ZFLNCG05002
Basic Information
Chromesome: chr8
Start: 9482556
End: 9487289
Transcript: ZFLNCT07755 ZFLNCT07756
Known as: ENSDARG00000093019
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Express profile
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Express in top 10 samples
| Sample | Tissue | Condition | FPKM |
|---|---|---|---|
| SRR1562530 | liver | normal | 35.10 |
| SRR1167763 | embryo | ptpn6 morpholino and bacterial infection | 19.43 |
| SRR1291417 | 5 dpi | injected marinum | 18.02 |
| ERR023146 | head kidney | normal | 14.31 |
| ERR594418 | retina | transgenic flk1 and develop tumors | 13.81 |
| ERR594416 | retina | transgenic flk1 | 12.61 |
| SRR700534 | heart | control morpholino | 12.07 |
| SRR1569491 | embryo | normal | 11.00 |
| SRR700537 | heart | Gata4 morpholino | 10.05 |
| ERR023143 | swim bladder | normal | 8.06 |
Express in tissues
Correlated coding gene
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| gene | correlation coefficent |
|---|---|
| id3 | 0.60 |
| txn | 0.58 |
| pla2g12a | 0.57 |
| tnfaip2b | 0.56 |
| si:ch211-87h14.3 | 0.56 |
| LOC560548 | 0.55 |
| cnn2 | 0.53 |
| hmox1a | 0.53 |
| si:ch211-120p12.3 | 0.53 |
| slc12a4 | 0.52 |
Gene Ontology
Download
| GO | P value |
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| GO:0004623 | 8.85e-03 |
KEGG Pathway
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Conservation
| Zebrafish lncRNA Transcript | Human lncRNA Transcript | Mouse lncRNA Transcript | Methods |
|---|---|---|---|
| ZFLNCT07755 | NONMMUT136678; NONMMUT071751; | Collinearity with conserved coding gene | |
| ZFLNCT07756 | NONMMUT136678; NONMMUT071751; | Collinearity with conserved coding gene |
OMIM
OMIM of this lncRNA gene hava does not exist!
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>ZFLNCG05002
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AATGAGAGTCCAAAAATAAACTTTGATGACAAAACATCCTCCCGACGACAGAATGAAAGTAAGAAACGTC
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ATGGGTTTTTGAAAATTCCCCTCCATGTAGTGTGTAACACAGCTCTAAGTGAAGTGAAGTATCCAGCTAA
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TCAAACGAGTCGCCTTGATACCGATTCATTAGGTGTTCCGCCATGACGTACGAACGAAACCAAGTTATTC
ACGTGCACGCGCAAACCCGGGAGATTTCAAACCTGAGGCCCCGCCCTCAAACACACGCACACCCACAAAC
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CGGGAGCGGTCGGTAACGGGTTTAATTTGGGACGGGAGCGGGCTGTCTAGCAATATCACGGATATTGCTA
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AGAGAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGCGAACGAGCTTTGTGTGCTTTGTGCTGTGTGTGTGTGTTTATACAG
ACAGCTTGGCTGTCTGGACTGTATACTGGGTGATTTTTGGTTGTGTTCTCCTCCGCTCTAGCGGGATCGG
GCGCGGCGGGCAGAAAACGGAGCGGGTTCTCAGGCTAAAACCTGGCGGGTGCGGGCGGAAGCGGGAGCGT
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CGGTTATCCGTGGCACTATCCACTCGCCATAGTGTGGCAGCTAAAATCCACGCCTACACTATCGAGCGTG
TATGAACTGTGATTACTTTTTAAATTGCTGATTAGCTATTGGCCATTTCCCTCTCTGACTGAAGGCAGTC
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ACAAATGAATCACTGGACGATTCATACAGGAGTCGCTGGGATAATTAGGTAAAAATAAATGCAGATTATA
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GTTTAGACTATTGCACTTTTTTGTGTTGCCAATATAGGCCTATTGTTGTGTGCAACATTTGTCTATTTAT
AACCACTGCTGATAAATGTCGGGGTCGCTAGTCATCAGCATTGTTCATTAGGGGCTTGGGGGCTAAAAAG
TTTGGGAACCCCAATTAAAACATCCTTAGCATGCAACTCATTTATTTCATTGACAAATGTGTAATTATAT
ATATATATATAATATTGGTTAAAATAGATACAAAATGATCTTAGACAATGTTTGACTGCCATCATTTATT
TCATTTAAAAAAAAAAGCTGTGTATTGAGATGTGGTGGAATTGACATTTGTTCAGTTCACGAGGGAAAAA
AATCCTTCTCTTCTTATCTAAGTTTGTCCTCTTACAGATCTTAAAACTAGATAAATTGTTTAAACTTATT
AGGACTATTAATTTTAAACAAGTGTTTTTTGATCAACTTCACAAGGCTAAAAGTGCCCGTAGTTGAAGAA
TAGCCCATAAACTTGAAATAGTGACTGACACCTGCAGAAACCATGGTTGTGATGTTCAGTTCCACTATGG
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TAAAAGAATATGTGCAAATAAAAATACACACTTTTTTCTTTGC