LncRNA Gene

ZFLNCG00516

Basic Information

Chromesome: chr1

Start: 47216203

End: 47224064

Transcript: ZFLNCT00741 ZFLNCT00742 ZFLNCT00743 ZFLNCT00744 ZFLNCT00745 ZFLNCT00746 ZFLNCT00748

Known as: ENSDARG00000092950 LOC103909193

Genome Browser
Express profile Download
Express in top 10 samples
Sample Tissue Condition FPKM
ERR023144 brain normal 25.54
ERR023145 heart normal 16.04
ERR023143 swim bladder normal 9.08
ERR023146 head kidney normal 9.08
SRR1648854 brain normal 6.62
ERR594417 retina normal 6.55
SRR1562528 eye normal 6.36
SRR1648856 brain normal 6.17
ERR145646 skeletal muscle 32 degree_C to 27 degree_C 5.61
SRR630463 5 dpf normal 5.23
Express in tissues
Correlated coding gene Download
gene correlation coefficent
pank2 0.82
zgc:136614 0.79
ccdc136b 0.77
oxr1a 0.77
ncaldb 0.77
zgc:193865 0.77
fam13b 0.77
ssrp1b 0.76
si:dkey-109j17.5 0.76
si:dkey-30h22.10 0.76
Gene Ontology Download
GO P value
GO:0090304 2.67e-10
GO:0006396 3.37e-10
GO:0048513 6.45e-09
GO:0044260 3.46e-08
GO:0016070 1.68e-07
GO:0032787 2.40e-07
GO:0044767 3.29e-07
GO:0044712 3.49e-07
GO:0034660 5.18e-07
GO:0043170 5.24e-07
GO:1990904 1.25e-10
GO:0030529 1.25e-10
GO:0044428 2.79e-10
GO:0043229 4.60e-10
GO:0043226 4.62e-10
GO:0044422 8.02e-10
GO:0016020 1.28e-09
GO:0044446 1.67e-09
GO:0043232 1.78e-09
GO:0043228 1.78e-09
GO:0003676 3.71e-10
GO:0003723 1.54e-09
GO:0098772 1.22e-08
GO:0003707 8.18e-07
GO:0030234 9.50e-07
GO:1901363 5.60e-06
GO:0022804 5.96e-06
GO:0022891 8.55e-06
GO:0022857 9.14e-06
GO:0097159 1.30e-05
KEGG Pathway Download
KO P value
ko04020 4.24e-08
ko04713 2.68e-07
ko04921 4.69e-07
ko04922 2.24e-06
ko04724 1.08e-05
ko04710 1.33e-05
ko04745 1.48e-05
ko00120 2.50e-05
ko04726 1.03e-04
ko03010 1.30e-04
Conservation
Zebrafish lncRNA Transcript Human lncRNA Transcript Mouse lncRNA Transcript Methods
ZFLNCT00744 ENSMUST00000125611; NONMMUT042382; Direct blastn
OMIM
OMIM Phenotype
234200 Neurodegeneration with brain iron accumulation 1
607236 HARP syndrome
Sequence Download
>ZFLNCG00516
CTGTCTTTGAGACATATTTTGACGACATATTGTGCAGTAATTTGTCAGACCACATGTAGCTTTGTTTTGA
TACAAACTAGTCGTTTGAGCGAGGATCCAAAAACGTGCGAGACGGAGTGCAAATCTGAGGGATCAGGATC
GATGTGACCTTAAAAGCTTTTAACCTGCTCTGTGCCACTCAGTTACAGCTGTGAAGTTTTGCATGGCAAC
AACCTCGCCGCTCAAAGTAAGGGGCGATCTATATCCGACCAACTTCTTTCAAAAACGAAAACATGCCTTT
AGTTGTGTTCACATATTGTCTCGCTCTCGCATTGAAGTCTTGTTTAATTAAACATTTCGAATAAGAGTCG
TTATTGACTCCTGTAACGCGCGACTTGCCTGTCAACTTTTGTTTGTTGTTTTTGAAGTTCGCTAGTGTTG
AAATCTGCACAGCAACAAGCGCCATGATTGCGTTTGCGGAGTGCCCTAGTAACTGGCGCGCGCGGTTTCT
ATCCAATAAAAGAGCGCGTGATGTGTTCGCAGTTATGCGGTGGAACTGTTTTTCCCAACATCCATACTTT
TCATGGGATTATTGCATTATTATAGAAACTATTTATTTTGACTTACCTCACGTTCTTGACCTTTGGGTGA
CTAGTAAGCAGATGTCGAGGTAAATGGACCAAATGAAGGTACAGTAGGCACATCATGGTCTTCCTATTTG
ATTTTTAATAGCTATATATTCTGATTTAGCTCTAGATTGTTTAATTTGTCATGGAATATATATCTAGTAA
TCACTAGGGAACATGTTTGTAGTGTGAATGCACTTCTAATAACTTTGCCGTTTTCGCCATACTATGATTT
CGGGACGCAGGTGATGCCATTTAGTGAGGTGATCATATATGATTTCGCGGTATGTCATAAATGAGCTTAA
AACAGCAAACAGATGCTAAACAGGAGCGCACTTGCCTGCGTGCCTTTAGTATTTTGAACAACAACAAAAC
CGTTATTTTCAGGGCTGCCCAATCAGATTTCAGGATAACCCTGCGCGCTGCTCAGCTGTGACACTCCACA
TGAGGTTTCTGTGGAAATTACCCGGTAGGATCTCGCCTTACCTGCCAAGAATAGCTCATTCAGAACAGAA
GGGGAAAAAGTTGTGCAGACCTTTAGGGTGCACTATGAATTTCCGCTTCAGAAAGTGGTCAGTGCGTATT
CTAATGTACTGTATTTATGCTCTTGTTCAGTCTAGGGATAGAGTAACCTCAATGACATGAGAAAGAGAGT
GACGTAAGAGCATGAAGAAAGTGACGTGGTCTCTGCCCTATTTTCTCTTAATATTTTTTGGTTCGCTTGT
GGTATCCGTCATGAATGTCATTCGACAATTTTATTGATTTCACTTGTACCTGCTTTTTATTATTATAACG
CGATGTGCAATTGATGTGGATATTTTTTAAAGGATTTTTTATACTATAGAAATAATAAATATATTTTAAT
TAATATAAAGGCAAAACATTTTGCTGTGCTAGAGGCACCAATTATTATTATTATTATTTTCAAAAGTTAT
TGGCGTTAAATAAAGAAAAAAGAAAACAATCGATTACATAACCATAAGTGACCAATCAAAACGACAGAAG
GAATATAAACCATTATATATATTTATTCATGCTGACCTAAAACAATAAGATTTACAATGCATGGCTACCC
ACCAATAACTGGCCCACGTCGTGTAGCAACTGTCATTCAGCATCTAAAGAGTATTAATACGTGCAGTAAG
CGTCGTTAATACACACAATTATAATTAACAGGATTCTGTGGTGCTCTTTTAGAGTTTAAGTAATGTCACT
TACATGCATAAAAATAACATACAGTAGGGTTTGTCTTTAAATCTTGCACGTTATATGTAATATTACCAGC
TGAAGCGTTTGGTCAAGATTTCCATGAATGCTGGGTGCCACAGATGAACTTACATTAACGCTAGTTGATT
GGCAGCTGGAGATCTAAGTTAGTTATTTTATAGTTTAACCGCGTTTACTGTAATGCTGGATTTTGAGCAG
GATCGCTCACCTTCTGTCAGAAATGTGAGATTCAAGACCTGCGCTTCGTCGTTTAAGATAATCAGGGGGT
TTATTTGAATAAATGTTTCAGTTTTTAAATTATGATATTGCATTTAAGTCATTTAAATCTTGTTTGTACT
GAACAACCTATAATTATTTTATTTTGACATATGATTTAAAAACCAGTACAATAAATAAGATGGCCTTAAC
TGGCGAGCGTGCGTGACCGTACATCGAATAAACGGTATTCTCATCTCCACATATGAACAAAATGAAATGA
AGTTGAATCTTAGCTAAAGATTTGTTTAGGGTTGGCACATTTCTTTGATTTTTGCCCTTTCGTGTACCTA
ACAAGGTTCGTGTTTAAAGCTGAAGTGGCCCTAAAAGTTTTAGATAAATTAGCATTTTTACAGTACATTT
TCCATCTTTCACTTGCTTATTTGACACATTTCTGTATAATTAATCCAGACGAAGGCAAACTTTTCTTAAT
CTTGGCCTGGTGGTGGACACGAATTTGAAGAATGGTTTCCTCAGTATCGCCTGAGGAGAAAAACGAGCAT
TTCAACGGAGGGAGTGTAAATATACTTATTATTAACGGCCCTTACCAAGGGAAAGAAACGCGAAATATCA
AAACAAACACCTAAAAGTACCAAAAGGGGCCTGTCTACCGATTAATTCTGTCTGCACCCCTCCCCTAAAT
AATAGCTTAAAAGAAACGGGGGGATCTAAATAAAACTTGAAGCCATTTGAAGTTTCCCAGAAGATGGCGA
TGCTGCGTTATACAAAATGTGAAAATAAAGACGGAGAGTACATTACTGATGTGATGATGCCACAACACTG
TAATACGACACATTTTATCACTCTTCATCGGTGTGCCTCGACCAAAAAGTTAGCAGGTAGAGCTCCGTAA
CGTCTAGAAATGGTAAACATTTCTTCTGAGAAATTATGAATTTGATATACAGCCCATAATTCAGTACATT
AAATAGTCTGTCAAAAAATGATGGTGATTTTAATATTTTTATCTTTATTTTTTATTTCATTTTCAAGTAC
ATTTCATCAACGAGCTCAAAGCACTTATGCAGAAGCATCTGACCCATCTAAAAATCGAATTACAAACAAT
TATACAGCGCATTGGATGTAATATCAGATTTCATGTCATCTGTTCTCCCAGAATAAAAGCATCTAAAAAC
ACAGTCATTAGGCCAGCATGTCATTAGAAAGTCGTTGGTCTTCAAGTGACGAGATGAGGGATCCCGAGGC
CCCCGCAGACGGTAAACGGCCCGCCTAACTCCAGCAGCACGGTCAATACTGGAGGATTCGCAAGTGCTTT
GACTCCAATATTTACGTGCTGCTACAGCCAGGCAGCCAGTCTGTCACACGGCCAAGTTCAGGAGACTCGC
AGGCACACGTAGTCTTGCTGCTGCCGCTGTTGTTTTAGTCTACTTCATCTTTCTTCTCGGTGTTTCACCC
GTTTGAATGGGAAGTGCGCGTCTGTCCTGTCGTTGTTGCCGCAGCACAGTACGGCCTGCACCCCCGTTAT
AACTCACAAACCATTCTGTGCTGCTACAGTACCGACAGGCCCCGCACAGAGCGCGCGCACACACGCACTC
ACGCGAGGCGCGCGCCCACACATCCGCACACACACACACACACGCACGGTTCTCGTTTCGCAACCTGAAA
ACACAGGATCAACACAAAGGGAGAAAGAAGTGTCAATACGGATGCATCTTGTAATTTAATAACCAAAATG
ACATCGAAAAAAGGATCCAAGCTTGCTCAGAACATCTGAAACTAACATTAAAAATAGGAATAAAATACTA
AGAGGCAATTTTAATTGAAATGTGTGACTTCTCCTGGCTTGTGGGCTGTTATGGCTCATGTTTGGTTGTG
CTATGCAAATGCAACATGACATAGATTACTAAGATAAGGATGTATGGAAAAACATACAAAGTGTAACATA
TTTTATTTATTTTTTTAGGTTTCAAGTGAACATCTTTAGTTCGCTCTAAATGGAAACCTGGAAAATTGGC
AGACGTCTGTCCAATTTCAAGGTCATGCATTGTTTTTCATGCTTAAAAGTTTGTTGTGAAATGTGAGGAT
GCCTTTGACAGAGATGACAGTTCAAATATCACATAACTACAGAAAAGCAAACTGAAATTAAATTTTTCAA
TTAAGTTAATCAGATTTAGTAAAAAAGTTTTAAATTAGGGCTTGGTGATATAACAAAAATGCAATCTCGA
TAATTATTTTCCATATTGAATGATAACGATATACATTTTGATATAAGATGTTAATGCCTCCAGATTCAAA
AGACAATCCCAACGATGACTGAAACCACAAAAATAAGAGGGTCCATTAAATGGCATACCATATTTTCAGC
CAATACATTTTTAGTGGCCAAAATATAATTATATCTTGAATGTATTAAATTTGATACATCTCAAAAATTC
AATACATCTCTAATCTCTACATCTCGGTGGCCAAAATTTGATTTCAACACACTTTTTAGATTCCCACTGT
TGCACATTTCTACTGTGTGATTGGCTCTCAGATCAATATAGACTAAAAAAAAGTTCGGAGCTTATAATTT
TTATTGACATCAATTTGATTGCCATTAAATATAATATAACTTATCAGCCCAGCCCTAGTTAAAATATAAA
TATGGTTCCTTGACGGACAGTAGACAATGCATTGAACTCCATTGTGGTATAAATGGGATTGTTTGTTTTT
ACTGTAAGAAGTTCATTGTTAAATGTAAATATATATATATAGTTGTATACACACACACACACACACACAC
ACACACACACACACACACACACACACACACACGAAGCCAGAATTACTAGCCCCCTTTGTATTTTTTCCTT
CTTTTTAAAATATTTCCCAGATGATGTTTAACAGAGTAAGGACATTTTCAGTTTTTTGTCTGATAATATT
TTTTCTTCTGGAGAAAGTCTTATTTGTTTTATTTCATCTAGAATAAAGCAGTTTTAAATTTTCAAAATTA
TTAGCCCCTTTAAGCTATATTTTTTCTCTGTAGTCTACAGAACTAACCATCGCTATACAATAACTTGCCT
AATTACCCTAACCTGCCTAGTTAACTAAATTAAACTAGTTAAGCCTTTAAATGTCACTTTAAGCTGTATA
GAAGTGTCTTGAAAAATATCTAGTAAAATATTATTTACTGTCATCATGACAAAGACAATATAAATCAGTT
ATTAGAAATGAGTTATTAAAACTATTATGTTTAGAAATGTGCTGAAACAATCTGCTCTCCGTTAAACAGA
AATTGTGGAAAAAGTAAACAAGCAGTCTAATAATTTAGGGGGGCTAATAATTCTGACTTCAACTTTATGT
ATGATTATACAACAGATTAAAAAATATTCATATTTTAGGAAATTACCTCAGCAACTTTATTTTAATACCT
TTGGCCCACCACCCTCAATTAATTTTAGTTTTTGGCCCTTCATGAGAAAAAGTTTGGGCACCCCTGGTAT
ATAGAGCTAGAATGCTGAGTTTATTGCCATATCAGCCTCTTTGGCTATGTCATGGCAAAAAAAATAAATA
AATAAAAAAAGATCAAGTTTACCACATTTTATAAATAACACTGTTCTATATTTATTAAATATTCGACAAT
TCATCAACGCATGCCCTGATGTAGCTATTTTTGGGATTTCAAAGATTTGCTCTCAGTTTAATTCTAAACA
TCTTAATATTTTGGCCTTTACCTCATTATTAGCTTGGCATCGTATTCTACATAAGTGAAAATCAAATAAG
CCTCCAACTATATCCCAATGGCTTGTGGATACCATGCATTTTCTAAAGTTGAAAAACGTTCGATGCTCTA
GCAAAACTAATTCCTTTAAAAAGTGGCAAAGTTTTAGAACTTACTTTAACTCTCTTAACATCTTGCCTTC
CATTTTAATAGATGCACTCTCCTTCTATTTTATTTATTCATTCCATAGTATTTACATTTTTGTTTGTTTA
TAACTATTGTTATTTTATATTGTTTAATTGTAAACATTTACTTTCAACAATGACAATGCATCTGAACATT
GATTGGGTTGTAATTTTCTGTACACTTTTATTACTCTTGATTCCATTTTCCCCCTTATTATTATTATTAT
TATTATTAAGTTTTTTGTTTTATTATTATTATTTTTCTTTTTTGTAAAACAACAACAAAGATAAGGGTAT
GTAACTATTTGTAATGAAATAGTTTGTTTTTTCGCAATAAAAATTGAACATAATACTTATTAACAGCTTT
TAAATGTGTAAAATTGCTTCCAAAAAATCATATTAATGTTAAATTCTTGCTTTTTACACTGTTTGTGATC
TTTATATAACCAAATATTTTATATTTTGTTTAATTAACAGCACGTTGCTAATCTGCAGCGATGGGTGGAT
ATGATTGCAGAAGTGCTCTGTGCACAAAATCTTTTGCACACGGTTTGGTCAGTTCTGGTAATATGGTACC
TGTTCTGAGAAAAACGTGATAATCACGCCATTCTTACACAACCTGTCTTTCTCTCACTGATGAAACCACC
GTTATCAGGTAAGTGTGCAGCATTGAAATCCACTGTAGTCAAAGCTTTATTTTATTACATTAGCTTTAAC
AAACCATGATGATAACTTCAGAAAGCCAATGACTTTTCAAAACTCAAGCTTAAAATTGATCCTAAATTTA
TTTGAATATTCAAACAGAACCCACGAGTAGATTCAAATCAGCCGAGACATGCATTTTTAAAGAACTAAAT
GAGTAAGCTAAACAACAAAGTACGCTTTTGTTCTAAATCCTCTTTGAAATGACTCTTACGTAGCGAGTGT
AAGAAATAATTGACATGACTCGTGTGCAAAGTGCAAAATGAGTGGGCTATTAATAACAATCATTTCAGGC
ATGACTAACTTGCAATATTTATCATGTTCTATTTCTGATGTTAGTTGTTTTTGTAAACCCTCCCCCCAGG
TTTCTGTTCCATTCAGCATGTGCTCGTATGCTTTTGTACCAGGTGAGCCCACACTGACAATAAACTTTTG
GAGTCACACAAGCGAGAGGACAGTGAAGCATCTGCTGTCTATAAGGCTAAAATTACAGGTTATGAAAAGA
GGACTTCTGGGAGAACAAAAAAATGAAAAGTGTTCGTGGACAAAAGCTTGTAGCCTCCCACATTATAATA
TTTACTTATGTTGTTTGCTCTGTCTGTATGCCTTTCACCTTTTTTTTTTCTCTTTTGTCAGGTACTTCAT
GAGAATATAGACATTTTTAGGCTATTCTATACATTTCATGCACTACAAATTCACATTTCTTATATTTCTT
TTATAGGCAATAATAAGGTTAAATCAGTGGTGTACTTACAGTCACTTGAGTCTGTCACAGCTCAGTGTCA
TGCCGTGTGCTCTACATTCCTTTCCTGGAGAAAACAAAAATAAAGACATTCATGAAGCACAAATTTGGGC
TTTTTTTGGATTATTTTTGCGTTAGACATACAGTGCTCAGAACTATTGAGTACACCACATTTTGAAAATG
AATATTTTGATCCATTTCTCAGTCTCAGGCTGTGTATTTTGCTGCACTTAAACAAAACAGATTTTTTTAA
CAGATATATGTATTAAAATAATATTTTAGTCACCAAACATATTTAGATATAAAAATATGCAATTCAATTC
AAGCTAAATATTGCAAAAATTAAATGACAACCTACATAATTTCAACAAAAACCTTCAAATTCTTTTGCTT
TTCTTGATTTCTCCTCTTTAAAATTTAATATGTTCTATATCATATAAATTTGGGTGTACTAGTTTGTGGA
CCGTTATTTTGTTAGATAAGC