LncRNA Gene

ZFLNCG06977

Basic Information

Chromesome: chr11

Start: 46192698

End: 46199796

Transcript: ZFLNCT10672 ZFLNCT10673 ZFLNCT10675 ZFLNCT10676

Known as:

Genome Browser
Express profile Download
Express in top 10 samples
Sample Tissue Condition FPKM
SRR1205154 5dpf transgenic sqET20 261.58
SRR1205151 5dpf transgenic sqET20 and neomycin treated 1h 244.70
SRR1291417 5 dpi injected marinum 215.43
SRR1205172 5dpf transgenic sqET20 and neomycin treated 5h 202.16
SRR1205166 5dpf transgenic sqET20 and neomycin treated 3h 199.04
SRR1205157 5dpf transgenic sqET20 and neomycin treated 1h and GFP+ 193.78
SRR1205160 5dpf transgenic sqET20 and GFP+ 180.52
SRR1291414 5 dpi normal 164.16
SRR658537 bud Gata6 morphant 155.09
ERR023144 brain normal 154.19
Express in tissues
Correlated coding gene Download
gene correlation coefficent
ogt.1 0.74
rbm5 0.72
zgc:158262 0.71
gpatch8 0.66
zgc:172106 0.66
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clk2a 0.66
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abcc5 0.64
Gene Ontology Download
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KEGG Pathway Download
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Conservation
Zebrafish lncRNA Transcript Human lncRNA Transcript Mouse lncRNA Transcript Methods
ZFLNCT10672 NONHSAT149138; Direct blastn
ZFLNCT10673 NONHSAT149139; Direct blastn
OMIM

OMIM of this lncRNA gene hava does not exist!

Sequence Download
>ZFLNCG06977
CAGCCCGAGCGCCATTACAGATCCGCAGTGATGCGCGCGTGAGGAGCAGGCCGCGACACACTTCATCCAC
TCCACGGAGGACAGATCGAGGCAAAATCGCGGATTTGGATGCATATTTACCGTCGCTGATCCAGGAAAAT
GGCGTCCAGCAGCACCAGCGTGATCCAGGTGACGAACGTGTCTCCGAGCAGCACCGCCGAGCAGATGAGG
ACTCTGTTCGGCTTCATCGGCAGCATCGACGAGCTCAGACTCTTCCCTCCAGAGTGAGTCAAACACAGCT
TTCACAAACACTGGGGGAAACTGCACACATTTCTGTACACAAATTTTTATTATTCTGCTCGTTCGTGCAG
ATTGAGGTCGAATATTAGCACACCCATTCACACTCGATCCGTTTCCGCCACAGTGAACGCGCACACTCTT
CTGGTGGAGCTGTTAACCGACTATTAGTGTATTTGTCTTCATATTTTCTGCGTTGTGTGTATTAAGTTGA
CTTGTACACTCACACGCGATGTTTATTATGGTCATTGTACAATTTAATGTCGTTACTTTGTTACGTGAAG
ACGCGTGACGTCACGCACGTAAATCTGCGTCGACGCACAGTTCAGTTTTCGTGTGCACGTGTTTGATACA
CACTTTGTGTTAACAGTTGTTGCTTTAGTTGTGTTACTGTTATAATCACCAGATTTTCATTACAATACAA
TCTAGTTGTGGTTGTTTTTAATAGCGCTGTCTGTATATAATGCAGGTTGTTCATACACAAATGTAAATGT
ACCTACTATCTACTCTCCCTCAAGTGTTTTCAAAGTTTAGCTTCTTCTGTTAAACAAGTATTTCCGATAA
AGCTGGAAGCCTGTAACCATTGATGATGAATATTGTATTTAATGTTTAGGATAACAGAAATATGTAATAA
ACCCCTGCTGGTTTGGAAGCACTTGTGGGGTTGTGGTAAATTTGGTTTTATGTTTGCACATTTAGATATT
TTACTTAGTATAATTTCAGAAAAGCTTTTTTTTTTCTAATTCTAAATAGTAAAATCATATTAACAGCCAG
TGACTATCAAAGTACAACACTGTTCGCAGTGGATGAAATAGTGCTAATGTTCTGATTTATACTGGCATGT
AATTTCAGATTCTGTATTCAAAGTAGCCTGATCAACAATATAATATACGACTATAAAATATACGACTTTC
CATAGAGATGTGGTTATCAGCTTTTCTTTTTAAACAATGCATTAGTTTCAAATACAATACTCATAACTGC
ATGCTAATTAATCAGTTTTAATCAATTCTACTTTACTATTTTTAAAATTTTAAATGTGCAAATATAAAAT
CAACATCATCTCAATCTTGGGGGAGAGTAAATGAGTAGATTTACTACTAAATTATTTGCTTATTTTTTTG
TGATCTCGCTTTAAAGCTGATGAACATTTTACAGTAATTTGACATATAAAGCTTCATAGTTGTGGAGCAG
GTTAAATATGTCAAGCGCGTTGCCTATTTTATTATATAGTTTGATAAAACTATAATATAATATAATAAAA
CTTATGTAATAAAAGTATGTACTAAATATATATTATATATTTGATATATAAAGCTTCATAGTCGTGGAGC
AGGTTAAATATGTCAAGCGCATTGTGTATTTTATTATATTTTTTGTAGTAATTTTGTTGATTTGGTTTAG
TTTGCATTTCATTGTTGAAGGATGTGATAGACTTTAGAGCAGATTTAGAGCAGATTTACTGGTGCAAGGC
AAAGAAGAGACAACCCAACTCTAAACAACTGAAAGGGAACTTTGAAGAAAGCAGGCTTCTATTCACATTT
TAATAGTACAGTAATTAAGCCTGCAATGTAAAGGCTAGCTCTGAAAATATTTAGTTTACAACATTGCTGT
TGTGCAGCCTGCACACTATTGGTAAAGACTGAAAATTCTATTTACGATATTAATACAATTTCCCATGACT
CAAACAAATGAAACATTTTAGATGGTTTCGGATGATTATGTAGGGATGTGTATCTACATCAAATGAAAGG
TATTTGGGCATAACGGCATTGGTCACAGCTTTTGCTAAATCAGGGTTGTGATTTTGTTTTAATCGCCCAA
CCCTACCTATATGGTGACCCTGGACCATAGAACCAGTCTTTGCAAAAAATGCAGTGTATAGGTTAGAAAT
GTATTTTTCTCCCAAAAAAACATTAGAATATTAAGTAAAGATCATATTTTAATAAAATGTTTTTAATAAT
TTTTACACTGCAAATATATCCACTCCAGTTGTGATGATTAATAAACATTGGTAAGAATTTATTTTGGACA
ACTTTAAACTTTTAATTTATGTTTTTAAGCCCTCAGTTACCCGCTTTTTTAATAGTTTTATCTCACCCAA
ATGTTTGTAAAATCATTAACACTTTAAAATAAGTTTGCATGAATGTATTTGCTAACATAACCAAACAATG
AATAATATATTCATTACGATATTGTTCATTGTTAGTTCATGTTAACTTTATTAACTAAAGTAAACAAGCA
TGAATTTATTTTGTACTATGGTTAATAAATTAAAACTATAATTATTAAATGCTGTACTTTATAAGTACAT
TAACCTGTATTCGTTAATGGAAAGCATATTAATTCAGCTTTGCGATAATGCATATCTTATATATGCACTT
ATGACTGATTTTCTGTTCTGGGGTCACATATGCAAGTTTGCAAACACTAATTAAAGGTTGTAAAAAGATG
TAAAATTAAGTGTACTGTGAGCTAAACATGGCTTGTTCTTAGGTGTAGAAATAGAAATGCACTCTCTGAG
ACGTCACTAGTCAGTCAGTCACTCAGTCAAGCAGGGTTTTTCAGTAGCTTGTATTTAGTAACTTGTTCTG
TGCTTTTGTTGTTTTTCACCCATCGAAAAACATCAGGCCTCCTCATATCTGCAGTGAAGGTAGGACGCTG
CTGGATCTGAAGCCGGCAGATCTAAAACTGAGCCGGATCAAATCAAATCGAGCCAAACGTGAATATTTCA
CTGCTCTGTGCGTGCGTGTGTGTGAACTGTGTGTGTACACCTTGCAAAAGCTTCTATATTTTCTTTCAGT
GATTCTCCCTTGCCTGTGACTTCACGTGTATGTTTTGTAAAGTTCCACGAGCCGGAGTCAGTCGGAGTAT
CGCAGCATCTGACGAACACAGTCTTCGTGGACCGAGCGCTGATCGTCGTCCCCTTCGCTGAAGGTTTGTG
CCACTCCTTTATTGTGTTTAAATGTTACACATAATCAATCCCTTCGCAGTGTTGATGACGGCTTTAGTGC
AGTGAACTCCAGCGGCCGTCACACACACCTGAACGCAGTATGGGGACATTCACACAGAACGCGTTTCTTT
TAAAGTGCTCTGCTTTTTGTGTTTTCGATGTAAAGGCGCACTTGATGGATGTGTGTGATCGTTACTCTTC
TTTTTTTGTCAAGTTATAAGCAGTTGAAATTGTAGATGCAGCGCTGCTTGTTAATGTCGGTTTCAAAGCA
GTGGACCAATCAGAAGAGTTGAGAAGTGGGACTGCTGCTGCAAGTTTGTTTAAAGTTGTGTTTTAATGCT
GCGTCTTTAGTTTAGTTTTTCCCCGCGCGTGTGTTTAAAAGCAAAGACGTGTTCAGTGTGAATGAGCCCT
AAGACTGTATATGCACTCAGGTGAATATTTGAGAAATGTTGGGGATTAGACGCCCTGCGTGGCAGGCGAG
CTCATGTTTAACTCATTGCCTTTCCAGTTTAGTTTCATTTTTTTTGTTAAACTTTTCTCTTTGTCATCTG
TGTGTGTGATTTTTATAGTGAACAAGGCAATTGCAGAGCCGGCAGATGTCTGAGAGTGACCCTCTGCTGC
CCTGTAGACAAATAAAAGCGGCGGCCCACGTGTGTTTCCCTGCTGTAAACTATAATCCTCTCTTGTGTCT
CCATTCAATTCAATTGAGCTCACAGACAAAGATCGATCCGTCTTTTCTTGCAAAGCACTAATGTTTAGCC
TCAAATCCTCTGATTGAACTGCATGCTAATCAGACACGAGATAATCCACGGTAAGATGAGATGTAGCGCA
TTTCTGCATGAGTCTTTTGCACATGTATATGTGAGGAGAAGCAGCGCTTGGCAAGAGCGTAATGATAGCT
GAACGCAGGGCTTTCCCTGCGCGTATGTGATGATTTGTCCAATCTCCCTCCAGTATTTTCAGCTTTTTGA
GTAAGAAACAGTCTGAGAATGTTCTTTTGTTCCTCTCCACATGACTGAAAAGGCCTGAGAAGCTTTTTAA
CGGTCGTTTTCTGTTTTTTGTTGTTGTGTTTTCCAGTTCTTTTCCCTGGTTCTGCAAGTCCTGTAAACCA
GGCCCAGCAGAAAATGCCACCCAACAGTTTTGTCTTCTGCAGCTTGTCCTGTTTCTCTCTCATATGTTCT
CTCTATCTCTCTCTCTCAGCTCTCTCTCTCTCTCTCTGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT
GTGTGTGTGTGTGTGTGTCAGTGATGATTGTGTCTTTAGAGTGAAGTATTAATTTCAGAGGCGTTCACCC
AATGGACTCCATGCACTCACCAAACGTTCATTTGTCATTTAACTCTAGTTATTTTTCTCTTCAGCACTTT
TTGACTCACACACACACACACAGTCTGTAGTTAAGTTTAAAACGGGCTTTTGCTGGAAGAGGTCCTTTCT
GTTGTATATCTGTGTCAAAGTTTACCAAAGGTAAAGGCAGCTTTAGCTCTGGAATACCAGCAAAAGCCCC
TTGATGTCTTTATTTTTGTGTTAGTTCTGGTAAGTCACAGCATCAGTGGTTTAATGAACTGTCATTTAAT
GCTGACACCCAAATCATAAACTCTGTTTTGTCTATCTTGATGTCTCTGTGTGCTTTATAGCGAAGCAGCC
GACCTGAATCGCTTGTTCATTATACAACTTATGAAACTTGAGAGCACATCCCAGTGGAGATCCGGCTGTG
CTTGCTTACATTTGGTTCATGACTTAAAAAATCAAGTTCAGGTGATAACATCTTGGCAGTGTGTCTAGTG
TCATTTCTTTTCTTGTAGTATTGTGCACTTCATGCTATTGTTAAGGGACCTCATGTGTTAGCTTGCTCTG
GCAAAGTGAGTACTGATGTCAGTGCACATTATCTTGCAAAAAAAAAAGAAAGTTTGAGTTTGTGGGTCTG
TCTGTGTGTGCGTGGAGAGCCGCGGCGTGCTTTAACTGTGTGTTTCTGTTCTGCAGGAGTGATTCCTGAT
GAGTCCAAGGCTATGTCTCTGCTGGCTCCGGCCAATGCCGTTGCAGGATTGCTTCCAGGAGGCGGACTCC
TCCCCACACCCAACCCCGTCCCATCTGTGAGTGTCAATCTCTGTAACCCGAGGCTATATGCTTATTTCAG
GCGATCGCCATTTTAAAACACGAAAGCGAGGCAGCGGTGGGAAGGAACCCGGGAGTATAGCATCAGCAAT
GTAAACATTGCAGCAACATGCTGTGAACTACAAACCTCCAGCTGTTGCCTTAATTGCAAAATGCAGAAAT
GGTGTAAACATCACTTTAATATCATGCAGTAAGTTTAATCTAAATAATTAACAGCAGATTAGGCATCAAA
CAACATCACAATCTCTTTAAGAGTAAGTGTCCTCCTAGGTTTCAGTTCATGGCAGCAGGTAAACACCATG
GGGACGCTTCCCTGTTTCAGTCTATGTAACCCGGTGAGCAATAAAACACTGCAGTCCTCTGTAACACACC
TTCGTGTTGTCTGTAGCAGTGTTGTCCCGGTACTGAAGTTTTAAAAGGTCCATTTCCCGCTAACATTTAA
GCGCCGCCGAGTTCATAAACCGTGCTGGTTTGCCATAGTGTTCACCAGTGCTCAACTGGAATGACTGTGA
TTGGCTGTGAAGGTCATCAGTTCACCGCTCTTCACCGATTGCTAACACAGATAGACATTGGAGCGTTTTC
AAGCCGTGAAGATCGGTCGATTTATCAGTAGATTGCTTGTTTGTGTTTGTACTCGGTAAACATCAGTGAA
CTGATGACCTTCACGGCCAATCACAGTCATTTCTGTTGAGCACGTGAACACCATGGCAAATCAGCAGTGT
TTAAGAACGCCATCAACAGTGCTTAAATGTTAACGGGATATGGCCTTTTTTAAAAAAAATTTAACGTTTC
AGTACTGAAGTTTTGTCTTATATAGTGAAAGAATCAGTTCATTAACTTAAGGTTGATAAAAGGCATCTAA
AACGTGCGCTTGGGGAAGAAAACGTTAGCTAACTAGTTTCACTTCCCTTAACTTAGCTGAAAATGAGCTC
TGATATCCCTTTTTATTTTCACTATTCATTCAGAACGGATCTTCAGATCACTTGGAAAGCGGTGAAATGA
TAAATTTGTGTCACTTTCTCTTCGCTGATAAGATATAGTCAGGTACACAACATTCCTCTCTGACTCAGAC
GATACTTCCAGGTTTCTTCCACCGCAGCCTCGATTTCGCTGTTTAAAATGTCCGCCTCGTGAAATCAGTC
TATGGTCCTCCTTGCACTGTAGTGATGCTCGTGTGCTTTGTCTTGTCAGATTGGTGGCGTCCCTCTCGGC
GGTCTTGGAGGACCAAACTTGGACCCGATGGCAGCTCTGGCCATGGCAGCACCCAATATAAACCCACAGG
TTTGACCATTTTCCATTCCTTCAATAATGGCCAGACCTCATCTAGCCCTTGTACAGAAATGGCTAATGTT
AAGTGCTAAAGGCTGGACGATATGACGCATATCAATGCCTTGATTATTTGAACTCTTTTGATGATTGAAT
GATTAATAAAATTTTCAATGTAATAAACTTTTTTCCCCTCATAATTAATTTGGTTTGTAAATATACTCTT
AAATATCAAAGGCCTTTTTCTACAAGCGCAAGTAAACTTGATTACGTTGGTTGTAAGTTGTTCATTTTAG
TTTCAGTTAGCTAGTCAGTCTTAAATGTATTGTAAAATTCATCATTTATAATTTTGCATAACTGACTCAC
AAATCATGAAGCTGTTTATGCAGCAGGACTCTTTGACTCATGCTTGATGTTTTTCTTCTCAGTCATTGTC
AGCTGAGCAGCTCATGAAGCTCATGGCA