ZFLNCG04377
Basic Information
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Express profile
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Express in top 10 samples
| Sample | Tissue | Condition | FPKM |
|---|---|---|---|
| SRR886455 | 128 cell | 4-thio-UTP metabolic labeling | 118.75 |
| SRR886457 | 512 cell | 4-thio-UTP metabolic labeling | 102.61 |
| SRR886456 | 256 cell | 4-thio-UTP metabolic labeling | 86.07 |
| SRR1299126 | caudal fin | One day time after treatment | 34.44 |
| ERR023144 | brain | normal | 31.06 |
| SRR1205157 | 5dpf | transgenic sqET20 and neomycin treated 1h and GFP+ | 27.16 |
| SRR1299125 | caudal fin | Half day time after treatment | 24.58 |
| SRR1299129 | caudal fin | Seven days time after treatment | 24.41 |
| SRR1299127 | caudal fin | Two days time after treatment | 24.25 |
| SRR1299124 | caudal fin | Zero day time after treatment | 19.07 |
Express in tissues
Correlated coding gene
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| gene | correlation coefficent |
|---|---|
| zgc:158262 | 0.60 |
| ccdc84 | 0.58 |
| crebzf | 0.56 |
| nktr | 0.56 |
| si:dkey-193b15.5 | 0.54 |
| zgc:112982 | 0.53 |
| si:ch211-165d12.4 | 0.53 |
| snx10b | 0.52 |
| gpatch8 | 0.52 |
| wdr6 | 0.52 |
Gene Ontology
Download
| GO | P value |
|---|---|
| GO:0044699 | 1.96e-03 |
| GO:0000413 | 1.52e-02 |
| GO:0018208 | 1.61e-02 |
| GO:0044763 | 2.34e-02 |
| GO:0051090 | 2.95e-02 |
| GO:0008150 | 4.93e-02 |
| GO:0010008 | 3.44e-02 |
| GO:0044464 | 3.93e-02 |
| GO:0044440 | 4.43e-02 |
| GO:0003755 | 2.95e-02 |
| GO:0016859 | 3.11e-02 |
KEGG Pathway
KEGG pathway of this lncRNA gene hava does not exist!
Conservation
| Zebrafish lncRNA Transcript | Human lncRNA Transcript | Mouse lncRNA Transcript | Methods |
|---|---|---|---|
| ZFLNCT06731 | ENST00000395613; NONHSAT087540; | Direct blastn |
OMIM
OMIM of this lncRNA gene hava does not exist!
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>ZFLNCG04377
AATGTACTGGCAATTGAAGGAAAGCATAATCTGCATTTTACAGCAGCTTTATTAACAAGATGTGCATGAA
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AAGTTTCAGCTCAAAATATCACACAGATAGCTCTCTGAAACGGCCTCTTTTAGACCTTGATCCTAGTTGT
TTCATTTTGGTGACTGTCGCTTTAAATTCAAATGAGATTGAGATGTTTTCAAAAGTGGGCGGAGCTACAC
ATGCCTGTGGCGGCATATTTGCTGATTAAAAACTAGTTCCTATGCTAATGAGGAATAGATGATCACTGGT
GGGCGGGGCTTTCCCCCTCTGACACATACAAAGGGAGAATGTCGATCAAAGTGTTTCTGCAGACTCTTTA
TATCAAGTGTGATTATAAAAATCAGAATTAATAGATTGCTATCATTGGAATCTGGTTGTATTCACACACT
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