ZFLNCG04569
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Express profile
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Express in top 10 samples
| Sample | Tissue | Condition | FPKM |
|---|---|---|---|
| ERR023143 | swim bladder | normal | 61.40 |
| ERR023145 | heart | normal | 16.88 |
| SRR1205160 | 5dpf | transgenic sqET20 and GFP+ | 14.66 |
| SRR1205169 | 5dpf | transgenic sqET20 and neomycin treated 5h and GFP+ | 12.73 |
| SRR1205163 | 5dpf | transgenic sqET20 and neomycin treated 3h and GFP+ | 12.49 |
| SRR1205157 | 5dpf | transgenic sqET20 and neomycin treated 1h and GFP+ | 11.95 |
| ERR145635 | skeletal muscle | 27 degree_C to 16 degree_C | 11.58 |
| SRR594771 | endothelium | normal | 11.40 |
| SRR1291414 | 5 dpi | normal | 9.42 |
| ERR145631 | skeletal muscle | 32 degree_C to 16 degree_C | 9.38 |
Express in tissues
Correlated coding gene
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| gene | correlation coefficent |
|---|---|
| zbtb8os | 0.57 |
| LOC799923 | 0.56 |
| LOC100537602 | 0.55 |
| LOC793347 | 0.55 |
| si:ch211-193k19.2 | 0.54 |
| si:dkey-43k4.3 | 0.54 |
| si:dkeyp-89c11.3 | 0.54 |
| lrrc2 | 0.53 |
| hoxc3a | 0.53 |
| si:ch211-195h23.3 | 0.53 |
Gene Ontology
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| GO | P value |
|---|---|
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KEGG Pathway
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Conservation
| Zebrafish lncRNA Transcript | Human lncRNA Transcript | Mouse lncRNA Transcript | Methods |
|---|---|---|---|
| ZFLNCT07035 | NONMMUT121867; | Direct blastn |
OMIM
OMIM of this lncRNA gene hava does not exist!
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>ZFLNCG04569
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TTTTATTCCAGTGCAGCTCAAATCCAACATTCAG
GGATGATTCGACTGACTGTGTGGTTCATCTGCCTGGTTGCACTCCTCTTCAACTGCCTGGTCCTTGCCGC
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CTGCTGACTGGGGTCTACGTGGCAGCGCTGACCTTGCTGGACACCGTCACCTGGGGCTCATTTGCAGAGT
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GGAGCTCTGAGGTCCAGGGGTGAAAGAAGGGAAAGGCGAAGGAGGTTTGCTATAGCCGCACTTCTTTTGG
GATTGGTATCTGTTGCAGCGGCCTGTCTTAGTCTGTACCATGGATCAGCCATGGGTTCTCCCCTCTGCCT
GCCCTTCTCTGAAGGCTCCAGTCCTGGCCTGGGGTTTACAGTAGCCCTAGTGCTAATGAACACACTAGCA
TACTTGCTAAGCGCTGTGGTTTATACAAGGTTATACTGCAGACTTGGGCGCGCTCAGCTGGCTGACCCTG
AGCAGGCTGGATCTGTGCGCCACATCGCTTGGCTCATCTTCACCAACTGCATCTTCTTCTGCCCGGTGGC
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TTGTAGGACACATCTAATCGAAAATGGGATGCATTGTCTAACTGTGGAAGCTACCTCTTCAACCGTAGCG
GCTGCCAGTAGAGAGTAGTACATGTGGTTACGTTTTCATGTTTATTTTGTTGGAATGATTGCTTGCGCTG
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CTGTATGCTGACATTTTTTGTAAACCAAACTATATAAACTGATTCGCTTTAAAGATGGGAGTGCTTGTGC
TTTGTTAAGTTTCCATCTTGATGGTTTGTGCTCTTTTGCTTGATGAGGTACATGTGTTGTGTCAGGCGCT
TTTTATTCCAGTGCAGCTCAAATCCAACATTCAG