ZFLNCG05414
Basic Information
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Express profile
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Express in top 10 samples
| Sample | Tissue | Condition | FPKM |
|---|---|---|---|
| SRR748488 | sperm | normal | 34.60 |
| SRR1562533 | testis | normal | 16.06 |
| SRR516133 | skin | male and 5 month | 4.37 |
| SRR800043 | sphere stage | normal | 4.10 |
| SRR800037 | egg | normal | 4.00 |
| SRR800046 | sphere stage | 5azaCyD treatment | 1.54 |
| SRR1621206 | embryo | normal | 1.47 |
| SRR748491 | germ ring | normal | 1.36 |
| SRR372791 | dome | normal | 1.33 |
| SRR1049814 | 256 cell | normal | 1.20 |
Express in tissues
Correlated coding gene
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| gene | correlation coefficent |
|---|---|
| tdrd9 | 0.51 |
| LOC101884037 | 0.50 |
| org | 0.50 |
Gene Ontology
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| GO | P value |
|---|---|
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| GO:0016887 | 3.81e-02 |
KEGG Pathway
KEGG pathway of this lncRNA gene hava does not exist!
Conservation
| Zebrafish lncRNA Transcript | Human lncRNA Transcript | Mouse lncRNA Transcript | Methods |
|---|---|---|---|
| ZFLNCT08358 | ENST00000414579; | Direct blastn |
OMIM
OMIM of this lncRNA gene hava does not exist!
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>ZFLNCG05414
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AATCATGTGTGTGTGTGTGATCTACGCAATCTATGATTGTTTTTTTTACCAGATTAAAATCGGTCTGCGA
ACATCAGGTCACCTGCTTTTAGGAGTGGTGAGGATTTACTCAAGGAAGACCAGATACCTTCTGGCAGACT
GCAGTGATGCGCTGGTCAAAATCAAAGTGGCTTTTCGTCCAGGTGAATGCAGCTTCATATGTGCTCTGTC
CAGTTTTGAATCTCTCAGTGAATTCAGAATTAGAACTAAATAATATTTGTTTTTTGACCACAGGACAGAC
CGATCTACCTGATGATGCGATGGAGGCCACCTTAAAAACTATTACTTTACCAGAGGATTTCACAGACTTT
GACTCTCAGCTGCCTGATCTGAAGTATTGTGTTTACTACTAACACCACTAAACATCTAATTATATTGATT
TTATCAGATGTACAGTCTTTATGACCTGTGTGGATTGTTATGTCTCGCCTAAGCACCATTGATGT