ZFLNCG01739
Basic Information
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Express profile
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Express in top 10 samples
| Sample | Tissue | Condition | FPKM |
|---|---|---|---|
| SRR748489 | egg | normal | 167.83 |
| SRR800037 | egg | normal | 111.62 |
| SRR372787 | 2-4 cell | normal | 106.34 |
| SRR748491 | germ ring | normal | 101.20 |
| SRR1021213 | sphere stage | normal | 98.33 |
| SRR1021215 | sphere stage | Mzeomesa | 89.60 |
| SRR372791 | dome | normal | 82.64 |
| SRR372793 | shield | normal | 70.33 |
| SRR748490 | 1 kcell | normal | 66.81 |
| SRR800043 | sphere stage | normal | 60.68 |
Express in tissues
Correlated coding gene
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| gene | correlation coefficent |
|---|---|
| pcmtd1 | 0.74 |
| rdh14a | 0.67 |
| rnf185 | 0.63 |
| pros1 | 0.63 |
| ypel3 | 0.63 |
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| zgc:123177 | 0.60 |
| adipor1b | 0.59 |
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| gatsl2 | 0.59 |
Gene Ontology
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KEGG Pathway
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Conservation
| Zebrafish lncRNA Transcript | Human lncRNA Transcript | Mouse lncRNA Transcript | Methods |
|---|---|---|---|
| ZFLNCT02554 | ENST00000525988; NONHSAT175436; | Direct blastn |
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>ZFLNCG01739
CTGAGGCGTCTTCTGCGCAGTAACTTGCTCGAATTTCGGAAATAGCTAAGTTTGTTGTTGACGAAACGTG
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TTTGTTTGGTTGAGTGCGCTCGATTAGAGACCGCGCAGGCTTCATGCCGTTGAGTTGAGCGCGCTTCTCT
TCTGGCGACAATAACGTTAGCTACGGCGAGCAGCGTTTGTCTTGAAGAAATCGCAAACATCCAGGTGAGT
CCATTGTCATTGCTGTGAATCATTTCAAACGGAGGGAGAAAAAACGGTCCTAACCTGAAAAGGCTCCACG
CATGGATTTATGACCGTATATCATGCTGATTTTGCGTAGAGGCTATATTTACTTGCTCGTGTATAACATA
TTAACGTTAGTTGGATTATGATACATGAATTTACCATGCAACTAGTCGGGTGGGTTGTTGCTGTTCCACG
AGATTTGAAAAGCCCGACTCAGTTCAGTGAGTCGGTTCTTTTGGACAGTTCGTTAAAAAGATTCAGCGAT
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ATAAGGCTGTGAGTAGAGGGAAATCATTCTTCATTAATATCGTGAGCTCCTCAATGTAAACTAATCTCGC
TGTCATCTCTTTTCTGCCGTTATACATGGAGGAAGGCTGTTGTAAATGGTTGGGACGTAGCGTTACGTTT
AAACTAAATTTAGTGGTGCAACACTAAATTATTTAGTTGTGCGTGAGTTGTAACTTAGTGTTCTTTTAAG
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CTGAAGAAAGGCTGCTGCTTACTGGTCTTCATGCTGTGGCTGATATTTATTGTGAGAATTGCCACACCAC
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CATACAGTCTGATCACACTTTGTGGTGTTTTTTTTTCTTCTTCTCTCTACAGGAGCAGGCCTTTGAGTTG
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GAAGCTTTGTATTTAACTTGCTGTCACCGCTTGCA