ZFLNCG03688
Basic Information
Chromesome: chr5
Start: 75024851
End: 75029224
Transcript: ZFLNCT05685 ZFLNCT05686 ZFLNCT05687 ZFLNCT05688
Known as:
Genome Browser
Express profile
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Express in top 10 samples
| Sample | Tissue | Condition | FPKM |
|---|---|---|---|
| SRR519737 | 2 dpf | VD3 treatment | 13.06 |
| SRR519717 | 2 dpf | FETOH treatment | 11.71 |
| SRR519742 | 4 dpf | VD3 treatment | 8.84 |
| SRR1049952 | embryo | transgenic TgOMP-Gal4 and UAS-GCaMP1.6 and treated with gallein | 8.59 |
| SRR519722 | 4 dpf | FETOH treatment | 7.91 |
| SRR891511 | brain | normal | 6.92 |
| SRR891495 | heart | normal | 6.23 |
| SRR038625 | embryo | traf6 morpholino | 5.75 |
| ERR023144 | brain | normal | 5.69 |
| ERR023143 | swim bladder | normal | 5.62 |
Express in tissues
Correlated coding gene
Download
| gene | correlation coefficent |
|---|---|
| LOC556381 | 0.60 |
| LOC101886397 | 0.59 |
| megf8 | 0.59 |
| LOC101882979 | 0.59 |
| lancl2 | 0.58 |
| rassf8b | 0.58 |
| asap1a | 0.58 |
| zbtb18 | 0.58 |
| LOC100536316 | 0.58 |
| ephb3a | 0.57 |
Gene Ontology
Download
| GO | P value |
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| GO:0019199 | 1.92e-02 |
| GO:0034596 | 1.92e-02 |
KEGG Pathway
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Conservation
| Zebrafish lncRNA Transcript | Human lncRNA Transcript | Mouse lncRNA Transcript | Methods |
|---|---|---|---|
| ZFLNCT05688 | NONHSAT135491; | ENSMUST00000133808; NONMMUT036290; | Direct blastn |
OMIM
OMIM of this lncRNA gene hava does not exist!
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>ZFLNCG03688
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GTTGTGGTGATTTTACAGTTGCTATGGTAACACAACAACTACTATAGTAATCAATCTGTTGTGGTGATTC
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ACAGTTGCTATGGTAAATCAACAACTATAGCAGTTGATTTTTTTTTTTGCCGATTCTATTGTTGCTATGG
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TATTGATTGTTTACTAACGATTCTATAGTTGCTATGGTAACACAACATAAACAAAAGACCCAATACTGTA
GTTTTTATGACTCTATGGTATATTATACTACAATAGAACAGTTTACTGTAGTAAAACTAAAGTATACTAC
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GGTGGCGTTTCTGACAGGCTCAGTCCAGGAGGGTCAGTGCTGGATAAACCGCTGTGAAATATACCTGGTT
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TTCACTGCTATGGAGATTCCCATTGGCTGATGCTCCACTCTTTATGCACTCGTCTGTTATGCAGCATGCA
GGCCCGGAGCTCCTGGAAGAGTCCTGTCGGCGGGCCTTCCTAAATCCAGCCCAGACCCACCCATGCCTGT
TATTCCCATCCCACGGAGGGTTCGCTCCTTCCACGGGCCGCACACAACATGCATGCACTCGGCCTGTGGC
CCGGCGCGCACCGCACAGCTCGTACGCTCCAAATACAACAACTTCGACCTGTACCTGAAGTCCCGCTGGA
TGTACAGCTTCGTGCGCTTTCTCCTGTATTTCGGCTGCAGTCTGCTGACCTCTCTGCTGTGGGTTGTGTT
ATCGGCGCTGTTCTGCGTGCAGTATGTCAGCGTGCGTGTGTTTCTCCGACTACAATACAAGCTGTCGGTC
ATTCTGCTGCTGCTGGGTCACCGGCGCCTGGACTTCGCCATCCTCAATGACCTCTTCATCTACAGCATGC
ACATCACCATGTTTCTGATCGGAGGCCTGGGCTGGTGTTTCATGGTGTTTGTGGACATGTGAGCGGAGTT
GTCTTATTAACTAGTGTTTGATTATACACACTAAGGGTTTGTGGATAGAACTGAGAATGTGTTGGAGACG
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GTGTTTGTGGACATGTTTAGGGAAATTATCACTGTGCCGGAGAAGCTCTAGTGTTTAATTCCACACACTG
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CATTCTGTCATCATCTACTCCACCTAAAGCTGGTTTGGTTTTCTATACAGGTCTATCTGGACAAATGTCA
GCAAGTAAACAGATCTCACCGCTCATTTACTCCCATATATACTATAGTTGGAGTAAATGGGTGGTGAGAT
CTGTTTGTTTACTGACATTTGTTCAAATGTGCACCACAAACCCAGTTATAAGTGTCATTTTCTTTAATAA
TGAGGCTTTCTGTTGATGTTTAGTGTGTGAGGATTGGACAACTATTGAAAATCTGCAATCTGAGGCTTCA
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GTCCAAATGTCCACCACAAACCCAGTTATAAGTGTCATTTTCTTTAATAATGAGGCTTTGCATTGATGTT
TGGCGTGTGAGGATTGCACAATATTTGGCTGAGATACAACTATTGAACATCTAGAATCTGAGGGTTTAAA
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AGACGCTCTTAAAGGGACAGCGCACACACAAATGAACATTCTGTCATCATCTACTCAAACTAAAGCTGAT
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ATATATACTATAGTTGGAGTAAATGGGTGGTGAGATCTGTTTGTTTACTGACATTTGTCCAAATGTGCAC
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TGCTTCCACTTAAGACAAATGGAAAGTACACAGGAATGAAGCGACCTGAGTAGAAGACCCTTAGCTACAG
TTTGAATTTCATCCCATTGTAAAAAATAAAAAACACCATTCAGTGTGTATATTCTTTTTTTTTTTTTTTG
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GTAACACAACAACTACTATAGTAATTGATCTGTTGTGGTGATTTTACAGTTGCTATGGTAACACAACAAC
TACTATAGTAATCAATCTGTTGTGGTGATTCTACAGTTGCTATGGTAACACTACTACTATAGTAATTGAG
CTGTTGTGGCAATACTACAGTTGCTATGGTAACAAAACTACTATAGTAATTGGTCTGTTGTAATGATTCT
ACAGTTGCTATGGTAAATCAACAACTATAGCAGTTGATTTTTTTTTTTGCCGATTCTATTGTTGCTATGG
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TATTGATTGTTTACTAACGATTCTATAGTTGCTATGGTAACACAACATAAACAAAAGACCCAATACTGTA
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TACTGATCATTATTACAGTGTTTTTTCATGCAGACACACTGAAATACTCTTCACTTATGGCCTGTTTTAG
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CGGTCTCCGGGACGTCAGACGGCGGTTGTGTTGTAGCACAGTTCAGTAACATCTCAGGAACAGCGTTAAA
ACACTATGACGAACAGCTGTGGGTGTGTTAAGG