LncRNA Gene

ZFLNCG00387

Basic Information

Chromesome: chr1

Start: 34340769

End: 34346391

Transcript: ZFLNCT00548 ZFLNCT00549

Known as:

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Express profile Download
Express in top 10 samples
Sample Tissue Condition FPKM
SRR1104059 heart kctd10 mut 1950.31
SRR1104058 heart normal 1790.92
SRR1004785 larvae normal 1465.24
SRR941753 posterior pectoral fin normal 1229.33
SRR1049952 embryo transgenic TgOMP-Gal4 and UAS-GCaMP1.6 and treated with gallein 1214.70
SRR941749 anterior pectoral fin normal 1146.30
SRR1004787 larvae impdh1a morpholino 987.08
SRR1004789 larvae impdh2 morpholino 977.37
SRR1569491 embryo normal 817.49
SRR594771 endothelium normal 811.13
Express in tissues
Correlated coding gene Download
gene correlation coefficent
si:dkey-20i20.2 0.54
trim35-39 0.53
cdc42l 0.51
Gene Ontology Download
GO P value
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KEGG Pathway Download
KO P value
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ko04520 1.43e-02
Conservation
Zebrafish lncRNA Transcript Human lncRNA Transcript Mouse lncRNA Transcript Methods
ZFLNCT00548 ENST00000492841; NONHSAT166712; Direct blastn
ZFLNCT00549 ENST00000413759; ENSMUST00000112150; NONMMUT021663; Direct blastn
OMIM

OMIM of this lncRNA gene hava does not exist!

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>ZFLNCG00387
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AAGCTGATGTCACTTGTTCATGGCAAAAAGAACTGTTTGATAGAAAATTGTAAAATAAACCATTCCTAAT
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TACCTTTCCCTCCACTTCAAGCATCATTCCATTCTCAGACTCTTTGATTTTGTAGATGTCTGAGAACATC
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CTACTGGAATGTTTCCAAACCTGAAAATAAAATCAATGACAGATAGTTCTGGAAGTTTCCTCTGATACGT
CACACCCTAGTGTGTGTAAAATACACCACAGAATAACTTTAAACACGTGTAAATTAAATATTGACTATAT
CCTGAAAAACTCAGTTACACAAAGTTAAATAGTTTGCTTGTTTAAGCTTGATGATTACTAATTTAAGTTA
GTTGGTTTATAATTTATTTTAAAAATTCGTCAATTTATTGTGTGATACTAGACGTATCCATTAAAACGCG
TTGCTCTCATTAATTAAACAAAGCACACAAAGCCAAGTGAAAGAGCAGGGTGTGATGAAACATCCTTTCC
TTAAAAAAAGGCTCTGAGAAGCTTAGCGAGTAATGAGTACGTTCAGTTAAAGTACAGAACTGGCCTAGAC
GAGCAACACGCCCTGTTTAGCGCTCATTTCGTCATCCCAAAACCATTTGTGAACATGGAGAAAAGCTTCC
ACCGGCGTATTCAATATTATAGTTTCTGTTGTTTAAAACAATTTTTAAACACATTGCTTGTGGAATTAAA
CATGGTACCCGAGCAGCGTGACTGCGAAAGCAACTAAACGCACAACTTCAGAGGAGCCCTATAACGTTAC
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