LncRNA Gene

ZFLNCG05097

Basic Information

Chromesome: chr8

Start: 18750365

End: 18758849

Transcript: ZFLNCT07907

Known as:

Genome Browser
Express profile Download
Express in top 10 samples
Sample Tissue Condition FPKM
ERR594417 retina normal 16.17
SRR1048059 pineal gland light 9.48
ERR594416 retina transgenic flk1 8.33
SRR592698 pineal gland normal 7.42
SRR592699 pineal gland normal 7.24
SRR1562528 eye normal 6.80
SRR592703 pineal gland normal 5.38
SRR1048061 pineal gland dark 4.78
SRR592702 pineal gland normal 4.48
ERR594418 retina transgenic flk1 and develop tumors 3.39
Express in tissues
Correlated coding gene Download
gene correlation coefficent
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lrit2 0.84
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sagb 0.83
nxnl1 0.83
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Conservation
Zebrafish lncRNA Transcript Human lncRNA Transcript Mouse lncRNA Transcript Methods
ZFLNCT07907 NONHSAT009985; Direct blastn
OMIM
OMIM Phenotype
600132 Retinitis pigmentosa 14
610773 Mitochondrial phosphate carrier deficiency
310500 Night blindness, congenital stationary (complete), 1A, X-linked
613843 Leber congenital amaurosis 15
Sequence Download
>ZFLNCG05097
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TCTATAAGGATCACAAATATTGAAAAGAATCATATTTGTATTATAGAATTAACACACAAACTATAGTTTA
ATCAGGATACCACACAGTTTCCCCACTTCAATATTCAAGGTGCAAATATGCTCCTGAAAGAGGTTAAAGA
GACAAGTCCTTACTGTGCGTGAAATAAGTTAAAATGCACATAGATTTTGTCCCACAGTCAGAGAAAAGAT
CTATATCACATTCTTATGAATATAACACTTGTCTTGGTTAACCGTTAAAGCGTTTTCAAGTTTGACATGA
GAGCCAACACTATAATTGCACCATCCAAGGCTGGAAAAAAGGCTTCATGTCTTCTGTAATCGTGCAGAAA
AATAAAAAGTGCCATTTATTTCTATTTCTGGGCATCTTGAACCTTCTCAATTTCCTGTAAATCAAAACAA
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AGAACACTTTTGAGTTTCTCATAGGCTTCTTCCAGGTCATCATTAACGATTACAATATCAAATACTCCAG
GTTCCTTACCTGCAAAACAGACGACAACAACATTGAACCCTTAGTTTAGGAAAAAGATTTGATCTTTTAT
CTTAAATATCAAGTTGCACTTAACAACAAGGGATGAAATTACTTTGGGGTAGACTTGTGTAGCTTTTGTT
CTTATTTTCCAAACACACTTAATTGTTTATTGCTGTTGTTTTTTTGTAAGTATACTAATATAAATTCTCG
TTTGATATCTGCACTACCTGACAAAAGTCTTGTTGCCTATCCAAGTTTTAAGAACAACAAATAATAACTT
AACTTCTAGTTGATTATTTGGTATCAAAAGTGTCTTATATGAAAGGCAAAGGTTTTGAAAGGCTGTTGAT
GTTGCCATCCACTCTGCAGATCTTTCGCATGCCCCCATATTGAATGTAACCCCAACCCTTGATTTTTCCT
TCACCAAACTTGACTGATTTCTACGAGAGTCTTGGGTCCATGCGGGTTCCAATAGCTCTTCTGCAGTATT
TGTGATGATTGGAATGCAGTTTAACAGATGATTCATCAGAAAAATATTTTGCCACTTTTCCAATTGATCA
AATAGAAATCAAGTTATTATTTGTTGCTCTTACAACTGGAATCGACGAAAAGACTTTTGTCAGGAAATGT
ATACTTGGCTCTCATTAAAATGGTTTTAAACCCACTTATTGTTTTAGAAGATGCCATCTTTTTCATATGT
GATTTACACAATAATATTGTCAATTTTATTTTAGCACTGGGTAAATATCATATTCATTCATCTAAGTGGA
AAAAAAAACATGTGCTATCTTCTAAATATTTACTTTTTGGGATAAAAAAAATGGTTCAAAGCTTCAAATA
TTAATGAATAAATAAATACAAATAAAATTACTAAATATTTTATTTATTACTTTAATGTTTTTCTTTCCTT
TGATTTACTTACGTATCATTTGTTTTGATCCTTGCTCCTGGTATTTTTCTAAGTATTTTATTTTATTTGT
TTGAAAGTGTCTTGCACTGTTGATTGTTCCCTGTTTTGAGATGTACAATTTGAAATAAAAACTAAACAAA
AAAATAAAATAAAAAATGCTACTACACAACATTTTGAAAAAACATGGGGAATAAAAGTCTTCTCTCAAGC
AAATATAAATTATTGTAAGAGTTGCGACTTACTGAGCTCCATGTCAATCCTCGCTGCTTCCAGTCGCTTC
TGTAGACTATCCTCTGTCTCCGTTTGTCTGTCCCTCAGACGCTTTTCCTGTAAAACAAAACAAACAAATT
TCTATATTTGAAGACAAATTAAATGCTGTGTATCAGATTATTTTTGATCAGCTGACCAGGATCTCCATTG
AAGGTGGTTGGATGGAGATGTATATGGGGTTCAGATCGGTCTTCTTGATGTTTTTCACTCCTTGTATGTC
AACATCCAAGATGCAGATGAGGTTTTGTGCCTGGACATCCTCAATGGATGATTTGCTGCATGTAACAGAA
AATATGATAGCATTTAAGACAATGTTTCTGAATCTAGGGTATTTTTGAGCATTGGTAAGAAGACCAAGTA
ATGGATAATAAGATATCAATGTCCAAAACGTACCTGGTTCCATACATATTTCCTGAAAACTCTGCATTCT
CAATGAACTCGTCCTTGTCAATTCCTTCTTGCATCTTCTCTTTGGTGACAAAGTGGTAATCTGGGTTGAG
GACGGAAAAGAGATATGTTGTTAAAAACAAAATCATTTTCAGAACATTGTCTGTTGGTCTGTTGCAAGTC
AACATATGGCAAGAAAGTGTATTTATGTAACATAATCTAACCATTAAAACAAATTCAAATAGTATTTGTA
AGAAAGGATTTTCAAAAGATGAGTACACACATACAAAATTTTCATATTTGGTAGATAACAACAAATAATC
TGATAAGCTCACTAGAGGGCGCCAAATAACTGTGATGGTATCAGAAACTGTGCATTGTACAAACAGTATA
TGAGGAGTTTAGATGCAAAAACCTCTAGTGCCATCTGAAATTTTCATATAAACTTTATTACTTTTTCTCA
GGCTGTTGTGTGTAGTTTTAGTATTTTACTCTTGGTGCAAAGAATAAGTTATTTTCATTACCTTTAAATT
TAAATAACATAGGAGGCTGAGAAAAACACAAATTTTAGAGGAAAATTTTAGATGGCACTTGGAGGTTTTT
GCATCTGAACTCTTCATATCTTACTAAACGTCAACGATAGTTTTGAAACTTGAAAAAAATACTACAGCAA
CTACAGTAGGAAATATTATAGTGTTTTTGATCTATAGAAAATTACTTGTGACTTCATACTCAATACTGTA
GTAGTCTACAACTATATTATACCACAATAGCCTACACCACAGTTAATTGTAGTAAAACTAAAGTATACTA
CAGTATTTATTCTGGTTAATTAGTTCACTACAATTAATACTACAGAATGATTGAGTATTCATTACCAAAG
AATTGTACATTCTATAAAATATAGGCCTACAGTATAATACACTTTACCATAGCATGGCTAAAAACACATG
GTATTTACAATAAATTACTATAGTTTTTTTTTCATGTGGGTTTGAATTTTAACTTCATAGAAATGTATAA
TCTTAGAAATCCTCCTCACAAGGCCTATAAGAAATCTGTAATTGGGCTAAAAAGTGTTTTAGGTTACTGG
ATTCATACCATTCTGAAGGCTTAACTCCACAACAGCACTTCAGGGGGAACTAAAGCGGGACAGTAAGGGT
TCTGCAGACAACACAAAACAACCAATTCACAGCTACAGGACAGCAAAACACTGACATCATCCGTGACAGC
TCTGCAATGGAGACAGCCATCGGCATAACAACATCTGTCTGAGGAAAAACATTATGAAACAATGGGCTAT
ATGCACAGCTAGTGTTTTTCAGCCAATGACGAACCTCCGGTGAGAGGTTTATGTGACTATTTTCAATTTC
ATAAGGTTCCTTTTACAGCATGAATGTTGTAATGTAGTTCAAATATAATCTGTTAAATAGACTTAAGCAT
CCCTTTGGTTGTTAAAGCGTAAAAAGAGATGAAAGAATGTTGAAACGCAGGCGCTGTCATTAGCAGCAGG
TTAACTCAGAAATTCTATTGAAAATAGTAGGGTAAAACTAATTTCCACATTTTAGAGACATGGCACAATA
AAAAAAAAAATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA
TATATATATATATATATATATATATATATATATATAATGCAGTGCTTCTTTTTTGGTCTGATTCTCACTT
TATATCATATCTCAGCCAGGCAGTGAAGATAGCTGTTTTTTCAATCAGATCTTAAGCATGGCGATTTTGT
ATTGGAGGACAATAAACCAGAAGCTCTGAGGCTGGCTGACTGAAATTAAAAGCCTGTGTGCATATATCCC
ATTCAACTAGTAATGACTGCTTTCAAGATACTCCAAAAACAAAGCAAAACAAAAAAAAAGATGTCATATT
TATCCTTACTACCTTAAAGTCCTAAAGTATGGTCAGATGTTGTGATGTGAGTTGTCTCTGGCTACGGCTT
GTGATCTAGGGAAGAGCTGCCACAGTAGAACCACTATAGGGAACACAGGGGGCTATTTTCAAACGCTTTT
TACTCCAAAGTGCATTGATGTCAAAGTGAAAATGTGATGTTCACAATCTTAGCTTTGTGATTTTTGGCCT
AGAATGTAATTTGCTTACAAAGTTTGAAGATTTGAGAAAGATGAAAGTAACCCCCATTACTCGCTCATCA
CATTAAATATGCCAATAATCTGCGATAATCAATGATGGAAACCAAATCTACACCTTCAGATGTCACAGAG
GACAGGACGTCCGCTACAGGAAGTAATGTAGCCCCCAGAAGCATTGGGAGACAATTCAGCCCTAGAGAAA
ACAACAAAGGCAATGACTATAAATGTTTGGAAATATATCTAAACAGTTCACTTGGGAGTAAGAAGCATGC
AGCACAATTGTGTGTAATACATTTACAGACTAGAGGGTCTTTTAAACTGGAAGGGAACTATAGGTGAGAA
ATCCTTTCTATTTCGTATTTATTTCTGCTTTTCATTCACTTTCTAATTCGCAAACTAGTAGGCATTTAAT
TAGGTTATTTACTCCTTTCCACTTGTAAACTTATATATCAAGTATTATATTTGTAAAGTGGGAAAATCCT
GGCCTGCCTTTTCCATCTTCCTCTCCCGGCCGAGGATTTCTGGTGGTGTCTGCAGGGGAAAAGAAAACAG
ATCAAGGTAATATAAATACTTATGCGGAATTTTTGCTATTTGGTTACTTGTCATGTAGCTGTCTAGTTTG
TCCATAACGCTGATACATACGAGAGACGCTGAAACCAAAAACCCCTTCATATTCTTTCATGAGTCTCTTC
AACAGGGTGCTTTTCCCAGCTCCTGACGGGCCACTCAAAACTACCGGTCTGGGTCCAGACATGTCGCTGT
GAGCAAGCAAAACAGTTGCCATTTGTATAAACTTTTCAGACTACAGTCTTTTTTGTTCATCATATCTTAT
AAAATTCATATCACATTACAGTGCTCCGCATAATTGAGTACACCTTATTTTGAAAATGAATATTTGTATC
CATTTCTCAGTGAATAGGTAATGTATATTAGTACATTATATTAAACAGATATATTTATTAAAACAATGTT
TTAGTGACAGAAATAGAACAATAATTCAATTAAATTTAAGTAAAATTTTGCAAAACTAAATTACAACCTA
CAAAATTTCAACTAAATTTTCCAATATTTTTTGCTTCTCTTGATTTTTCCTCTTTTTTAAATTTGTATTA
AATATTTTTATATATTATATAAATGTAGATGTACTAGTTATTGGACGGTTATTGTAAGTCATTTTGTTAG
ATCATCTCCAAATATAATATTGTATAGCTTCCTATTAAAAATGTGAATTACAAAATGTAAAAAAAAAAAA
AAAAGTTTTAATTTTAAATATACATTATTTTTTACTGGTTTGGTTCAATATGATTTTAATGCATTTGAAG
TTTTATGAGCTGCCTTTTAAGACCAAAATCTATATAGTACTATTGGGAAATAATGTTACAATTTAGAATA
GCTACTTTTATTTTTAAAATCACGATTTAGCCCAAGATTAAGTTTCTTAATTCTCATGTCATCATTTACT
TACCCAATCCTTGTTTCTTTCTTCTGTTGAGCACAAAAGTAGATACTTTGAACAATGTTGGACACCAGTA
GTCATTTTTAAAAGTATTTTTTTTACACTAGTCAGTGGGTACTAGTTTCCGACATTCTTCTTAGTATCTA
CTTTTGTGTTCAACAGATCAATTAAACCAACTAAAGTTTGGAACCATTTGAGGAGGGGGACTAAAAGGTG
AATAATTTAATTGTTTGGTTGAATTATCCTTTTTTTTTTTTTTTTGAAAACAGTTTAAAAGAATAGCATT
TATTTGTTGAATAAAAGTATTACTTTTTTGATCTGTCTATTAAACTTTTACAGATATAACAAAGTAATTT
TACCCACCCTTACCCTCTAAACAAGATGAAATTATCCAAGAAAGAAAAGAAGAAATAATAATAATAATAA
TTAAAAATGTAAATAAATAAAAATTATTTAAAAACCTGTACAGAATACACATGTACAGTACCTTGATAAC
CCAATATTACAAACATTACAAACAAATACTTAGTTACATTTGCAGTTGAAAGGCCCAAATATTTAGATTG
ACAGTCTGTAGATATACTGACACGCTCAGAAAAAAACTGTAAATGGGTCCCATGTTTCAGAAAAAACCCT
AGTATTACTGTTTATTGTAAACCTGATTTTTTCAAAATGCAATGAAGCTCATTGAATCTCGCAACCAGTT
GTCAAAACTCGGGGAAAGTTTCCATAATCAAAGAATACACCGTCTTGCTAACAGTGTCAAAAATACATGG
GCGTTTGCAGTACAGCTTAATAAATCTGCTATATTTGGAGAAAGTCTAAAAAGTGCAATAAGAGGACACA
GTGTGATGTGCATCTTTGTCACAAAGAGAAAAGTACTAATTTATAATTAATTTTATAAATAGATTTTAAA
ATAAAAACGCAAGACAACTTTCACATAAAAAAGTTGTAAAATGTTTCCTATTTCTTTTGACGTCGAAATA
TTGTGTGTAAATCCATCTGTCACTACCCAACCTCCCAATTACTATCCACATATGTCAACACAGGCAAGTA
CTGTATGTGCATGCCTTTTCTTAATCCCCAAAACATATATGGTAAAAAAAAAAAAAAAACACTTTAAAAG
TTGCTCACAGTGGACTAACAACACATCCATAACTCTCAAAACCCATAGAGAAAATTTCAGAGAGATTTAG
ATTGATACTGTAGTGTGGCGCTGACATGAAGAACTAGACAAGTTGTCATTTTACAAATCATTTTGGTCAC
ACTTTATTTTGATGGTCCGTTTGTTGAATTTAAGTTACATTGCATCTACATGCCAACTAATTCTCATTAG
ATTATAAGTAGACTGTCAGGTTGGGGTTAGGGTTAGTGTAAGTTGACATGTACTTGCAAAGTTTCTTATA
GTCAGTTAAATGCCTGTTGAAAGAGCAGTATCAGCAGATGTTAAGCAGACAGTCTGCTAATGGACCATCA
AAATAAGCTGTTACCATATTTTCTTTTATTAAATCACCTCCAAAACAACAACAACAATAAACGTCCGTAT
GGAAGGTGGATTAGGTAGCTTGTCTTGAGACAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGTGCTA
TAAGCTTGAGAAGCTCACATGGACAGACACTGAGCCTATTGCACACCTGTGTCTCTCCAACAGAGAAGCT
CAGGAACTAATCCACTGAGCCGGCGATTAGTGATTCTGTTTTGAGGTCTGTGGACTAGGCCTTGGGAAGG
AGAACCGGTCAAACAAAATAAAAAAAACTAAATCAAAAATCAAAAAAATCAAAAAAATGACTCTGTTTCC
TGATTTTTTTTTTCCTGTGAATGCAGTTCTATATTAGTATCAAGTCAATAAAGTCATCTTTAAATATGTT
ATATGTTGTTCATATCCCAGATCAGTTAAAAATAAACATTTATGTCTTCATGTCTTTCTGAATACTGCAA
TTTAGCAAAAGCATTACATGATTTACATGCCAGCAAAGGATTTCCATGTTCATGTAAAGTGGTAAGAAAT
TGTCTTAATGAAGTCAGGTTAGGCCAATGAAGAGGATTACGCAGCATAAGCCAAATGACAAAGGCCCAGT
GACCTGAAGCCTGTCTTTTCTACAATGTCTGTTTGGAATTATGTGCGGTACATTTTTAGGGACTCTGCAG
GACACACAATAAACATGCATTTGTCTCCAAGCAGTTTGCTCATGTCGCCTGTACTGTTTATTCAATCAGA
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TCAAGACAACACAGAATAAAAAAAAGTATAACTCAACATAAAAAGAATAATAAAGTACATATGTAATGTG
ATTAAACATATAAAACAATGCAGTGAAATTAGTAAAGGGTCCATTAAAATCCAGTGTATGCACGTGCCCG
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TCAGATGGTGAAGT