ZFLNCG07023
Basic Information
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Express profile
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Express in top 10 samples
Sample | Tissue | Condition | FPKM |
---|---|---|---|
SRR800046 | sphere stage | 5azaCyD treatment | 6993.46 |
SRR800043 | sphere stage | normal | 2801.76 |
SRR800049 | sphere stage | control treatment | 2431.75 |
SRR800045 | muscle | normal | 1291.63 |
SRR800037 | egg | normal | 784.13 |
SRR065197 | 3 dpf | U1C knockout | 35.61 |
SRR1004787 | larvae | impdh1a morpholino | 17.27 |
SRR1004788 | larvae | impdh1b morpholino | 16.58 |
SRR594771 | endothelium | normal | 15.56 |
SRR1004785 | larvae | normal | 10.67 |
Express in tissues
Correlated coding gene
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gene | correlation coefficent |
---|---|
ripply3 | 0.53 |
zcchc17 | 0.53 |
dync1i2a | 0.52 |
zgc:194285 | 0.51 |
pyroxd2 | 0.51 |
zgc:194210 | 0.51 |
LOC100330206 | 0.51 |
Gene Ontology
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GO | P value |
---|---|
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GO:0005875 | 2.98e-02 |
KEGG Pathway
KEGG pathway of this lncRNA gene hava does not exist!
Conservation
Zebrafish lncRNA Transcript | Human lncRNA Transcript | Mouse lncRNA Transcript | Methods |
---|---|---|---|
ZFLNCT10741 | ENST00000573866; NR_006880; NONHSAT146441; | NR_027863; NONMMUT011357; | Direct blastn |
OMIM
OMIM of this lncRNA gene hava does not exist!
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>ZFLNCG07023
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TATTTCACCATCTGTACATCAATATAAGTAGTGAATGTGCGTGTCTGTGCATGGGGCTGTGTAGGTGTGG
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CTGCATCCAGATACTATTGGGGGCTGATTTTTAGTCCCAGTCCATCCTGGAGGGTGCTATCGCAAATGGA
CCTGTGAGATGAACGCCGCTCACTTTAACGCTAATTTTGAAACACTGAAAGCATTATGTAAATAATATAT
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TTATTTATTATTTATTTATTATTTATTTTTATTATTATTATTATTATTTTTATTTATTTTTTGGGAGGGG
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AGGGCATCTGCTGCGTAAAACATATGCTGGATAAGGTGGCCTTTCATTCCGCTGTGTCGATCCCAGATTA
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CCACATTAATACACAATACTGTAAAATATTGCATTATATTGTAAAATAATGATAAAGAGCTGTTTTAACA
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AGCTGACGTCATCGCCTCACCGTCCTCTAGTTTGCTGTTGTCATTGATGGGGCTGCTGCCGAGCGCATGT
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