ZFLNCG00887
Basic Information
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Express profile
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Express in top 10 samples
| Sample | Tissue | Condition | FPKM |
|---|---|---|---|
| SRR748489 | egg | normal | 6.87 |
| SRR1299125 | caudal fin | Half day time after treatment | 6.21 |
| SRR1299126 | caudal fin | One day time after treatment | 6.14 |
| SRR516135 | skin | male and 5 month | 5.80 |
| SRR658539 | bud | Gata5/6 morphant | 5.62 |
| SRR658547 | 6 somite | Gata5/6 morphant | 5.21 |
| SRR891495 | heart | normal | 4.87 |
| SRR658533 | bud | normal | 4.66 |
| SRR1569491 | embryo | normal | 4.62 |
| SRR1562528 | eye | normal | 4.53 |
Express in tissues
Correlated coding gene
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| gene | correlation coefficent |
|---|---|
| prg4a | 0.52 |
| si:dkey-211e20.10 | 0.52 |
| aldh9a1a.2 | 0.51 |
| prkri | 0.51 |
| LOC101885612 | 0.50 |
Gene Ontology
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| GO | P value |
|---|---|
| GO:0015914 | 4.90e-03 |
| GO:0015748 | 5.53e-03 |
| GO:0006869 | 1.89e-02 |
| GO:0015711 | 2.49e-02 |
| GO:0006820 | 3.77e-02 |
| GO:0006955 | 3.91e-02 |
| GO:0019145 | 1.28e-03 |
| GO:0047105 | 1.28e-03 |
| GO:0001871 | 1.92e-03 |
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| GO:0004012 | 2.56e-03 |
| GO:0004029 | 3.83e-03 |
| GO:0005548 | 4.68e-03 |
| GO:0016620 | 4.90e-03 |
| GO:0005044 | 6.17e-03 |
| GO:0038024 | 6.59e-03 |
KEGG Pathway
KEGG pathway of this lncRNA gene hava does not exist!
Conservation
| Zebrafish lncRNA Transcript | Human lncRNA Transcript | Mouse lncRNA Transcript | Methods |
|---|---|---|---|
| ZFLNCT01297 | ENSMUST00000185324; NONMMUT070512; | Direct blastn |
OMIM
OMIM of this lncRNA gene hava does not exist!
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>ZFLNCG00887
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TTATTTGAGTGGACTTTGCCATGACATTGGCAAGAGGGAGAATGAAACCAGCATGCAGAACATGCTTTTT
TTAGCCGACATATTTCAGTGCATCCCTACCTAGAGGCAATGAAATTGACCCACCTTTCTCTTTATACAGT
TTCGTGAGGATGTGGCGTAAGCCTGCTGTTTTGTTCACCCACTCGATTATTCCGCACTCTTCATTTAGAG
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AAGGCACATTTTTACTGGCCAATTTCTCATGAAAATAATTTGGTCATTTCCTAAACAGCATGGGCCCGCT
ACCTTATTAATGAGGCAGTTGAAC