ZFLNCG06578
Basic Information
Chromesome: chr11
Start: 1487399
End: 1494599
Transcript: ZFLNCT10071 ZFLNCT10072 ZFLNCT10073
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Express in top 10 samples
| Sample | Tissue | Condition | FPKM |
|---|---|---|---|
| SRR1205151 | 5dpf | transgenic sqET20 and neomycin treated 1h | 179.18 |
| SRR1205157 | 5dpf | transgenic sqET20 and neomycin treated 1h and GFP+ | 151.39 |
| SRR658537 | bud | Gata6 morphant | 151.24 |
| SRR1205154 | 5dpf | transgenic sqET20 | 150.50 |
| SRR1049946 | embryo | transgenic TgOMP-Gal4 and UAS-GCaMP1.6 and treated with DMSO | 146.90 |
| ERR594416 | retina | transgenic flk1 | 136.97 |
| SRR658539 | bud | Gata5/6 morphant | 135.75 |
| SRR658535 | bud | Gata5 morphant | 129.79 |
| ERR594417 | retina | normal | 127.52 |
| SRR1205160 | 5dpf | transgenic sqET20 and GFP+ | 125.68 |
Express in tissues
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KEGG Pathway
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Conservation
| Zebrafish lncRNA Transcript | Human lncRNA Transcript | Mouse lncRNA Transcript | Methods |
|---|---|---|---|
| ZFLNCT10073 | ENST00000414124; | Direct blastn |
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>ZFLNCG06578
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GTTTATTGGATATTGACCGAGGATAAGCATGCCGCGGGTGTACATCGGCAAGCTGAGCTATCATGTGCGG
GAGAAGGACATCCAGAGGTTTTTTGGCGGCTACGGGAAACTCATGGAGATCGATCTTAAAAACGGGTGAG
TTTGAGGGTGGACGGGAACGCGCGGTGCGGCCTCGACGCAAACACCAACTTCACTAATTAACGTTACATA
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TGTAAGTTAGTAAACTGGTCGTTGAAGGTGCTGACGTGACGTTTTTTTTACGCGCCGTTGTTTACTTGGC
GCTCGCGTTATTAATGCACCACTTTAGTATTATTAGATGTTTACAAATGCACCTGAAGAAGAATATCACG
ATTCGATCAACTGAAGCACTAGTGTATGTGTATTATGGGGCTCCGTGCACAGTTGCTCTATGCAAGAAAT
ACCCGGATGCTACATTGTGTTGGCCTTTACAGCAGTTGAATGCACATTAAAGGGGGAACGTTAACGTTAG
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CAGCTAAAACCAGCTTGACCAGCCTGGTTTAAGCTGGAAATAGCTGGTTTTGTCTGGACTCTCATCCTGG
CTTGGCTGGATTTAGCTGGTCATTTTCCAGCCTGAAAATTACGATCGCAATATATATGTCTATGAATAAT
ATCTGATGGCCAGAAAGTGATTTATTTTTTTATAAATAGTTACAATTTTGATATTTGTGATGCAGCAAGC
CCAGAGATTGTTGTGTACACTATGACTTTATATATAATTAACTTTAATGTGTGGTATGAATAAAGGCCCG
TGCACACAGAGATGTTTTTTGCTCGCATTTTCCGTCGACGTTTAACGCCTCGCGACTAAATAGCAAGCGT
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ACGTGCACAGAGCTGCTGAAGTTACAGTAAACAGCACCTGGAGGCGCTCAAGAGTTCTGATTTGAAATGT
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TGGGGGTTATGGGGGCTTCGGGGGCCGCAGTAAGTTCAGTCTCATTGATCTCTACTGTAAAACTCTGCTC
TCCTCCTTTTTTCCTCAGGTTCAAGGAAAAAAAGAGGAAGTGAATAACTGTTTCCTTAATTTACAGAAGC
GCCTGCGTCCAGTGACTAACCGAATTTCTCTGTTAAAGTGTGCAGTGCCTGTCTTCTGGATGGACGCCGT
TTAGGATCTAATGTATTTAATTGCCGACGGTCCTACAATGTGACCTTTTGTAAAATGGGGATTTCCTCCA
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AACATCAGGGAGAGTGACTAACTAAAGATGTTTACATGTCAGACGGCGGGCTGTTTACTCACTTTCTATT
AGTCCAGCTCTAAATCTATTCCTACCAATGGATTGAGCAATTGATCTATATTTGATTCCTACAGCCTCGC
TGGCATGTAAACAGTATGACGTGTGACGATGCGATATTGTGTTTACATCTGAATTCAACATTAACAGAAG
TCCTTGATGTTTCAATTTAAAAGAGTCCGGTGCGGGCTGAGTCCGAGTCCATTGAGGCTAAGATGACTGC
CTGTCCCGTTTGGCCTTGGCTTTCACCTTACAATGTGTGTGTGACCTTTGCCCTTTGACCCTTGGCTGAC
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TTTTATGTTGAACGAAATATTGGTCAGGTTAAACTTTATGTAGCCACCCGCTAGTTTTTCTTTTTTTTTT
CTTTTCTTGTATTAAAAAGAGCAATGGGCTTCCCTTGCTATGTCTTGTGCTGTCGCTGTTCTGTCACTAG
ACAGATAACATGTCAGCATCCGATGTAAGTAGTCCTGGTTATTTATTTCTAAGTGATTATAATACATTTT
TGTTATTTTCATGTGCACTCGTCTGTAAATTTGGGGCTCACGTTAAACCTGTGCCGCCTCTTGTGTCGCT
GGAGCGGTTATTATATTGCTGTCGGGTGAAGACCAGCAATGCCTGGACCCTTTCAGAGCGACCGATTGAA
CGGCAAATGTCAGGATTTCTTTTGTTTTTAATACTCCACAGTAATTGTTCCCTACAGAACTATCCTGGTC
TTATTTGGGTGTGATTTATATTCGATGGGGTGGGCTAGGCAGACTTCATTTTCTCATGCCTGAACTTGGT
GCTTTATGATGTCTGAAGAGGTGGCCTTGTGTGCGCCCTTTGGATAGTGCTTAATTCTGTGCTAATTGAT
CTTTTGGCTTTTGTCTGAAGGCAATAGTGGTTATAGCAGCAGGAGCCGAAGCGGAAGAGACAAATATGGC
CCTCCGGTTCGCACAGAGTACCGGCTGATCGTGGAGAACCTGTCCAGTCGCTGCAGCTGGCAGGACCTTA
AGGTAAGGCTTTCTTTTGAAGTAAATGTTTAATCATTTTCTCTTAGTTGAAGGGATAGTTAGGCGCCTCA
CCATTTACAGTTTGAGTTTCTTTAATCTATTCTAACAGAAAAGATTTTTTTTGCATTACATACAGTAACT
AGATTATTAAAGTTCGTCGAGACAAACTTTAAGGCTGGCTTGACAAAGCCTGTTCATAATAGTTTATTTA
GTTTAAAACAGTTTGAAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAG
ATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAAAAAAAAAGTTTGAAAGTACAGACAGATAGGTAGATTCAATGT
TAAGTCAATGACTGTCACTTGCAATGGAAGTCTATGGGACGGTTGCTAGGGTGTAGTATCTGGTTGTTAG
GGTGTGGCTAGAAAGTTAAAAGGCCACCAGTGATTGGCTGCTGGCTAGACTGAGTTAAATGAGCTCAGCC
ATTAGTCTGTAGGACCGTCTGATGCAGAGTTCTAAGCTCACAAATTTCGATCCAATGTTAAGTCAATGAC
AGTCTTTTGAATGGAAGTCTATGGGACAGTTTCTAGGGTCCAAATGTGGTTGCTAGGGCGTGGCCAGAAA
GTTAAAAGCTCATCAGTTATTGGCAGTTTGGTAGTCGGAGTTAAATGAGCCCAGCTAGAAGTTTGTGTGA
CAGTCTGACGCAGAGTTATGAGGTCACAAAATTTGCTCCAGTGTTAAGTCTATGGGATTTTTCTGACGAT
CCCGGGACGTTTTTTGGACAACCAAAAGTCTGATCAGTCAGAAAAGATATAGCAGAGTCAGACCAGTTTT
GTGGTCATAGCTTGAACGCTCTAGGAGGAGATAGAATTGCAAATTTAGTCTCAGAAGAAGAATAATAAAT
AAATAAAAATATTAAGTTTAGAAAGGATAACAGTAGGTTGGCTTTGACAAGCCAGCCGAATTAAATACAA
TTCTGTAGCTTCTGGTCAACTATAAATCAGGCTTAACCTTGCATATCCTGCGACGTGACTATTGCAGATG
TGCACGTAGCAGTATCGATGCTGAAACTGTATATTGTGCAGCACTAGATTGCATCAGTGATTTAATGGAT
TTTTTTGACTACAGGATTTCATGCGTCAAGCTGGAGAGGTGACCTATGCTGACGCGCACAAGGAACGGAC
CAATGAGGGCGTGATTGAGTTTCGCTCCCACTCTGATATGAGGAGAGCTTTGGACAAGCTGGACGGCACA
GATATCAACGGCAGAAAAATCCGTCTGGTAGAGGACAAACCTCGCCGACGCCGCTCGTACTCTGCGAGCA
GATCAAGGTCAGACTCAGGGGGGTCGTAAATTTCTCTCGTGTTTTATCAACTTTTAATACTTTAAGACCC
TTAAAGTATTAAAGTCCTAAATACTGTACAAGGTGTTAAATTTAGTAAAAAAAAATGTATGCAGTGTATA
GTTATATGCTAAAGTTTGCCTGAATTTAATCTGAATATTGTGATGCTGTGCAGTTTCTATGCTGTTCTAT
AAGCGCCCCCTGCTGGATAAGCACTTATTTAGTAAATCAATGTTTTAGTTAAGGATTTGTTTTTTTTTAT
ATAATTAGCATTTTAAATATACTGTAAGTATAAATAGCATAAGTATAATAGTGCAATGTTACCCGTTGAA
ACCTAAAGTGGCGATGAGGTCTTAATGTAAAAAGGGTCTTGTTGAACTTCACTGTCTGATTTCTGTTGTG
TATCTTGCTTTAGATCTGACATATGTGTTTTTAATCTTCATTGGTTTGATCTGATGATTTGTATGTTGTG
GTTTGCAGGTCTCGTAGCAGACGCCGCTCTCGCAGCAGGAGCCGCAGGAGTTCACGAAGCCAATCCCGCT
CCAGATCTCGGTAGGAAGACCCGTATTTTTATGCAGTGTTCCTTTTTGACAGGGATGGGCAAACTTGGTC
CTGGAGAGCTGGGTGTCCTGCAGAGTTTAGCTCCAACCCTAATCAAACATACCTGCCTATACACTGTAAA
AAATAAATAATTAAATAAATAAAGTGATAAAAATGTCAAGACAACAAATATTTGTATGTTGCGTCAACTT
ATTTTAAGTTGAGTTATACAAATTTTGTTGTGATATTTTTAGTCAGTTTTATTGACGAATGTTGAAATGA
CTAAAAACAAAAAAAGATAAAGCAAGATTTTTTTTACCGTGTAGATTTCTAGTGATCTTGAAGACACTGA
TTTAGAGATCTGCATGGGACCAAACTTCTAGTCTTGCTCCTGCCAGGTGTTATTCCGCACCCGACTGCTC
CCGCTGTATATTCAGCCTTTGTTCACCCGCTGCCTGTTCTGTTTTCTACCTGACCTGACTGTTCTCGCTA
AATTTAGATCTGGTTTCCAAAATCTCACTTTAAAATTGGGCATTACCAAAACAGAGAGACGGATAACGGG
TATAAGTGTTGGTTGTGTTTGGATAGTAGGCTAAATGCCAGTTTTGTTTACCCCTTTGTGATGAGACATG
AGTGCCATGTTTGTGGCTGGTGAGGCACTGACTCTTTCAAAGTCACCCTAACTACCGATTGTGTTTCATA
TTTCATATCAGCAACACACATAGCAGCTGCAAATTGGGACAAGGCAGAATGTAAAATGTACAGCGATTTA
AATATGCCTCCCAAAAAAAACACCCAGCTGGATGTTACAGAGGCCAGACATCCTATAACAGGCGACACAC
AGTACCACGGCAGATGCACGCACTCTTTCAGGAACACTATATTGTTAGACTATCCGCTCCGGTTCAAATT
ACACTGCAGTTACCGAGCACTATCGCATTTTAATCTGAAATTTATTGCCGCACCACAAAAAAATCTGCTC
TGGTCCCGAGAACCTCAACACTGATTAGCATGTTCAGGTGTGTTTGATTAGTGCTGGAACAAAACCGTGT
TGGGTAGAGTTTGCCCATCCCTGCTCTGTTAAACTGTTAAACCTTTTAAAACTGCATTTTTGACCTGCAT
TTCAGGCAGAATGTTTTTTTATATAGTTTAATACATGAACATCCAACTGAAAAAAATCTTCTTTTATTTA
TTTTTATAGTGTCATTGTTAAAAACCTGGCTTATTTTAAAGTTTGGTACTAGAGATAGGAAAAAGAGGGA
ATGGTTGTTTGTATGTTTTGTTTATTTAATGATTTCCAACAAATCTAACACAATACGCATAAAACATGCC
CCTAAATAAAGGTCTGAGCCTGTATAACATGCTTGGTGCGTCACAAATTACCGTGATTTTTAGCTTGGCC
CAAAGCAAAACTATCCTATATAGTAAACCATACTTTGTAATGCAATTATTATTTTTAATCAGAATAAAAT
TGTATTTAACTAAAATCAAGATTATTTAAAGTTCGAACAAAAGTTAAAATGTACTTTTAGGAAAAATGCA
GTTTTTTAACTGTAATAAAGTTATTATTATTGTTATTATTGTTATTATTGTTATTGTTGTTATTATTATT
ATTGTTATTATTGTTGTTTATTATTGTTATTATTATTATTGTTATTATTATTATTATTGTTATTATTATT
TGTTGTTGTTATTATTATTATTATTATTATTATTATTGTTATTATTTATTGTTGTTGTTGTTATTATTAT
TATTATTATTTAAGTTGTTCAATGAATACTTTCTTCAGTCTAGCCTTTTTTTTTTTTTTGTCTTTTACAG
CTCAAGGTCTCGCAGCAAGCACTCCCGATCCAGATCCGGTCGCAAATACCGCTCCAGGTCCAGATCTAGT
AGAAAGTCTCACTCCAAATCTCACTCCAAGAAGTCAAAGTCTCGTTCTCGCTCGCGTACAGAAAAGTCCC
GCTCTCGCTCCAGGAGTCGCTCCAAAGCAAAGTCCGAGAGGGATTCAAGAAGCCGCTCCA
GTAGCCTAGGCGCTTGCTTGGTGGCCATTCCGAAGAGCGTTTAATCCACAAGGGTTTTGTTTTTGCCTTT
GTTTATTGGATATTGACCGAGGATAAGCATGCCGCGGGTGTACATCGGCAAGCTGAGCTATCATGTGCGG
GAGAAGGACATCCAGAGGTTTTTTGGCGGCTACGGGAAACTCATGGAGATCGATCTTAAAAACGGGTGAG
TTTGAGGGTGGACGGGAACGCGCGGTGCGGCCTCGACGCAAACACCAACTTCACTAATTAACGTTACATA
TATACGTTAATTGATGTCCTATGTAGATTATTTGGGGAATGTTTTTATGTTTATACAACGATAGTAGTTT
AAATGCTTAATGTTGTGTTTTAACGATTGTAAGTTTATATTAATTTCCTTCGAGCTTAGGCTTTTACCGC
GTGCTCAAAATGGCGGATTGTTTGTGTACAACCTCGTTTATCCTGAAAGTAGTAAGACTTTTGAACTGGT
CACAGATTCTAATGCTGAATACGGTTGGTTGATTAATAGTTAACTTAATCAGCTGATGTTATTAACGTGA
TGTAAGTTAGTAAACTGGTCGTTGAAGGTGCTGACGTGACGTTTTTTTTACGCGCCGTTGTTTACTTGGC
GCTCGCGTTATTAATGCACCACTTTAGTATTATTAGATGTTTACAAATGCACCTGAAGAAGAATATCACG
ATTCGATCAACTGAAGCACTAGTGTATGTGTATTATGGGGCTCCGTGCACAGTTGCTCTATGCAAGAAAT
ACCCGGATGCTACATTGTGTTGGCCTTTACAGCAGTTGAATGCACATTAAAGGGGGAACGTTAACGTTAG
TTCACCCAGAACTGAAAATGTATAATTTACTCGCCCATTCACCTGTCTTGTTCCGTACTGGCTTGACTCA
ATATATTCTGTTGAGCACAAAAGAGTATATTTTTAAAAAGCAGGAACTGGTTAAAATTGCCTGCTGAAAA
ATCCAGCTTAAACCAGCCTAGGCTGGATTTATCTGATTGACCAGCCTGGTTTTAGAAGGGTTTTGGCCAT
TTCCAGTCTGGTTTCCAGTAATTTCCAGCCTGGTCTTAGCTGGTCAGGCTGGAAAATGACCAGCTAAATC
CAGCTAAAACCAGCTTGACCAGCCTGGTTTAAGCTGGAAATAGCTGGTTTTGTCTGGACTCTCATCCTGG
CTTGGCTGGATTTAGCTGGTCATTTTCCAGCCTGAAAATTACGATCGCAATATATATGTCTATGAATAAT
ATCTGATGGCCAGAAAGTGATTTATTTTTTTATAAATAGTTACAATTTTGATATTTGTGATGCAGCAAGC
CCAGAGATTGTTGTGTACACTATGACTTTATATATAATTAACTTTAATGTGTGGTATGAATAAAGGCCCG
TGCACACAGAGATGTTTTTTGCTCGCATTTTCCGTCGACGTTTAACGCCTCGCGACTAAATAGCAAGCGT
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AATGCTCGGTTTTTTGTTTTGACGCGCCGCGTCAAAATCTTCTCCACCAATCAGATCGGCACTTTTGCTC
ACGTGCACAGAGCTGCTGAAGTTACAGTAAACAGCACCTGGAGGCGCTCAAGAGTTCTGATTTGAAATGT
TTCAGGTATGGGTTTGTGGAGTTTGAGGACACCCGTGATGCAGATGATGCCGTGTATGAGCTGAACGGTA
AAGAGCTGTGCGGGGAGCGTGTGATCGTGGAGCATGCCAGAGGACCGCGCCGGGACCGGGATGGATATGG
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TCCTCCTTTTTTCCTCAGGTTCAAGGAAAAAAAGAGGAAGTGAATAACTGTTTCCTTAATTTACAGAAGC
GCCTGCGTCCAGTGACTAACCGAATTTCTCTGTTAAAGTGTGCAGTGCCTGTCTTCTGGATGGACGCCGT
TTAGGATCTAATGTATTTAATTGCCGACGGTCCTACAATGTGACCTTTTGTAAAATGGGGATTTCCTCCA
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TCCTTGATGTTTCAATTTAAAAGAGTCCGGTGCGGGCTGAGTCCGAGTCCATTGAGGCTAAGATGACTGC
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CTTTTCTTGTATTAAAAAGAGCAATGGGCTTCCCTTGCTATGTCTTGTGCTGTCGCTGTTCTGTCACTAG
ACAGATAACATGTCAGCATCCGATGTAAGTAGTCCTGGTTATTTATTTCTAAGTGATTATAATACATTTT
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GGAGCGGTTATTATATTGCTGTCGGGTGAAGACCAGCAATGCCTGGACCCTTTCAGAGCGACCGATTGAA
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CTTTTGGCTTTTGTCTGAAGGCAATAGTGGTTATAGCAGCAGGAGCCGAAGCGGAAGAGACAAATATGGC
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CCATTTACAGTTTGAGTTTCTTTAATCTATTCTAACAGAAAAGATTTTTTTTGCATTACATACAGTAACT
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GTTTAAAACAGTTTGAAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAG
ATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAAAAAAAAAGTTTGAAAGTACAGACAGATAGGTAGATTCAATGT
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GGTGTGGCTAGAAAGTTAAAAGGCCACCAGTGATTGGCTGCTGGCTAGACTGAGTTAAATGAGCTCAGCC
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AGTCTTTTGAATGGAAGTCTATGGGACAGTTTCTAGGGTCCAAATGTGGTTGCTAGGGCGTGGCCAGAAA
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CAGTCTGACGCAGAGTTATGAGGTCACAAAATTTGCTCCAGTGTTAAGTCTATGGGATTTTTCTGACGAT
CCCGGGACGTTTTTTGGACAACCAAAAGTCTGATCAGTCAGAAAAGATATAGCAGAGTCAGACCAGTTTT
GTGGTCATAGCTTGAACGCTCTAGGAGGAGATAGAATTGCAAATTTAGTCTCAGAAGAAGAATAATAAAT
AAATAAAAATATTAAGTTTAGAAAGGATAACAGTAGGTTGGCTTTGACAAGCCAGCCGAATTAAATACAA
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TGCACGTAGCAGTATCGATGCTGAAACTGTATATTGTGCAGCACTAGATTGCATCAGTGATTTAATGGAT
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GATCAAGGTCAGACTCAGGGGGGTCGTAAATTTCTCTCGTGTTTTATCAACTTTTAATACTTTAAGACCC
TTAAAGTATTAAAGTCCTAAATACTGTACAAGGTGTTAAATTTAGTAAAAAAAAATGTATGCAGTGTATA
GTTATATGCTAAAGTTTGCCTGAATTTAATCTGAATATTGTGATGCTGTGCAGTTTCTATGCTGTTCTAT
AAGCGCCCCCTGCTGGATAAGCACTTATTTAGTAAATCAATGTTTTAGTTAAGGATTTGTTTTTTTTTAT
ATAATTAGCATTTTAAATATACTGTAAGTATAAATAGCATAAGTATAATAGTGCAATGTTACCCGTTGAA
ACCTAAAGTGGCGATGAGGTCTTAATGTAAAAAGGGTCTTGTTGAACTTCACTGTCTGATTTCTGTTGTG
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CCAGATCTCGGTAGGAAGACCCGTATTTTTATGCAGTGTTCCTTTTTGACAGGGATGGGCAAACTTGGTC
CTGGAGAGCTGGGTGTCCTGCAGAGTTTAGCTCCAACCCTAATCAAACATACCTGCCTATACACTGTAAA
AAATAAATAATTAAATAAATAAAGTGATAAAAATGTCAAGACAACAAATATTTGTATGTTGCGTCAACTT
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CTAAAAACAAAAAAAGATAAAGCAAGATTTTTTTTACCGTGTAGATTTCTAGTGATCTTGAAGACACTGA
TTTAGAGATCTGCATGGGACCAAACTTCTAGTCTTGCTCCTGCCAGGTGTTATTCCGCACCCGACTGCTC
CCGCTGTATATTCAGCCTTTGTTCACCCGCTGCCTGTTCTGTTTTCTACCTGACCTGACTGTTCTCGCTA
AATTTAGATCTGGTTTCCAAAATCTCACTTTAAAATTGGGCATTACCAAAACAGAGAGACGGATAACGGG
TATAAGTGTTGGTTGTGTTTGGATAGTAGGCTAAATGCCAGTTTTGTTTACCCCTTTGTGATGAGACATG
AGTGCCATGTTTGTGGCTGGTGAGGCACTGACTCTTTCAAAGTCACCCTAACTACCGATTGTGTTTCATA
TTTCATATCAGCAACACACATAGCAGCTGCAAATTGGGACAAGGCAGAATGTAAAATGTACAGCGATTTA
AATATGCCTCCCAAAAAAAACACCCAGCTGGATGTTACAGAGGCCAGACATCCTATAACAGGCGACACAC
AGTACCACGGCAGATGCACGCACTCTTTCAGGAACACTATATTGTTAGACTATCCGCTCCGGTTCAAATT
ACACTGCAGTTACCGAGCACTATCGCATTTTAATCTGAAATTTATTGCCGCACCACAAAAAAATCTGCTC
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AGAAAGTCTCACTCCAAATCTCACTCCAAGAAGTCAAAGTCTCGTTCTCGCTCGCGTACAGAAAAGTCCC
GCTCTCGCTCCAGGAGTCGCTCCAAAGCAAAGTCCGAGAGGGATTCAAGAAGCCGCTCCA