ZFLNCG04542
Basic Information
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Express profile
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Express in top 10 samples
Sample | Tissue | Condition | FPKM |
---|---|---|---|
SRR800043 | sphere stage | normal | 18.62 |
SRR800049 | sphere stage | control treatment | 14.14 |
SRR800046 | sphere stage | 5azaCyD treatment | 10.84 |
SRR1021213 | sphere stage | normal | 9.17 |
SRR891504 | liver | normal | 9.05 |
SRR748489 | egg | normal | 8.39 |
SRR1021215 | sphere stage | Mzeomesa | 8.11 |
SRR748490 | 1 kcell | normal | 6.68 |
SRR1621206 | embryo | normal | 5.05 |
SRR800037 | egg | normal | 4.89 |
Express in tissues
Correlated coding gene
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gene | correlation coefficent |
---|---|
si:dkey-179j5.5 | 0.56 |
LOC100331830 | 0.55 |
LOC100331909 | 0.51 |
Gene Ontology
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GO | P value |
---|---|
GO:0030246 | 7.11e-03 |
KEGG Pathway
KEGG pathway of this lncRNA gene hava does not exist!
Conservation
Zebrafish lncRNA Transcript | Human lncRNA Transcript | Mouse lncRNA Transcript | Methods |
---|---|---|---|
ZFLNCT06992 | NONHSAT152289; | ENSMUST00000151268; | Direct blastn |
OMIM
OMIM of this lncRNA gene hava does not exist!
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>ZFLNCG04542
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TGACTGACAGCCGTAGGACTCTCTCGTGGATGGAGTGTGTTAATAGCCTCCGAGAGCACTTATCCGTCTG
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CGCTTGTGGTTCCGTGTGTGGCTGAGAGTCCCGTGATGCAGCACTTCATTTGGGCTGATGACTGCCTTTC
TCATCTGCTCACCAGAATCTGAGGCTTGATCAAATATAGTTGGAACAGAGCAAACTGCAGAGAAATGTTT
TTTTTTTTTAATTTAAAGTTAAATGTGCAAAAAAAAATTCTATTCAAATTTTTGTTTTCAGTAAGTCTTT
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GCCACTCAGCAGAGAGGGCTGCTCATTTTCGGAGTTGTGCTCTCTGTCCTGCTTCAGGAGGCTTTCAGAT
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AAACACAGCCTTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATATGTTATTAGAATTTTAAACCTTTTTTTGAT
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CCACTGTGTTTAAATAAGCAAAGGATTCCGTCAATGATTGACATTGGCAGTCAGTAGGAGGGTTGTTGTT
AACCGTCTGTCATTGTATCTCTCACAGAAAAGCAAATGAAGGCCTGTTGGCTCTCAGTCAGGAGGACACC
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ACATTCAGTGTTTATTAAAGTGTGTGTTGGTTTGCAGTGTCCGGTCTGGGCTTTGGCTTCATGAGCGGTG
CGTTCTCTGTGGTCAACATCCTCTCTGACTCCTTGGGTCCAGGAACCGTTGGCATTCATGGCGAATCCCA
GCATTACTTCATATCGTCAGGTAAAGAGACGTCAGCTTGTGTTTAGGCATGAGGATGGTCTCCAGTGTGA
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GTGGTTTTCTTCGAGGCCTGTGAGCGTCAGAGATGGTGGGCTCTCGGAGCCGTGGTCGCCAGTCATCTAG
TAGTGTCATG