LncRNA Gene

ZFLNCG11193

Basic Information

Chromesome: chr20

Start: 42463291

End: 42471493

Transcript: ZFLNCT17329

Known as: LOC103909349

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Express profile Download
Express in top 10 samples
Sample Tissue Condition FPKM
SRR1049946 embryo transgenic TgOMP-Gal4 and UAS-GCaMP1.6 and treated with DMSO 3.77
SRR038624 embryo traf6 morpholino and bacterial infection 3.77
SRR527833 5 dpf normal 2.85
SRR519742 4 dpf VD3 treatment 1.73
SRR527832 16-36 hpf normal 1.73
SRR633516 larvae normal 1.58
SRR1004789 larvae impdh2 morpholino 1.36
SRR519717 2 dpf FETOH treatment 1.33
SRR519737 2 dpf VD3 treatment 1.29
SRR535913 larvae krox mut 1.28
Express in tissues
Correlated coding gene Download
gene correlation coefficent
LOC101886397 0.52
sox5 0.52
gsk3b 0.52
zgc:153702 0.51
sox9a 0.51
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Gene Ontology Download
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KEGG Pathway Download
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Conservation
Zebrafish lncRNA Transcript Human lncRNA Transcript Mouse lncRNA Transcript Methods
ZFLNCT17329 NONMMUT081965; Direct blastn
OMIM

OMIM of this lncRNA gene hava does not exist!

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>ZFLNCG11193
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AAGCCAGAGAAAGACAAGCCAGCGGAGAAAAAGAAGTGGCCGCAGGGCTTTAAAACCAGTACAAGTCCTT
GCTCTTATCTTGGCTCTGTAGACCTGAGAGAAAGACGGAATAGGGAGAGAAAAAAAAGCATAAGGAAATG
AAGAGAGAGAAAATAAGCAACAAATACACAGAGAGAGAGAAGTGAAGGCTGGAAGCAAAGAAAGCCTTAA
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TTTTATTAAATTTGGTTTAGAACGTTTTTAAAAAGAAATTAAGTGTTTTTTTTCTGAAGATAAATGAAAT
ATCAGACTTTAGTTTGTAAGGGATTTTGTAAAAATGAAAGATCTAGTTTAGGGGTGCCCAAACCTTTTCG
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TTAAAGTCGCCATGGGTAATTTCCCAATTTATTTAGTAAGATTTAGAAGTAAATACTGTAAAGGGAAAAA
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ACACTAACATGAACAAACTATTGATGACTTTATTTTCAGTACCTAACGATCAGTGAATAAATACTGTAAT
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TTTTGGTTAGTTTGTGTAATACGTGCTTTCGTCATTCATGTATTTATTTTTAGTTACATCTAGTTTATTA
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GTTAAACTACAACTATGCGTCTAATTCGAATTTACCTTCAGACTAAATATAGATAGAAACACCTATTTTA
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AGACTGATTGGCGCGATTATGTATTCTCAATGTTTTGAAGCATTATAGGGGTGGTCATATGTATACTTAT
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GTTTAACATTTAGTTTTAAAATGCAATAACATCCATACTTTTTCTCATGTAAGTAAGTGTATCGTTCACT
GCTTGTTCATGTTAGTAAATACATTTTATATACACAACTACTATAATACATCCTTAATGCAAAGTCTTAC
CGCATTTTCCCTAAAGTAAATGCCATTCGGTTTAACACTAAGTTGTCAAATGCAATAACATCCATTCTTT
TTTTTAAGTATATCTGCATAAATACTAGTACCGCATTTATTAATGATCATAGTTCATTTACTAGTGCATT
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TACTGTAATAGGTGTATCGTTCACTGCTTGTTCATGTTAGTAAATACATTAACTACTGTACTACTGCAGT
TGCAAAGTCTTACCATGTTTTCCCTAAAGTACAGTTGAAGTCTGAATTATAAGCCCTATTGAATTATTAG
TAATAAAAGTATTATTATTATTATTATTATTTCTCCAAGAAGTAATAATATAACACATTTCCAAAACTTA
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TGTTTTTTAAAATGCTAGTATTCAGCTTAAAGTGACATTTAAAGGCCTAATTAGGCAAGTTACAGTAATT
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TATTGACCTTAAAATTTTGAAAAAAAAAAAATTTATTCTAGCCAAAATAAAACAAATAACACTTTCTCCA
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GTTTAAGCTTCATGTTCACACCTGTATCCATGTTCAGACTCATATCAGAGCTGGTCGCTGTAAAAGCTCC
GGTCCATCCCGAGCTGCCTGCTTCGCTCTTGCTGATATCACAGGGCGAGGATCCCGGTGCAGGCACCGTT
GCAGAAGGAAGTCTATGCGGCCGCACTGAGGGTACGAGCAGGGAGCCGTAACGGGGGTCAAAATGCGTCC
CGTACATGTCATGCACTGAGGGCCGGGGGTAAGTGGACCCTTGGGTGCCGATGGCTCCGCTGAGCGAGTA
CGGGTGATGGTGGTGGGACGGGTGCCACGGCTCTGGGGTGGTTTGGTGGAGGTGGCTGTGTAGAGATGCG
CTGGAGTACGGGTCTGTTGGGAAGGGAAGGTCTGTGTGGGACGAACCTAATGCGCTGCTGAGAGATGCTG
CGACTGAGGGCTGATAAGCACTGTTCCAGAAGGAAGGAGGAAAACTTCTCTGGCTCATAGGGAATGATCC
ATCTGCGGAGGAACGGATTGACGTTTATATTTGATTATTGAACAGATGCTTTTTTTCCATAAGTGAGGAT
AAATAAAGCACTTTAAATCAGTAGAGTACACTCAGTTTGTATGAAGGAATTAAGTTAGATTATTAGATTT
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GCTTATTTTAAATAAGTTGTTTGAACAAAGAGCAGACGTAATTTTTTGAGTATTGCAGTATATAAATAAT
ATGAAAAATCTGTTGCTAAATCTACAAGTCTAAATTACTATTGTTATTATTATTATTATTATTATTGAGA
TGTTTTGTGTATTTATATTCTGTATATAGATGTGTTTGATCTATATATCACAGCAGTTGATTGATTTGGC
TGTTGATGAATCTTCCACTTTTGGTTTAAATAAAATGTAAACACTGTCAAAAAAAATGTTGGGTTCCACA
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TGGACATAAGATTGTTAAGTTGTCCCCCCCAAAAAAGTAAGAATTGTGTCTTTAAAATAATTTTTAAATA
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GTCGTAGTTATATCATAATTCTTTGTATATGATAATATAATTGATGTTTATTAGGTTTTAAAATCAAAGT
CTGAAACAATGCAAATAATACAATTACAATACAATAAAATGCAGTTCAATAAAAAAGTTCCAACTGACTA
ATAGTGGTGCAGTTATTAAGAATGGAATAAAATATATATAAACAGTTGAAGTCAGAATTATTATTTCCCC
CAATTTCTGTTTAACGGAGAGAAGATTTTACAACACATTTCTAAAGATAATAGTTTTAACAACTCATTTC
TAATAACTGATTTATTTTATCTTTGCCATGATGACAGTAAATAACATTTTACTAGATATTTTTCAAGACA
CTTCTACACAGCTTAAAGTGACATTTAAAGGCTAAACTAGGTTAATCAGGTTAACTAGACAGGTTAGGGT
AATTAGGGAAGTTATTGTAAAATTATGGTTTGTTCTGTAGACTATCAAAAAAGGGCTAATAATTTTGACT
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TAAAAAGAGAAAAACATCAAAGGAGGTTAAATGATTCTGATTTCAACTGTATATATATATATATATATAT
ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAATACATATTATAT
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AAGTAATATGTAAACATTTATTGTAAAAATAAGTTCACAACGATCAGTATGTCCTCAATCCATTACTTTG
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TATTAATGATACAGATGAATTAAACTGAATGGTATGCAGTTTATCTGTAGGTCCTAATTTAATTACACTC
CATTTGCTCTTTAATCCCTATCTATTAATCTGAAAACCATACAAAGAACAAAGTAATAAATATGACCCCT
ATGGTCTTAATGCGAGAAAAAGATATTTGAATTATAGTATCCGTGATTGGTCACACTTTACAATAAGGTT
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CATAAACTAACAAATACTGTAATAGATGTGTTGTTCATTGTTACTTCATGTTAGTAAATACATTAACTAA
CATTACAACCTTATTGTAAAGTGTTACCAAACAATTATTGGGTTGCATCAGAGGCTTACCTCTCCAGGAT
GCTGCGCCTCTTGCCGTCTTGCTGTTTGTAGATCCAGGTGCGTAACTACTAGACTGACTTAAAGCACGAC
TGAAATGTTCATCCACCACCGAACTGATGTCCCCTTGGAAATAGGTGAAAAGCACACATCTGGAGCTGAT
GTACTCAGCCTCTGGCGGGTGATCTTTCTCCCGGCCACAGTCTTCCTCTTTTATGGGTGGCCCGGAGAGG
TTGGAAAAAGAAGAGCTGCTCCCACTCACTGTTTCTGGAGATTCTTGCATTTTCGAGTAAAATGCCAGTT
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CGTTAACATATGTATTAAATATTAACCTCTAAATAGAGATTTTAATCATTTTGAACATGGGCTTATTTTT
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CTTTCTTTACCAACAACAACAACAACAACACGCGGGGATGATTGTAAAACTATTTTCATGGCTGGTAAAC
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GATGGTGATAAGGTGTGTATGCGGCTGCAAAATACGGCTGAGGTGGACCATAAACTTGATACATGACATC
CAAGCAGCTCAT