ZFLNCG09389
Basic Information
Chromesome: chr16
Start: 58156445
End: 58166227
Transcript: ZFLNCT14441
Known as: ENSDARG00000089960
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Express profile
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Express in top 10 samples
| Sample | Tissue | Condition | FPKM |
|---|---|---|---|
| SRR1562533 | testis | normal | 2.28 |
| SRR748488 | sperm | normal | 0.65 |
| SRR1049952 | embryo | transgenic TgOMP-Gal4 and UAS-GCaMP1.6 and treated with gallein | 0.56 |
| SRR1647681 | head kidney | SVCV treatment | 0.36 |
| SRR1647679 | head kidney | normal | 0.30 |
| SRR516135 | skin | male and 5 month | 0.28 |
| SRR527835 | tail | normal | 0.27 |
| SRR1048059 | pineal gland | light | 0.21 |
| SRR801556 | embryo | RPS19 and p53 morpholino | 0.16 |
| SRR891511 | brain | normal | 0.16 |
Express in tissues
Correlated coding gene
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| gene | correlation coefficent |
|---|---|
| LOC101884083 | 0.51 |
Gene Ontology
Gene Ontology of this lncRNA gene hava does not exist!
KEGG Pathway
KEGG pathway of this lncRNA gene hava does not exist!
Conservation
| Zebrafish lncRNA Transcript | Human lncRNA Transcript | Mouse lncRNA Transcript | Methods |
|---|---|---|---|
| ZFLNCT14441 | XR_874820; | Direct blastn |
OMIM
OMIM of this lncRNA gene hava does not exist!
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>ZFLNCG09389
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TGCTTGCTCTTCATTACCCTCAGTAATAGTAATAATAGTGAGTTGGTCGTTGAGTAAAGCATAAAGTACG
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CTGCACCTCCAGCCAGAAGAGCAGGTCGTTCTCCAGCAGAGCGTCAACAGAGGACAGAAACTGCTGGAAC
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CACACTCACCTGCGCCTCACGCCTCTTCCTGCGCTGGTGGACGACCGGCTGCTGCTCACACACTTCTGTC
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GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTGAATAATTAGTGTAATGAGTGTAATTAGGAAAGCGGAGGGATC
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AGGAGCCTGCAGCTAACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACA
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TGTGTGTGTGTGTGTGTGATGCTGTATTCAGTAACGTCTGAGTCTGAGCTCAGTAGAGGAGCATTACAGA
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GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGTGAGGGAGTGA
GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGTGAGGGAGT
GAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGTGAGGGAGT
GAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGTGT
GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGTGAGGGAGTGAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT
GAGTGAGGGAGTGAGTGTGTGTGTGTGAGTGAGGGAGTGAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGACCTGGT
GCTGCTGCCGCCGCCTGAACTCAGCGCTGGACAGGAAGAGCGGCAGCCACTGAGCTTCCAGACGACTGTG
CAGAAGAGCCTGGAGATCAGAGAGAGCAGACGGAGACACCACACCTGCAGCACACACCTGCAGGAGCTAC
ACACACACACAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGTCAGTAAGTTACTTTGACAC
ACACACACACACACACACACACACACATGCTCGCTCGCTCCTTCAGCTGTTCTCCTACCCTCCTCTGCTG
CTCCTCAGAGGCTGGGCTGTCGGCTCCAAACAGGAAGCTGCTGTTGAGATATTTGTCTCTGAAGTTCCTG
TTTCTCTCCTCCAGCAGAGCTCCGTCACTCCTCTTCAGCTGCTCCCCGTCCAGCCAACACTGCAGAACCA
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TCTTCCACACACACTGGCCCGGCCCTGGCCTGACACACACCGGCTGTAGCCCGGCTCAACAGTGTCCAAC
AGCTCAGTACATTTTGGGCCAAATGCGACCCGAAGCCCAACAGCTCAGACCATCACAGCCTTCAAACAGA
GCAGACCTGTGTCTCAGTGAGCGGCTGCCTCATCAGACTGACTGAGAGAAATGTCTGGAGTTTTCTTTGA
TTCACTTTTATTCAGTGACGTCGATATTCAAGCGGTGTGTGCTGCACAGAGAGTTACTCAATAACCCAGT
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TTATTTATTGCCTTATTCAATAATTTAGATGGATTATTAAACAGCAGTAGACATGGGAAGATGAGCGTGT
TCAAGGTATACCGCCGCTTGGAAAAGTTAAAACCGTCACAATTTTCTGCAATATTGTGAAAAAGACGCTG
TGTTAAACTCAATTTACACAAATCAAGACAGCAGAGGTCAATAATTCATCCAGCCTGACACGTTTACTGC
TCCAAAATACTATTAATGTTTCTCAAAATAAAATATATTGTGTTCAAAATAGAAAAAGTTTATACTTAAA
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CAGAATCTTATGCATGCCCAGACAGTGTACACGACGATATATTGACAAAACAAGAAAGAATATATAAGGG
TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCGTGCAAGTGTGTGTGTTTTAAAGTGTGTATGTGCTTCTATTGAAACC
TCTTAGCTTTAGTTCTGCTGGCAGTTTTTTTCCACACACTTAAAATCAGAATCCAGCAGCTATTGTTTAA
CACAAGGGTCAGAATATGAGCAGACGCTCTTTAAACAGCTAAACTGAATCAAGACAAGGCCTGAAACTAA
TGAGACAGTGGCGAAATCTCAATTCCAAGAACACAGAGAACAGACTTGTGTTCTTGTGGGGACCGGTCTT
GCCAGGGCACCACAGAAGAATGAACTGGGGAGAGCGCGAGGACAGAGAACGCTGCTGTGAGAAATGAGAT
CACACATCCTGATGGTCACATGACCCTCACACATCTTTAACCACATATGATTTAAACATTACAGCATTCA
TACAGCCATTATTGCTTTCCCCTTTTTACAATATATACTCTGCATGAAAACTTTACAAATAATCTCTGCA
CAATATCAATAAGACAGATATTACTGCGGATTTCAGCAGATAAACACTCTTAATGTGTTCATTGCTTTAT
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CTCAAGTCTGCATCGGTGCGTTCTCGATATAAGGAACACACCCGGTGTTCACGTGTCCTCTGTTCCTGCA
GTCTTGAGTATTGGAACTGAAGTTTAGCAGTAGAGGATGAGGTTACACGAGAGCGCTGGAGATCGCAGAC
TGAGAAACAGACAAATATTGTTCCCCCACACGGGGTGGAGACCGCAGTCTCATCAGCACCTGAGCCGGGG
GACTCCAGGCCCAGCCCGCGTCTCTTTCATCAGAGCATTCAGACCCAGCTGCACAGCCTCCTGGCATATA
ACCGCTGCACCAATCAAGCGCTTTTACACTACCGGACAGACTGGCACAGATAAGCAGATATCTCCATTCT
CACAACCAGTCTCTGAGTTCTCTCACACTTACAGCTGAGTCTGTTCTGCCGAGGTCATCTGGGAACACAC
ACTGCTGCCAATACTGTCAGTAAACCGGCGGACCTGCTCATGAGTTCAAGTGGAATTGACTAGTGAGTTC
TGTCATTAACAGTGGAAACAGCTGATTACAGGCTTCTCTGACACGGTCAATACTCCACTCTTATTGTATT
TAGGCTAGATCAGGGGTGGGTAAACTTGATCCTGGAGGGCCAGTGTCCTGCATAGTTTAGCTCCAACCCT
ATTCAAACAGACCTCCTTATAGAGTTCAAGTGATCTTGAAGACACGGATCAGTTTGTTCAGGTGTGTTTG
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ATTATTACTTTATTTGATGATGCAGTCTGTGTTCTGGTGCTGAAGCGTGTAGCAGATGTGTTTAGAAGCT
CTTCTCCACAGATGCGTTTGGTTCTTCTGTTTTATATAGTGGATAACTGACCAAGAACACAATATATAAA
TGAATGAATGCTGTCATAATCAATGTCCTTGAGTAACGCAGCCCTGGACAGCAGGCATCAGTGTTGTTGA
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TGCCGCTGGACTTACAGGTGTGCACTGCAAAACCAGCTGGCTCATCATTTACACACGTCACTATGTGAGA
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CACACACACACACACACACACACACGAACACGCACGCACGCACGCACACACGCACGCACGCACTAACACA
CACACACAGCTGTTCCCTTCTCACCTGGCTGAGCGCTCCTCCAGGAAGGACAGGAAGTGCTGGAGCTCTG
TGTGGTTCTGGAGCAGAGAGTCCAGACGGAACCTGCGGAACTCCAGAGGAACCTTCGCCCACAGATCCTG
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ACACACACACTGTCTCTTGTCAGATCACCTCTGCATCCTCCAGTGCTTACAATATAGAAACTGATCACCT
GAGGTATGTCAACAGAGCTCTCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATTTGTTAC
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CGCACCTCCTGCCACAGCGCCACCTACACACACACAAACACACACACACACACACACACAAAGTAGAAAT
GCACATCCGCCCTAAAGTGCTGTCATGAGTGTTCACAGGTGTGTGTTGTGTGCAGGTTCTAGTATGCAGG
GCAGAGTATGCACTGACTCTTACAGTGTGCAGTATACAATACACACTGCCTGACAGGAGTCTTGTGGTGG
ATCAGCTGTGAGAGCAGCAGGTAATATCTGGTCTTCTAGTTGATGATGTGTACAAGTGTGAGAAGGTGGA
TTTCTCTGCTGAATCATCTGCTGATCTGCATCCCAATCATCACCAATACTGCAGAAGACCTACTGGAACC
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CAGTATGGGGGCGTGCGAGAGATCAACAGCCTGAGGTATCAAGACATCTGTGCTGCCCATTACATTACAA
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ATTTCTGTTCAGTGATGACACTTTAGTCTGAGCAGAGTCAGACCGCACTGTCCTCATCAAATCAGTCAAC
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AGTGTGCAGTGTGTAGTGAGCAGTGTGTAGTGAGCAGTGTGTAGTGAGCAGTGTGTAGTGTACAGTGTGT
AGTGTGCGGTGTGTAGTGTGCGGTGTGTAGTGAGCAGTGTGTAGTGAGCAGTGTGTAGTGAGCAGTGTGT
AGTGAGCAGTGTGTAGTGTGCGGTGTGTAGTGTGCGGTGTGTAGTGAGCAGTGTGTAGTGTGCAGTGTGT
AGTGAGCAGTGTGTAGTGTGCGGTGTCTCCTACAGTGTGCAGGGGGTCTGTGAGTGTGTGTGTCAGCTCC
CCCCAGGCCTCCAGCAGGATGTTCAGAGCGTGTTCCTCCGCCGGGTCAAACAGATCCTCGAAGGCAGGAC
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TGTTTCCCTGTACTGGGTTGAGGTTGCAGGGAATCTGCTGTGTAAAACATAACCTGGAATAGTTGGCAGT
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CTGCAGCACATCAAGAACTACATGCTTCCATCATCCGGGAAAATCTCCATGATCAGACAGTTCAGGAGAG
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CATTAGTGCAGTGCAGCATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCTCCTGAA
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CACGCCCCCCCGAACCACAGTGTTAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGATGCTC
ATGATGATGATGTCGTCTGGCTCTTCTGCATCTCCAGCTCCTTCATCTGTCTCCAGAAGGACCAGCAGAT
CTGATCACACACACACACACACACACACACACACACACACACAGTCAGTATATATACTCCACTATATCAC
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GCGCACAGAACTCCGGCCAGTGCTTCAGCAGCTCCTCAAACACACACATCTGACACACACACACACACAC
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CATCACAGCGGGAGTGACACAGCTCCTGCACACACACACACACACACACACACACAGCTGTAGGAGTGGC
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GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGTGAGGGAGTGA
GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGTGAGGGAGT
GAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGTGAGGGAGT
GAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGTGT
GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGTGAGGGAGTGAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT
GAGTGAGGGAGTGAGTGTGTGTGTGTGAGTGAGGGAGTGAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGACCTGGT
GCTGCTGCCGCCGCCTGAACTCAGCGCTGGACAGGAAGAGCGGCAGCCACTGAGCTTCCAGACGACTGTG
CAGAAGAGCCTGGAGATCAGAGAGAGCAGACGGAGACACCACACCTGCAGCACACACCTGCAGGAGCTAC
ACACACACACAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGTCAGTAAGTTACTTTGACAC
ACACACACACACACACACACACACACATGCTCGCTCGCTCCTTCAGCTGTTCTCCTACCCTCCTCTGCTG
CTCCTCAGAGGCTGGGCTGTCGGCTCCAAACAGGAAGCTGCTGTTGAGATATTTGTCTCTGAAGTTCCTG
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CACAACCAGTCTCTGAGTTCTCTCACACTTACAGCTGAGTCTGTTCTGCCGAGGTCATCTGGGAACACAC
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