ZFLNCG03333
Basic Information
Chromesome: chr5
Start: 34950347
End: 34956367
Transcript: ZFLNCT05118 ZFLNCT05119
Known as: ENSDARG00000097904
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Express profile
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Express in top 10 samples
| Sample | Tissue | Condition | FPKM |
|---|---|---|---|
| ERR594418 | retina | transgenic flk1 and develop tumors | 12.66 |
| SRR1569491 | embryo | normal | 9.70 |
| SRR1648854 | brain | normal | 9.01 |
| SRR1648856 | brain | normal | 8.38 |
| SRR630464 | 5 dpf | injected epidermidis | 6.77 |
| SRR630463 | 5 dpf | normal | 6.51 |
| ERR023144 | brain | normal | 6.37 |
| SRR594771 | endothelium | normal | 6.32 |
| SRR065196 | 3 dpf | normal | 6.15 |
| ERR594416 | retina | transgenic flk1 | 6.09 |
Express in tissues
Correlated coding gene
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| gene | correlation coefficent |
|---|---|
| stmn4l | 0.90 |
| phactr3a | 0.90 |
| cnrip1a | 0.90 |
| lmo3 | 0.90 |
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Gene Ontology
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KEGG Pathway
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Conservation
| Zebrafish lncRNA Transcript | Human lncRNA Transcript | Mouse lncRNA Transcript | Methods |
|---|---|---|---|
| ZFLNCT05118 | ENSMUST00000177185; | Direct blastn |
OMIM
OMIM of this lncRNA gene hava does not exist!
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>ZFLNCG03333
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CATCCCCACGTGTCCTCAAAACCCCCACCCTTCATCTCGTTTCCAGCCCCTCTTTGTCCTCGCAGCCCCG
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ATCGACTGTCATCATTTTCTTCCCGAAGTGAGTCGTCATTCCTCTTGTTTTTGCGCAAATGCTCCATCTG
GCTTTCGTTATGTTAAGGGTCATTTTTGGAAACGGACATGCTTTGTGTATTATGTAAAGAATAACATCTT
GCTGGCGTGGTCTGCTGTCTCTAAACATTAGCAAGTTAGCTGAGCTACAGAGGCATCTGTCTGCTTTTTT
AACGCTGAAGAGCCTAATTAGGTTAATGTTCGTCAAAATACGTGTAAATGAGTGTATGTGAATTGATTTA
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ACCACTCCAACTCACTCACTCACACACATTTCAGACTGAACAATGTCTTTTGTGGGTACACATGTCTTTC
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ATCATAATTTTACATTTTAATTGATACATTAATTTGTTTAGTAGATGTATAAACTAATTTGTAAAAAGCT
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TTCAGAGATATTTTTATGCAGATGATTTAACAGCTCAGATAGTGCTTGTAAAATGTTTGCTATAAACTTT
TTTAAAATTTTTAAATGTTTCATGTTAAATTGTATTATTATGTGCTTTTTAAATAATAAAACATCCCTGT
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AATATTTCCTGCCTTATGTACACTAATCTTGGAAGTGTTGCCCATAAGTTTTAGAAACAACAAATAATAA
CTTGACTTCTAGTTGATCATTTATTATTAGAAGTTATTAGAAGTGGCATATATGAAAGCCAATGGTCTCT
AGATTACGCTTATTTTGCCAAAATATAATATGATCATGCCTTGATTTTTAATGATTTGATTAGGATAGTA
AGGTCTGACTTTGTTACTTAACAGAAATGATGTCCAATATAGAATATAAAGTCATGGTGCAGTGGAAAAT
GAATTAATATTGTGGATGACTCCCATGAGCTTGGATGATTGCATCCATACATCTCTGCAATAACTCAAAT
AACTTATTAATAAAGTCATCTGGAATGGCAAAGAGAGCGTTCTTGCAGGAATCCCAGAGTTCATCAAGAT
TCTTTGGGTTCATCTTCAATGCCTCCTCATTCATCTTACCCCAGACATGCTCAATAATGTTCATGTCTGG
TGACTGGGCTGGCCAACCCTGGAGCACCTTGATCTTCTTTGCTTTCAGGAACTTTGATGTGGAGGCTGAA
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AAACCCAAACCATGATTTTCCATCACCAAACTTGACTGATTTCAAAGAGTATTTTGGGTTCATGCGGGTC
TTCTGCAGTATTATATATATATATATATATATATATATATATATTGCTTGCTTGCATCTATGAAATGCTT
GTGCATTTTTCTACATACTTATTGTGTATACAGAGTAGAAACATAGCACTGATGTCGTGTTAGTGATGGA
GGTTCTGGTTGATCAACTAGTTCATGTTTCATCATGACAGTTCTGACTATTCAGATCAATAAGATCATCA
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TGATTCTAAATGTATATTACAATTGTTTATTAAAGTGTTTTTTTTTTATCTTGGATGAACATAAACCTCC
AGAACAAAACAAGGAGTATTTAAAATGGAGCACTTTAAATGTAGACTGAAAAAAATGTCTTGTACATTTT
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ATTACAATTTTTGAATTTTAATAATTTAAAAGAATTTATGGGAAAATAACGCTGTATTGTCATATTTGTT
TAATTTACAGCTTTAAGAAATATATATATTTTACAATTTAATATTTAGCTAATTTAGCATATAACAATTG
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AAATGAAACCCAGTGTTTAATTGATCATGGTAAGTGCTAATTATCACCGTTGTTAAGAAGACGCCTTTCT
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GTCAAAATTTCACTGTGTTAAATATAATTTTAAAGGCAGTTCATGTTCAATTTACAACTAGGAAACTCAT
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TTCACTTACCTTTAACGAAGCCTAAGAAGGAACTTCATTAGCTTCTGATATTCAATCTGTAGATAATGTG
AGTTCAAAGTAAAGTGAAAACTGAGGTGTGGAGCTACATTCTCTGTAGATAAACACAGCTATCTGATAAC
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CTTACTGTTGACCTGGTAAATGTGTCACCTTTTCAGGTAGTCCTCAGTCTCTTTGTGGTCAGCAATGCAC
ACGCTACAACGGTTTGACTCATAATACCTCTGCCTTTTCTTGTATCAATGCATCCTTTTTTGCATTTGTG
TTGTACTCCACCTTGTAATTGTGACTACCTCCAGGCAAGGCTTTGAACAAAGCATTCCTAGGAAGGATAC
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ATTATTAAGCCATGACTAAATTAAACCAGAGGCTCCTCCAAGTAGGTATCGCTGCAGCCTGGAGACCTCC
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TATTTAAAAGTCGAATAAAAACGAAACCATTTAAAGTTAATTTTCTTGCCAGGAAATGTTTTTAAGAGTA
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TAATTTTGTGGTTGCCAAGTAGTAAATCAGCAAACCTAATATGATGTCTCTATAAAAGTGATTCCTTCAG
TAATTTCAGACACAAAGGCGGTAGCGAGAGGCGTTAACCATGCGCTCACAGCAGTGTTGTCAACCAGCGC
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CAGTTCAGCGAGTGCAGAGCTTGTGCTTCCCTTTTGGTCGTCACAGCTTGAGTGCTCGAAATGATCAAAG
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GAAACCCGTACCCCTGCATTGCTAGATTACAGATTGCATGAGGAAGAAACTAGTTACAGGATGATGTTAG
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TAATTTACAGCTTTAAGAAATATATATATTTTACAATTTAATATTTAGCTAATTTAGCATATAACAATTG
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