ZFLNCG10420
Basic Information
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Express profile
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Express in top 10 samples
| Sample | Tissue | Condition | FPKM |
|---|---|---|---|
| SRR514028 | retina | control morpholino | 7.96 |
| SRR514030 | retina | id2a morpholino | 7.45 |
| SRR942769 | embryo | myd88+/+ | 5.47 |
| SRR1167762 | embryo | ptpn6 morpholino | 4.92 |
| SRR886457 | 512 cell | 4-thio-UTP metabolic labeling | 4.79 |
| SRR942772 | embryo | myd88+/+ and infection with Mycobacterium marinum | 4.47 |
| SRR516121 | skin | male and 3.5 year | 4.41 |
| SRR942764 | embryo | myd88-/- | 4.27 |
| SRR1562533 | testis | normal | 4.12 |
| SRR1188148 | embryo | Control PBS 0.5 hpi | 4.09 |
Express in tissues
Correlated coding gene
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| gene | correlation coefficent |
|---|---|
| LOC101882635 | 0.53 |
| bahcc1 | 0.52 |
| LOC100002679 | 0.50 |
Gene Ontology
Download
| GO | P value |
|---|---|
| GO:0031507 | 7.11e-05 |
| GO:0070828 | 7.11e-05 |
| GO:0031497 | 1.42e-04 |
| GO:0006333 | 3.55e-04 |
| GO:0006342 | 1.35e-03 |
| GO:0045814 | 1.56e-03 |
| GO:0040029 | 1.92e-03 |
| GO:0006338 | 2.63e-03 |
| GO:0016458 | 3.13e-03 |
| GO:0016568 | 1.25e-02 |
| GO:0005677 | 1.42e-04 |
| GO:0000785 | 3.55e-03 |
| GO:0044427 | 1.42e-02 |
| GO:0044428 | 4.99e-02 |
| GO:0003682 | 7.67e-03 |
| GO:0000976 | 8.81e-03 |
| GO:1990837 | 9.24e-03 |
| GO:0003690 | 1.10e-02 |
| GO:0044212 | 1.25e-02 |
| GO:0000975 | 1.36e-02 |
| GO:0001067 | 1.36e-02 |
| GO:0044877 | 2.46e-02 |
| GO:0043565 | 4.33e-02 |
KEGG Pathway
KEGG pathway of this lncRNA gene hava does not exist!
Conservation
| Zebrafish lncRNA Transcript | Human lncRNA Transcript | Mouse lncRNA Transcript | Methods |
|---|---|---|---|
| ZFLNCT16119 | ENSMUST00000193146; | Direct blastn | |
| ZFLNCT16119 | ENST00000585940; ENST00000589456; NONHSAT068060; NONHSAT068054; NONHSAT068057; NONHSAT068059; | rna39530; NONMMUT059817; | Collinearity with conserved coding gene |
OMIM
OMIM of this lncRNA gene hava does not exist!
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>ZFLNCG10420
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AATATCTTTTAGCCTACAACATGGCTAGACAATATGACTTGAATTTAATAATCAACTTTTACTTAATCTC
TCACTCAGAGGCTTGGCCACTGTTACTGTTGAATAATAATGACTGCGATAGGCACCTGCGTCTGTGTCGG
CGTTCCTTGCTGTCACCGCGGCGCTCCCTGCTTCTCCTCTCTCTGCTCCTTCTCTTCCGTTCTCGACTGC
GGCTGCGGGACGGACTGCGTCGCCGGTGCCGGTTCTCCTTGTCCCTCTCTGAGACCAAAAAAAAAAAAAA
GAAATGCATTAGCATCCAAAAAAGAAAAAAAAGAGAATCAGTACTGCAAGCTCCTAAAGTAAATGAGAGG
ACGGAAAGAAGGTGGTAAACAGAAGACAAAGCCCATTCCAGCTGCAGAATGAAAGAAAACGAAAGGTTTG
GCACAGAATTATGCAGGTTTTCTGATTTCACAGTGAGTATCTAGGGGCAAACGGAAGATTAGAGGGAAAG
GAAGGAGACAGGTTGTGTTTGCTTTTCTGAACCTCATTCTGGGATACCCACCATGACCGTTTAGACTGTC
ACCTGTGCGGAAGAGAAAAAGGGACACAGGAGGTTATTCCAGCTCATTTAAAACATCCTATTCTTTCATG
CAAAGAGATTACGGTCAGCCTGACTGGACGACTGCTGATCTGGCAAAAATGAACACACAGAACGCCTGCA
GAAGGGCCCTATGATTTTCATTATTGAAGTTAGGCTAAAGTTGGCTTTGTAATCGCACATTTCAC