LncRNA Gene

ZFLNCG07670

Basic Information

Chromesome: chr13

Start: 30451703

End: 30457282

Transcript: ZFLNCT11751 ZFLNCT11752

Known as:

Genome Browser
Express profile Download
Express in top 10 samples
Sample Tissue Condition FPKM
ERR594417 retina normal 77.86
ERR594416 retina transgenic flk1 50.19
ERR023144 brain normal 41.30
ERR594418 retina transgenic flk1 and develop tumors 19.88
SRR1562528 eye normal 16.71
SRR1048061 pineal gland dark 16.71
SRR592702 pineal gland normal 14.70
SRR1048059 pineal gland light 12.82
SRR592703 pineal gland normal 12.30
SRR592701 pineal gland normal 11.20
Express in tissues
Correlated coding gene Download
gene correlation coefficent
si:ch211-185o22.2 0.66
crebzf 0.63
sf3b1 0.63
zgc:112982 0.62
clk2a 0.62
zgc:158262 0.60
ccdc84 0.60
nktr 0.60
arrdc3a 0.59
gpatch8 0.58
Gene Ontology Download
GO P value
GO:0007601 3.88e-04
GO:0050953 4.09e-04
GO:0051958 2.56e-03
GO:0045812 2.56e-03
GO:2000051 2.56e-03
GO:0015884 2.56e-03
GO:0097499 5.11e-03
GO:1903546 5.11e-03
GO:0097500 5.11e-03
GO:0007600 5.31e-03
GO:0008074 1.78e-02
GO:0005575 1.87e-02
GO:0005689 2.53e-02
GO:0044422 3.47e-02
GO:0036094 6.75e-04
GO:1901265 1.65e-03
GO:0000166 1.65e-03
GO:0004114 1.84e-03
GO:0004112 1.99e-03
GO:0008517 2.56e-03
GO:0015350 2.56e-03
GO:0003882 2.56e-03
GO:0008518 2.56e-03
GO:0016773 2.87e-03
KEGG Pathway Download
KO P value
ko04744 9.15e-07
ko00230 8.31e-03
ko00310 1.11e-02
ko04070 2.49e-02
ko00770 3.07e-02
ko03040 4.01e-02
ko04977 4.78e-02
Conservation
Zebrafish lncRNA Transcript Human lncRNA Transcript Mouse lncRNA Transcript Methods
ZFLNCT11752 ENSMUST00000176549; Direct blastn
ZFLNCT11751 ENST00000431490; NONHSAT012640; ENSMUST00000118723; NONMMUT017609; Direct blastn
OMIM

OMIM of this lncRNA gene hava does not exist!

Sequence Download
>ZFLNCG07670
TTCCTCGTCCCTGAGCGAGCCGACGCCAAGATGGTGAGTCGAGTGGGGAAAAATGAATATAATAATCTGA
TTAAATCTTCACCATCCGACGACGTAATAGTGTCATTTCGAGCGTAAAACACAATAAACATATATTATGG
CCAATTTGTAGCTTCATTTGAACGATGTGCTGATTATTACCACAACGAAAGATGATAGTTTTCCAGTTCG
GACCATCGTGTTACTCTTATCCAGTGCACGGGCAATGAAGAAAAACAATATTAGTGAGTGGGAACATATT
TTTGTCCGTGGACATAAAGTAATAAATACGTGAAACCTTAGCACTTAATTTGGCCCTTGTATTTAGTGTC
GAGCCTGTGAAGCTAACATGGCTAAACTGCTAACCATGGTTTAATACTCGCGAAGCTATGATGTTTTCTA
CATGGTTATCAGTTCATATTTGCAAAACGATTCTGATGTTCGTCAAGTAACTTAACTCTGTTGGATTCTT
TTGTAACGATATATTGCTTTAAAGTGTCTTGAGTAAGAAATGAAGCTGTCATGCCAAGAAATACGAACTT
TGTTCTTTGAGAAAAGCTCTCATGCAAGTTTAGCTCGGGGGTTTCTGTTAATTTGCATTATTATTATTGC
TAGATTTAAAAGATGGTTTAATCCGGATTTTAATGTCACTTTGCAGAACGACACAGTCACTGTCAGGACC
AGAAAGTTTATGACAAACCGGCTGCTTCAGAGGAAGCAAATGGTAAGTTGGTTGCAAATTTGATTTCCTT
GCTTACTGAAGACAAAATGTGTATAATAAGATGCATTTGCTCATTCATGTTTTTTTAAAAATATATATAT
ATTTTCAGATTGTCGATGTCCTGCATCCGGGCAAAGCAACAGTCCCTAAGACAGAGATCAGGGAAAAGCT
TGCAAAAATGTACAAAACCACCCCTGATGTGGTGTTCGTCTTTGGCTTCAAAACACAGTTTGGTGGTGGC
AAGACAACAGGGTTCGGCATGATCTACGATTCTTTGGACTACGCCAAGAAGAATGAGCCCAAATACAGGC
TGCAGAGGGTATGCCATTCACTGATGCTTATAGTGCTGCATGATTAATATATAAAGTTGAAGTATTAAGG
TACCACCTTTCACATCATTGTCTTAGACTGAGAAAACAGACTTGTGAGTTCTCTTTTTTTTTCTGTCTGT
TTTAATTGCTTTCTAAAGCAAGTTCTTCAAACATTTAAGAGAGAGTTTATCTATAAATTAAAACCCATTA
ACTCACCCTTAACATGTTTCAAACCTTTTAGTTTTGTTCTGATGAACCCAAAATTTGTTTTGAAGATAGC
TTAAACCCTGTAACATTGTTTTCTGTAAGAGGTAAAACTAATACTATGGAAGTCAGGGGTTTCTGGTTTT
CAGCATTATTAAAAAAATCATTGGTTTAAAAAGAACCTCAAAGCTGAAAGGAGTAAATAATGAGTAAATG
ATTACTTATTTTTAGGTGAACTATCCCTTTGAAGTTTGGAGAACTTAATTATTTTACAAAACATTGTAAA
ATTCATTTAAATAACTAATTTAAAGATAAAATGTAGACTGAAAATATTATTGTTAATGTTGTGTAAAGTC
GCAGTAGAGTGTGGCATCTTATGGCTGTTATAGCATCCAAAGGAAATTTGTGCCAAAAGTCAAGTTTGAC
AATTTAAGCACGAATTATAAAAACACAAAGGCTGTTATGTCGTATGTGTTGCTGTGTGCCAGACTGTAGC
GTGGCAATTTGTGCTTTAATGTAAATTTGGGAGCACAATATTACAACCAGTTTCCTAAATTTGTAACAAG
ATTCGTATAAACCATTTTCTGCCAGCAAAACAAAATTCTGTTTATGACAAAAAATACATTTAGAAGTAAT
AGTAATTTCACTTATGGTTGATCACAATTGTGTGGCTCCATAAATATTACACAGCAAACCATTATCAGAG
AAGAAAATGAAGGAACGTTGATTTTTATCAAATTTTAGAATGTTCAGGGTTTTTTTTTCTGACAAATTAA
GCAGACGTTTTTAGCAATCGACAAGGTTTTTATTTTTATATATATATATATATATATATATATTTTTTTT
TTTTTTGAAAATTGAGTGGACCTTTTTACTATTATTCCCATTTCTACTGTTAAAATTACTGTCGAGTGCC
CAATTGCATTTTCTAAAAAAATACATATTTATGTTTTGCAGCTCTTCATCAAACTGCTAGGTTTTGCCCA
TTTGTCAGCCTGATGCTTCCACTAATGTTTTAAAGAGCCCATATTATACATGAAATAGGGTCATATCTTG
GTTGTAAGGGTCTCCAACAACAGTCTAATATGCATGCAAGGTCAAAAAACACTTTCTTGGTCTTATAATC
TGCATTTATTTTTACCTAATTATCCCAGCGACTCCCGTATGAATCGTCCAGTGATTCATTTGTTCCCAAA
CCCCTCCTTAGCGCGAAGCTAATCTGCGCTGATTGGACCGATGACAGTCTGTCGCGATTGGTCGACTGCC
TTTAGTCAGAGAGTGAAATGCCCAATAGCTAACCAGCAATATAAAAAGTAATCACGGTTCATACACGCTC
AATAGTGTAGGTGTGGATTTTAGCTGCCACACACACACAAAAACACACACCTCTGGACGACAACGCTCCC
GCTTATGCCCGCACCCGCCAGGTTTTAGCCTGAGAACCCGCCCCGTTTTCTGCCCGCCGCGCCCGATCCC
GCTAGAGCGGGGGAGAACACAACCAAAAATCACCCAGCTACACAGTCCAGACAGCCAAGCTGTCTGTATA
AACACACACACAGCACCAAGCACACAAAGCTCTCTCTTTCTCTCTCATACGCACGCACTAACACACACAC
AACCACCAAGCAGACTCATAGGCAAAGCTCTCTCTTTCTCATTCGCATAGCGATATCCGTGATATTGCTA
GACAGCCTGCTCCCGTCCCAAATTAAACCCGTTACCGACCGCTCCCGCGATTTTTTTCGGAAATTTATTC
CCGCGCCGCAGAAATCTGGCGCGGGGACAGCCACAGGAATGCAGACCTCTACCACGGAGCTCCATAAACA
AAGCAGCACGCATCGTGTTTTTAACGTGACTTTGCGTGCGATAAGAGAATATAGCCAGTTAACCTGATAC
AGTACACTCGGTTACAAGTAACAAATCACAACTAAATACATTTGCAAGCTAGAGTCAACGAGGCAACAAC
TTTAATCGCACGTACTTACACTTGAGAAATGGAGAAAGAAACCCATTCTGACGTCCATCAGTAAGTTACT
CTTTACTGATCCTTCCTTTAACAAACGCAGATGAAGTATTCTTTGTAGCATGTAGCTTCCAGAAGTTTCC
AGTAGTTTCCAACTGCTTGGTTATAATGCTGATGTTTCATTTTTGGGTAGAGACTCGATATAATATCCAT
CAGCAGTGTGACTTCAATCGACCGGCATGTTTGTGTGCGTGTGTTTGTGGGTGTGCGTGTGTTTGTGGGT
GTGTGTGTGTGTGTGTGTCTGGGTTTCTGCGTCAGAGGGCGGGGCCTCAGGTTTGAAATCTCCCGGGTTT
GCGCATGCACGTGAATAACTTGGTTTCGTTCATACGTCATGGCGAAACACCTAATGACTCGGTATCAAGG
CGACTCGTTTGAAGCACTATGAGTCGACTCTTTTATAGATGAATCAACCGTTTTAAACACTGTATTCTTA
CAGATTTAAGCCTTAGCTGGATACTTCACTTCACTTAGAGCTGTTACACACTACATGGAGGGGAATTTTC
AAAAACCCATAATATGGGCTCTTTAATAATTTATCGGAGAAATTGAAAATGTAATATTCTACTATTATTT
TCTCACTGCCCCAACTTGTTTTAAACCTGTTTAAGATTTACACCTATTGAAATCAAAGATATAGTGAAGA
GTGTTGGAAAAAAAACAGCCAAAGATGATGCATTTTGTTTTTGCTATGGACGTCAACATTTAATACAAAT
TTAAGACATTTAATAAAATGTAATATTTTTCATAATTTTATGCTTTGATTAACAGAATATTGTGGTTCAA
AAACAATTGTAGCTAACTGAGTAAATGTGAGCTTTTTTTTTAACCATCCTTTTTATATAATTGTTTTTGT
TAGGGCGTTACTCACGCTATGTACAGTTGCCTTGAACTGGGCCAAAGCACGCTTGTCCCCCCGACGGCCC
CCACTCACATTACAATCGTGCCTGGGCACTCTTACATCGATGATGCGCAGCTTAGTAAGCGCTCTCGCTC
AGCGCAGTGGAGATTTCTTCAGTTATATTGTTTTAATCATTTGGAATGCTGTGATGCGCTGTCAAATATT
TCGCCGAACAGATCGGCCACTTTTGACACTCTTAAACAATCAAAGTCCTCGTGCTGCAGGATTTAGGAGG
TTTGCTGAAGGTGCAGCTGTCATGCAATGAGGGGTTTGCGTCTTTAATAAACTACAACAGTTTGCGTTCA
TTGAACAGTAAGAATGATCAATTAATCCTAATGAAACGGTCCCTCAAAAGTCACGTCTTGCTTTTAGTTT
CTGGCTTATGCGGGTTCTGCACTCACCCACAAGCGTACTGCACCAAAGCCCAAGTGAACTGTGCCTGAGC
CTGATTCAGAGCACTCACTCTTCTCAAACGATCCGGGAAACGGGCCTGGGCACGGTTCGGATAGCATAGT
GTGAGTAAGCCCTTAGTTTTATGTGGATTGTTTAAGTCAGAATATGAGTTTTGATCTTTAGACATTTTTT
GAGCTTGATTTAATTTCATATTTTGAATTTAAACAAGCTAAATGGAACAATGGCTAAAATATGACTATTT
AAGATTGTGTAATAACTTTTATGGTTTAAAGATTCAGACACCAAAATGAATGCATTACCATTGGAACACT
GAAGGGTCTTTTTGAACTTTAAATTTAAGCAACTTTTATTGGAGTGGTTTCAATGAGGAAATTACTTTTG
TGAACCATTTTAGTGAATTGTTAAGTGTACATCAGACAAAGGAAGCTTGTTTTATAAAACTCTTGTCTTT
ATTCTTCAGCATGGCCTTTATGAGAAGAAAAAGACATCCAGAAAACAGCGCAAGGAACGCAAGAACAGAA
TGAAGAAAGTTAGAGGCATCAAGAAAGCATCTGTTGGTGCTTCTGGCAAAAAGGTAATGTTTATCTTCAG
TATCCTCTGTAAGATTGAGAACCCTTTTTCTATCTTCTGCCTGTCATGGATGTTTTTGTCGTCATTGTCT
TAGTTTTAATGTGTAATTTGTCATCTTTCCTCCTTGATCAAATGTACTTCTGGACTATAGAAGGTAAACG
CTTTCACAAGTAGACTAACTGCTGTGGAAGGAGAGTCTGGAGTGATCTGTAAAGTTAACTCCAAACATTT
AGCTGCTTTGTTCATGGCTAATGCTATTGACCCCAGTTTATGGTTTGAAATAATTCTTACAGGCACCTTT
ATATAATCCTACTTGAGTAGTGAGTAGAGCGCTTACTAATAGTGATGTGCTGACCGTGTAGGAATCAGTA
GCACAAGCAAAATAGCAGGATTTACAAATTCATGCTGCAGTCAAAAAGA