ZFLNCG06572
Basic Information
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Express profile
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Express in top 10 samples
Sample | Tissue | Condition | FPKM |
---|---|---|---|
ERR023145 | heart | normal | 32.07 |
ERR023143 | swim bladder | normal | 28.72 |
ERR023146 | head kidney | normal | 21.47 |
ERR023144 | brain | normal | 16.12 |
SRR658543 | 6 somite | Gata5 morphan | 6.30 |
SRR514030 | retina | id2a morpholino | 5.91 |
SRR658535 | bud | Gata5 morphant | 5.50 |
SRR658547 | 6 somite | Gata5/6 morphant | 4.83 |
SRR658539 | bud | Gata5/6 morphant | 4.68 |
SRR514028 | retina | control morpholino | 4.58 |
Express in tissues
Correlated coding gene
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gene | correlation coefficent |
---|---|
ppp1r14bb | 0.54 |
LOC100535468 | 0.53 |
prkag1 | 0.53 |
si:dkey-43k4.3 | 0.52 |
rab1a | 0.50 |
Gene Ontology
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GO | P value |
---|---|
GO:0042325 | 2.98e-02 |
GO:0019220 | 3.47e-02 |
GO:0051174 | 3.47e-02 |
KEGG Pathway
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Conservation
Zebrafish lncRNA Transcript | Human lncRNA Transcript | Mouse lncRNA Transcript | Methods |
---|---|---|---|
ZFLNCT10060 | NONHSAT196245; | Direct blastn |
OMIM
OMIM of this lncRNA gene hava does not exist!
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>ZFLNCG06572
ATTGGCCTATTAGATCAATCCCTTCACTATTAAACTTGGCTTGGTAAACAATGTTTGATAACCACCACTA
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ATTGGCCTATTAGATCAATCCCTTCACTATTAAACTTGGCTTGGTAAACAATGTTTGATAACCACCACTA
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CTTTAAGCATAATTTCCATCCATCCAATCCTTCATCACCCTCTTAAAAACACATGGTGTTCTGATCCCAA
GCAAATCATGAGAAAGCACCAATCAGAGGCGTTATTTTAACCTCTTAAGGCTCAAGCTGTTTACTTGTAT
TTTAATTTCTCTTTGCTATTTGGGCTTATTGGAACCTAATTAGAATAAAAATCTGAGTATCATCTTTTGA
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GTGGCATTTGCATGATTTTGCGTTAAACCATCATGGAATTGTGAAATCCCGGAGGGTCCGGCTATTGGCA
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TAAAACATGCTCATTTATCTTAAAGCATCCAGCACTGCAAATCCAAGCCCAAAACAATACACGTCTATTG
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CATGGAAGCATAGCCCTCGTCGTGGCCGCCAGCATCGCGCACCTCACAAAAATATGTATCTACACGTAGC
AACGACGCATAGCGCAAGCTCTATGATTGGTCGCCTTGGTAGCGCCGACGAGTGTGAGAAATCGCACAAT
TAAATCGCTAGTAGAAACTATAAAACGCACACAGACATACTGAATGTTTTAGTACCATAGATTGTTATCT
AGAATGACGCTTCCACTCCACATGAATCTATACATCGTCAGTGGAAGAGAGTAATGTTTTATCCACCAGG
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CTTGCAGTCCCTGGAGATGTGGCCGCCTCTGCCGCAGTTGTAGCACGC