTGGCATAGGACCGCAAGGCGGGAATGGAACTGGGGTCGCTGTGAGCACCGGAGTGCATGGGTGG
ATGCACTAACCACTACACCACTGGCGCCGGAGAGAATAGGGATTATATAATCATTTTTTTAACATTAGAC
TGACTCTGAAAGCCCAGAATCTTATACATTGACAGATGCATGGGAAACTGTGATTTGATATGTTTTAAAG
GGGTGTGTTTAAATATCAAAATCAGCCAATATTTCATTAAATATCTGCTAATGCAGGTCTAGCACATAAA
GCATTCTAAGTCAGATTAAATTTAATGATTTTTTTTATATTAGTCATTTAATTTTATAGAGTGGATTTTG
GAAATCTCTATTGCTACATTATTGAGAAAACAGTGCAAACAGCCAGAAGAAAAATAAGAAAATTCACAAT
TTTTATACTGCAAAATGGTGTTTATAATTCACCAAGTTACGTGTATAAATGTAAAAAAAACTTGACAATT
TAGATGATAGATTTTAGCATTTTTATAGATTAAAAATAGACACCAACAGAGATGGAGACCCCAGGATTAT
GTTCACAGAGAGAGAGCTGGAAACAGTAGGACATTTTCTACTTCACTGTGATCACCATCGCCACATTAGA
GTTCAATATTTTTTTTAAAGATTCAAGCTAATTTATCCAAATTTTATGGCATTATCAAATTCAGGAAAAT
CACCATATATTTTAGGTGAAAATTCAACAATGATCCCAACAGCAGCCAAATATGTGTCAGCCTGCCTCAA
TCTCTCAGCCAATGGACAAACCTATAGCAAGAGCATTTCCTGTTTATATCCTGATAATTATTACCATTAT
CTTTACATTTTTATTGATTTGTTTTTATTTTATTCTTATTTATCTCTTGTTGTTAGAATTTTTATTTACT
TGTATTTATTTACTATGTATATAATGTGCATGTACCTATTACTGATATATTCTTGACTTGTTCTATGTAT
TATATAATTGCTTCGGCAATACTGTGCAAGTCATACCAATAAAGCTCATTTGAATTTGCTTAGAAATATA
GAACATGGATTATTTCATCATTATTATTTTTAATTAGACTTCATTTATAAAAAGCCCAAAAGATTAAACA
TTGACAGATGCATGGAACACAGATTATTTTATAGTGTTATAGTTATATCTTGTGGGTTTCCTCTGGGTGC
TCCGGTTTCCTCCATAGTCCAAAGACATGCGGTACAGGTGAATTGAATAAGCTAAATTGGCCGTAGTGTA
TGTGTGTGTGCAAGAGTGTATGGGTGTCTCCTAGTGTTGGGTTGCGGCTGGAAGGGCATCCGCTGCATAA
AACACGTGCTAAATAAGTTGTCGGTTCATTCCGCTGTGGATACCCCAGATTAATAAAGGGACTGAGCCGA
AAAGAAAATGAATGAATGAATGTTTAAATAGAAATGAATTATTATTTCATGAAATATGTGTTCATCTCCA
TGCAGTTCTAGCACATAAAGCATTGGAAGTCTGATAAAATTTTATTTGGCAACTTTTTTGAGAATCTCTT
TATCGCAATTCAAAAAATGTTTAATTGTCAATTAGCCTGAAAATCAATTGACAAAAAGCCCTAAGTCTTA
AACACTGACAGATGCGTGGATTGTTTTTGCCTACAGTGTCTCGCTTAAGAGATTTAAGTTGTCATCTTAC
TATACATGATTGATCAGTGACTCAACGTTCTTCTACTCAGGATGTTTTTATGGAGCAGTTGTTTACATTG
TGATTGATTTTAAAGCATGGCCATGTGCAGCGATGAAGAGCGCTACCGCTCTTACCGTGACTATGGAGAC
CGAGGATATGAGAGGCATCGGGAGCGAGCGAGCCGGGAGAAAGAGGAGCGCCACAGAGAGAGGAGACACA
GAGAGAAAGAGGAGGGCAGGCACAAGTCATCACGGAGGTACTGTACCACACTCTCAAATCAGGATACACT
TAAGCTCAACCAACCTAACACAAATGACCCAAAATCTGTGTTTTTATGATTTGGTTAATCAATTGTTTTT
CCATTTACTCGTCTCCAAGTGGTTTGAGTTTCTTTATGTACACTTAAACAGCCTAAAAAACTGGGCAAGA
CCCAAATGACTTATTAATGCACAAGTAAATCTACCATGTATCCCCTTTAAGATCTTTTCTCCTCTGTGAT
CTTCTCCTGTTCTGTCACAGCAGTAGCAGACGGAGACATGAGAGCGAGGAGGGAGACAGTCACCGGCGCC
ACAAACACAAGAAGTCCAAGAGGAGCAAAGAGGGCAAAGAGCCCAGCGAGGAGCGATCCGCTGACCAGGA
GAACCAGGAGGCCATGGAGTAACTCCTGCTCGCCTTCTGTCACCGCAACCAAATCATGATAAACGAAGCT
GTAATCCAGTTTACCTTCTGTTCGTTTTCACGTTGCCCTTTTTTTTGTTCTGTTGGTTTTTCCCAGTGCA
GTTGTAACATGTAGATGTTGATTTGTTGGATTAAAAAAGAGCATTTGGTAATGTTTGTTGGGTCTTGTGT
GTTTATTATTGTTATTAAAAACGTTCACAGTTGTTATCAGACTCTACCAAGGCTGCATATAATAGAATTA
AACAGTGTTACGGAATTCTTTTAGGATTTAAAAGGCACATATGATGAAAATCAGCTATTGTGAGCTGTTT
GGACAGAACTGTGTAATTATAGTGTGTCCACAGTCATATTGGAGTGATCAAATTTCCTGACGTGGACCAC
ATGTCCACCGAACATTTGTTTAGCAAATAAACTGGAATTAAAATTTTGTACAACTCCCTTTGATTTTTTG
CAAGTTTAAAATGGTTATTAAACTAATAATAAGGTTAGTAGACACTAATATGTGTGTGTACTGCAATCAG
CGATGATGTGAGACTCATCATGTCAGAAAGGCTTGAATAAACTCCACAAATACATCAAATTTGCTTGGTA
TTTTTGACTAATGAGCTGTATTTCAGCTTTATCTGCGTCTGTCACTGACTGCTGTTTATCTGACGTAATG
CATGATGAGAACTGGGCGGGGCAGGGAGAAGCAGCTCATTTACATTTAAAGCCACAGGCTACAAAAACAG
CTACACTGTATTCAGACATCAAAATGGGCAGATTCTGGGGCTATAATAAATAATCTGATGGGTATTTTGA
GCTGACACTTTACAGACACATTGTGGAAACATCAAAGGCTTATTTTACAGCTTGTGAAAGAGGTAAATTA
GGTGTTCTTTGAAATAACTTTTGGGTTATTTTTGGGTCAAGCAGACATTACCCCAGCCTTCAGTGTGTTA
TGTGATTCTACAGAAATATAATGCCTATTATTCTGTGCTTAAAAGCTGTTCTTATTATCAAGTTGAAAAC
TGGTCAATATTTTTATTTTTATTGATGATTTATTGATGAATAGAATGGTTAAAAGAACATTTTTAAAAGG
AATTATTTGCCTTTTTTATCTATTTAATCCATTATTTTTAGTGCAAAAAAATTACTGGTGGAAAATATTT
TATATTAAAAATAATAAATAAGCCCAAACATTTGAACGGTGGTGTATAATAGCGTATGAAATACAATGTG
TATTATTTATTAAGTTTGCTACCTAACAAGTAAACTACAACACATTAAGTACTAAACAATACATTTGCAA
TTATGGATAAAAGGGCAATATTTACATAGCTCTTTAATGAATTATACTGAAATACAAAAGCATACTATTT
ATATCTACTGTACTCTAGTATTAACTTTATTAATGAGCAGCGGTTGACTTAACCATTAAGCGAGGTAAGC
AGACGTTTTGGGCCCCAGGGAATTAGGGGGCCCCAACCAATGCCAAGAAGCCTGTATTAATATATTATTA
ATCAATTCAATTTGTTTATTGTCATGTGCACAGTAAGGAAACATGTTTCCCTGTACAATGAAATTCTTAC
TTTGCCGTCCACAGTGAAGTCATACACATATCATACACGCATAAATACACACATACATACATACATATAT
ATATATATATATATATACACACACACACACAGAGAGAAAGAGAAGTGACGAAAGTATAATTATGAAATGT
AAATATATAAACATCTATTAATGTAAACAATATATAATAATGAGTAATGTAAACAATGTAAAGCAGTTCT
TAAAATTGTGCAAAAAGTGCCTAGTGCAATTGGCTTATGCGCAAACAAACAACATTATGATGGCCGGAGC
AGATTGAGTATAATTGTATGCATTAATAGTGCAAATTGGATGGAGAATAGTGTGCTACTGAGCAGAAAAT
GAAACCGTTTTGTTCACTGGTTATCCGTTTAAAAGTGTGATCGCTGATGGGGAAATAAAAGAGTTCTCGA
GTGTGGCAGTCCTGCATCACACTCCTATACCTCCGCACTGAGGGTATGAAGCTCTTTTATAAATTTTCTG
TCATATGTTGTAAAATCTGTCTATAACCATTAAGATTTTAGTGTGATTGCTTCTTTTCAAAATCAGGGGC
TACCATGAATAATGGATAAGCTTTTTATTTGTGAATTAATTGTATTTAAATTTACATTAAAAAGGTAAAG
TTTCCACTTAAAATATATTTCTAACATGCAGTTTATTTACAAAAACAAGAAAACGAATCTATGAAGAAAT
ATATATATATTGAGAAAGTGTTTTGAGTTTCAATCAGGTTTCAATGCGTCCACATGCCTAGGATTACTTA
GGGCCCCCAAATCACCAAGTCCGCCCCTGTTGTTGAGGAATGTGAGGGTAAGTTTGGTGTCTCATTAAGT
ACCCTGAAGCAAATGATTGTATCTATATACATAGAGTTTATATAAAATAGTGAAATGTAGGTCACAAACA
TTGACACGAGAAGTCAACAACTGGAGAATGTAACTTACTCTCGCGATGTGTCTCGAGATCAACGCGCGCG
AGATTTTCGGCGGATGTTGATGTTTTGATCCGGACTTCTACCGTCGTTTCTCACTGCGGGCCGTGCGATC
TGCATTACTGCCAATATTTGCGTAAGGTGTGCGAAGCGTTATCTTTCTCGGCGCTTCTTTCGGGAAGCAT
AGAGGCCGAGGCGGAGGGCGATGATGGAGGACTTTGACGAGATTTACGAGGAGGAGGAAGAGGAAGAGGA
GGACGAGGACAGGGCCGCGGAGGAGCAGCTGCTCAAGTACGCTCCGGACCCGGTGGTAGTGCGCGGATCC
GGACACGTCACTGTGTAAGAGACACCCGG