LncRNA Gene

ZFLNCG01163

Basic Information

Chromesome: chr2

Start: 36897683

End: 36903102

Transcript: ZFLNCT01687 ZFLNCT01688

Known as:

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Express profile Download
Express in top 10 samples
Sample Tissue Condition FPKM
SRR797911 embryo prdm1-/- 9.35
SRR797908 embryo normal 7.98
SRR594771 endothelium normal 7.73
SRR594769 blood normal 7.68
SRR527834 head normal 7.43
SRR1205157 5dpf transgenic sqET20 and neomycin treated 1h and GFP+ 7.18
SRR1205160 5dpf transgenic sqET20 and GFP+ 6.76
SRR658543 6 somite Gata5 morphan 6.61
SRR658541 6 somite normal 6.51
SRR1035981 13 hpf rx3+/+ or rx3+/- 6.44
Express in tissues
Correlated coding gene Download
gene correlation coefficent
spon2a 0.65
LOC101884943 0.63
erbb2 0.62
LOC100536673 0.62
wnt5b 0.62
palm3 0.61
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Gene Ontology Download
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Conservation
Zebrafish lncRNA Transcript Human lncRNA Transcript Mouse lncRNA Transcript Methods
ZFLNCT01688 ENSMUST00000191834; NONMMUT079302; Direct blastn
OMIM

OMIM of this lncRNA gene hava does not exist!

Sequence Download
>ZFLNCG01163
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CAAAGTCGGCCCGAGTGAAAGGTATGATATCCGCTCTTGCTTGCTAGCTTCACTTTACTCCTGTGTGGTG
TATTTCTTGAGGCCTATTGTTTTGTAAATTTTCAAATTTTATATTCTTAATGTGTGTAGGATATAATCTG
TTGTTTTTTTCAGCAATGATTTGGTTTAGAACATTTTGAACACTGTATGGCATTCAGCGTTAGCAAAGCG
CTAACTTTAGTTAGCCGTCCAGACGCCGCAGTAGAGATTTTCATCTCTCGTTTTAGTCATGACAATAATT
TGCCAAGACTGTCATTTTAAATAAAGAATAGATGATAATGATAATAATAAGATTTAATGAGTGTATTCAT
GATTCTCTCCGAATACACTGTTCATTTGACTGTCTTTATAAGATAAGGCACAGGTGAATCGATTACATTA
AGAATTGCTAACATATTTTTAGTTTTGTAATAATGTTTATTGAGGTGAACTTGGTTTTACATTTGTTCAT
TTTTGAACAGTGACAACAATCTCTTTTAAAACCTTTGACTAATCAGCATGAAATCAGGTTGAAATATGAC
TTCAATACAGCATTAGCTCTATTTAACTGACTATGAACGATTTTGTACTTTGATAGTCATTGGCTGCTAA
TGTGATTTCACTATTTAGAATCTGCAAAGAATACTTTTTCTGAAATTATATGATTAAGAAGAAAGTGCAT
ATGTGTGAATATAAAACCAACTTTACCATTATTATATGTTTATTAAAACTAGAGCTGCACAATATATATT
TTATATATAATGTTTGTTTCCAAATTGCTTTGTTTGCATTTTTCTTCTAAATGTTTTTATCTGTTTAAGC
AATAATTTTCTCTAAAACTGCTTCTGACCGTGACTTGTCCACACTAAATAGTATGAGACATGTTTGAGGG
ATTATATGCGACATCCTTCATTTGTTCTCTAAGGAAAGGAGAGATCTCCACTTAAGTATCGTACTTTAAG
GGAAAATGTGCTGTATGTAACGTTAAAGTTATTTAAAGCTTGAAGCATTGAAATGTATCAGCCAATTACC
ATGAAGAGGAATCGGTACTCAGTATCTGCTCCAAAAATCCTGATCAGAGTATCCCTATTATTAATTATAT
ATAATTTTCTGTTTATAATTTTTTACAAAGCTGTGTTTTTCTATCACTGCGTAATTTTAATAATTATTGT
GAAAAGCCAGGAAGTTATTATTATTTTGTTTGTAAAGGGGACACGTATGGCTCGGTGCAGGAGAGAAAAT
GCCATTTATAAACGTATGAACAGATGCAAAATAACAAACTTAAAATTGATCTTGTTTTTTTTCTTCCACT
AGACTAAAAAAATTTATCATGAAAAGTCAAAAAATTTGTCTCTTACATTAATGAAAACATTGTCATCTTC
TACAGGGCTGAGTTTCCATCCAAAGCGGCCCTGGATACTCGCTAGTTTGCACAATGGTGTCATCCAGCTG
TGGGATTATCGCATGTGCACTCTAATCGACAAGTTTGATGAACACGATGGTATGAAATAGCTGATCAATA
GCTATGATTCATAGTCATTTTGCTGAGCACTTATGATTTTGTGAATTGGTTTAGGTCCAGTCAGAGGTAT
TGACTTTCATAAGCAGCAGCCTCTGTTTGTGTCTGGAGGAGATGACTACAAGATCAAGGTTTGGTCCTTC
CGTATTGTTTTTAATAAACAAATTTCAATGTTAGATTCCATCATTCAATAAGTTCCCACTGGTATGTCAA
AGCACATTATCATGACTGTCAATGAATAGTACATCGTATTACTAGTATATTTTTACAAATTCATTTTTAA
AGGCATTTGATTTAAATATAATTACAAAAATAATAGAAATTTATCAGCAAAATTTGACTTCCCTTTGACC
AATAAATTAGTTGTCTTCTTTTACAATCCATTTTTGCTGAAATTTATAAAACTGTATATTATTATTTTTA
TTATTTTAAATATGATTATTTTTGTAAGCTGACTATTTAAAAAAACAAGTGGTAAATTAATGTCAATATT
TTATTTAAATGAGACTGTTTGAATGATGAAATTGAACTGAAATTGAGTAAATAAATAAATAAATTTCATA
AATAAATCTTGTTTCTTTTTTAGGTTTGGAACTACAAGCTGCGTCGATGTCTTTTCACTCTTCTTGGACA
TCTTGACTACATTCGCACCACATTCTTCCACCATGTGAGTTCTGTCAACTTTGTGATGCAATTTAATAAT
TTTCAGTAATGTTTACTTAATAAATGCCTCAAGAGATAAACATCTATTTACCTTCTTCAGGAGTACCCCT
GGATCTTGAGTGCTTCAGATGATCAGACTATTCGTATTTGGAACTGGCAGTCCAGGACGTGTGTCTGGTG
AGTTTGTGTAAAGGTTTAGTATAACTAGTGGAAATGCAAAGTATTCTTGCATTTTACAGTTTATTAAAAG
GAAATTGTTGGTTGTCATAGGCTTATTGTACAAGTCACTTAGACTAAAGCCGCCTTTCCACTGCACACAA
CATTTGGACACAACTGTCGGAATACGCTCCCTTGTGGCAGCCGCACTGTATTTTCAGTGTTGTCGTGCAC
CACGGGGGAGAGAAGCTGATTCTCACGGTGTCCGAAATAAAGGAGGGCAAAAGCAAAAGCCTTTATTCTC
TGTGCGTTTACATGGTTTAATGGATGAATGAATACTAGAAACTCATGGACTGCTAAAATATTGGAGGGAA
TGTGGAGACAACATTAAAAATATATTTTCTTATTTCTTTCTTACATTTATGAACAGAAAAGTTTTTCTTT
TAATATAGACTTTTTATAATTAAAAAAATAACCAAATAAACTCATATTTCTCATCTTGCACGCACTGATC
TGCTTGGACAACACTGGAATACATCATATCCGGTCGACAGGTTGCATACGGTCTAGTCGCAGGAGTTCAA
GTATTTCAACGGATCCGCAGTTCAATTCGGATCCGAATTTTCCGCATACGGAGATGATCGGAATTCAACG
CAGCTCCCGGACTGCTCTCCATTGGAAATGAATGACTTCCGGTCTGTTGCTTGTCGTTTGTCGTGTGCAG
TGGAAAGGCGGCTTAATATAGTCGAGTTTTAGCTGTGCGCTGTGAATTTCTTTTTTTAATCTATTCAGCT
GATTTCCGGGTCTGGTGAAAGCACCTAAATTAGTGATGAAAAAAATAAATCATGATACAGATTAGAACAT
TGGCATCTCACTCCCAAAAAGCAAAAAAAGAGTTTTTTATTTTCCTATTTTGGTCATTTTCCTATTTAAC
TACTCTTCTGTTGTGACATGTAATGTTTATTTATATAGCACATTTATTGTGTATGGCCTAAACCCAAAGC
GCTTCACAATCATGAGGGGGTTTCTTCACACCACCACCAGACATGCAGTTTTTTTAGGCTGTGCTCACAC
TAGGTTTAGTTTCATTGAACCGTGCAAAAGCGTGATTTCCCACTAAAGTGGCTAAATTTAAAATTTTAAA
GTTGCTATTTTCTAAGCCAGAACTATACTCTAGGAATAACTTTTCTGCTGTAACATGGCTTGTAGCCAAG
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TATTGCAGCCATGTTACAGCAGAAATGTTATCCGTTTCTGTCAGTCTTGGTACATAATGTAACTACAGAC
AATGTAACCCACATAGCATCTCTGGCCCACACAATCATTTTTTGCTTGGCCCACATGCTGCAGTGATTTA
TGGTACATCACTGGACCAAGTCTGGCTTCCAGACAAGGGCCAAACATGGGCTGTAACTGGCCCAAATCTC
AGCCAAGTTAATAAACCATAACTGGGCCTAAATGGGCCAGATATGTTGATGTATCACGACTGCAATGAAA
TTGATAAACCCATGAAGCATTGTACTTTAATACTTAAAACAATACTGCCTACGATTATGTATACACCTAT
TCATTGTACACATCGCTGTCAACACTGCCAATTTTACATTGTTCTGTTTTTTTGGGAGTATGCTGTTGTA
TGTCGTTGTATTTTGTCTTTTCAATTTTTTGCTGCTGATGATGTGACAAAAAAAGGGATTTGGTTTAATT
TTGATTTAGGCGCACACTATGAGCTTGCTTTTTGCCAAAGCGACCTGATTGGTAGATTTTATTTTATTTT
ATTTTTACATTTTTTTATTTAATTTTTGATTTATTTGATTTATTTTTTATAAAAAAAATTAATTAATTAA
ATAAATAAATAAATATATAAATATATATATATATATATTATTTTTTTATTTATTATTTTTTTTAAATGTG
GGTCAAGATTGGCCAAACATACATGGCCCACATATCAATTATTAACATGTGGGTCAAATACTACATTATC
TATATGGCCTAAGTATTGTGTACCCCCTTAAAGACTGTGTCACCTCTGCCAAACCCAGGCCATGTTTGGC
CCACAAGCTGTATGCCAGTGCTGAATAAATGCCTGATGTGTCAGCTTTATGCCAAATCTGGGCCAGAAGT
CTTTGCTAACTGGGGAGAGTTCAGCTTTAATTAGGACCATTATCAAAACGGGTTCTAAAAAAGTCTAATA
TGATTCAATAATCAAGCTAAGTGTTGTTGTCCGACTCTGAGATCAACAGAATGGATTAAAAAAAACATTA
AAGCCAACTATTTACTCCTCTGTGATTTTTATTTTTTATTTTTATTTTTTTTTTAAGTGTAGTGTTATTT
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AAAAATGTTTTCTCTCAAAGCACTAAAACATTTCTCTCCATCTGTGCTGTCTCTTCTCTGTAGTGTGCTG
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GGTTGGGGAGGTGGGAATGCAGAAAGAGAAGATGGAGGAAGATGAAGGCAGCTTTATGTCATTGTCTTCC
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TGTCTTGTGATTTGATCGATATATCCTTG