ZFLNCG03688
Basic Information
Chromesome: chr5
Start: 75024851
End: 75029224
Transcript: ZFLNCT05685 ZFLNCT05686 ZFLNCT05687 ZFLNCT05688
Known as:
Genome Browser
Express profile
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Express in top 10 samples
Sample | Tissue | Condition | FPKM |
---|---|---|---|
SRR519737 | 2 dpf | VD3 treatment | 13.06 |
SRR519717 | 2 dpf | FETOH treatment | 11.71 |
SRR519742 | 4 dpf | VD3 treatment | 8.84 |
SRR1049952 | embryo | transgenic TgOMP-Gal4 and UAS-GCaMP1.6 and treated with gallein | 8.59 |
SRR519722 | 4 dpf | FETOH treatment | 7.91 |
SRR891511 | brain | normal | 6.92 |
SRR891495 | heart | normal | 6.23 |
SRR038625 | embryo | traf6 morpholino | 5.75 |
ERR023144 | brain | normal | 5.69 |
ERR023143 | swim bladder | normal | 5.62 |
Express in tissues
Correlated coding gene
Download
gene | correlation coefficent |
---|---|
LOC556381 | 0.60 |
LOC101886397 | 0.59 |
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LOC101882979 | 0.59 |
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Gene Ontology
Download
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KEGG Pathway
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Conservation
Zebrafish lncRNA Transcript | Human lncRNA Transcript | Mouse lncRNA Transcript | Methods |
---|---|---|---|
ZFLNCT05688 | NONHSAT135491; | ENSMUST00000133808; NONMMUT036290; | Direct blastn |
OMIM
OMIM of this lncRNA gene hava does not exist!
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>ZFLNCG03688
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GTTGTGGTGATTTTACAGTTGCTATGGTAACACAACAACTACTATAGTAATCAATCTGTTGTGGTGATTC
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GTAACACAACAACTACTATAGTAATTGATCTGTTGTGGTGATTTTACAGTTGCTATGGTAACACAACAAC
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CTGTTGTGGCAATACTACAGTTGCTATGGTAACAAAACTACTATAGTAATTGGTCTGTTGTAATGATTCT
ACAGTTGCTATGGTAAATCAACAACTATAGCAGTTGATTTTTTTTTTTGCCGATTCTATTGTTGCTATGG
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TATTGATTGTTTACTAACGATTCTATAGTTGCTATGGTAACACAACATAAACAAAAGACCCAATACTGTA
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TTCACTGCTATGGAGATTCCCATTGGCTGATGCTCCACTCTTTATGCACTCGTCTGTTATGCAGCATGCA
GGCCCGGAGCTCCTGGAAGAGTCCTGTCGGCGGGCCTTCCTAAATCCAGCCCAGACCCACCCATGCCTGT
TATTCCCATCCCACGGAGGGTTCGCTCCTTCCACGGGCCGCACACAACATGCATGCACTCGGCCTGTGGC
CCGGCGCGCACCGCACAGCTCGTACGCTCCAAATACAACAACTTCGACCTGTACCTGAAGTCCCGCTGGA
TGTACAGCTTCGTGCGCTTTCTCCTGTATTTCGGCTGCAGTCTGCTGACCTCTCTGCTGTGGGTTGTGTT
ATCGGCGCTGTTCTGCGTGCAGTATGTCAGCGTGCGTGTGTTTCTCCGACTACAATACAAGCTGTCGGTC
ATTCTGCTGCTGCTGGGTCACCGGCGCCTGGACTTCGCCATCCTCAATGACCTCTTCATCTACAGCATGC
ACATCACCATGTTTCTGATCGGAGGCCTGGGCTGGTGTTTCATGGTGTTTGTGGACATGTGAGCGGAGTT
GTCTTATTAACTAGTGTTTGATTATACACACTAAGGGTTTGTGGATAGAACTGAGAATGTGTTGGAGACG
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GTGTTTGTGGACATGTTTAGGGAAATTATCACTGTGCCGGAGAAGCTCTAGTGTTTAATTCCACACACTG
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CATTCTGTCATCATCTACTCCACCTAAAGCTGGTTTGGTTTTCTATACAGGTCTATCTGGACAAATGTCA
GCAAGTAAACAGATCTCACCGCTCATTTACTCCCATATATACTATAGTTGGAGTAAATGGGTGGTGAGAT
CTGTTTGTTTACTGACATTTGTTCAAATGTGCACCACAAACCCAGTTATAAGTGTCATTTTCTTTAATAA
TGAGGCTTTCTGTTGATGTTTAGTGTGTGAGGATTGGACAACTATTGAAAATCTGCAATCTGAGGCTTCA
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GTCCAAATGTCCACCACAAACCCAGTTATAAGTGTCATTTTCTTTAATAATGAGGCTTTGCATTGATGTT
TGGCGTGTGAGGATTGCACAATATTTGGCTGAGATACAACTATTGAACATCTAGAATCTGAGGGTTTAAA
AAATATCTAAATATTTAGAAATTTGTCTTTAAATGTGTACAAATTAAGCTCTTAGCAATACATATTACTA
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AGACGCTCTTAAAGGGACAGCGCACACACAAATGAACATTCTGTCATCATCTACTCAAACTAAAGCTGAT
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ATATATACTATAGTTGGAGTAAATGGGTGGTGAGATCTGTTTGTTTACTGACATTTGTCCAAATGTGCAC
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TGTGCAATTATACATATTACTGATCAAAAATTAAATTTTGATATATTTATTTACAAAATATAATCATAAA
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TGCTTCCACTTAAGACAAATGGAAAGTACACAGGAATGAAGCGACCTGAGTAGAAGACCCTTAGCTACAG
TTTGAATTTCATCCCATTGTAAAAAATAAAAAACACCATTCAGTGTGTATATTCTTTTTTTTTTTTTTTG
TTCTTGTTAAAGTTTTATACTAATTATACGGACGTGTTTGTGTGCTGTTGTGTTTTGAACAAAGTGTGTA
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GTAACACAACAACTACTATAGTAATTGATCTGTTGTGGTGATTTTACAGTTGCTATGGTAACACAACAAC
TACTATAGTAATCAATCTGTTGTGGTGATTCTACAGTTGCTATGGTAACACTACTACTATAGTAATTGAG
CTGTTGTGGCAATACTACAGTTGCTATGGTAACAAAACTACTATAGTAATTGGTCTGTTGTAATGATTCT
ACAGTTGCTATGGTAAATCAACAACTATAGCAGTTGATTTTTTTTTTTGCCGATTCTATTGTTGCTATGG
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TATTGATTGTTTACTAACGATTCTATAGTTGCTATGGTAACACAACATAAACAAAAGACCCAATACTGTA
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ACACTATGACGAACAGCTGTGGGTGTGTTAAGG