ZFLNCG11196
Basic Information
Chromesome: chr20
Start: 42814356
End: 42827192
Transcript: ZFLNCT17332
Known as: ENSDARG00000093533 LOC103909352
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Express profile
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Express in top 10 samples
| Sample | Tissue | Condition | FPKM |
|---|---|---|---|
| SRR1562533 | testis | normal | 0.05 |
| SRR776507 | embryo | normal | 0.01 |
| SRR1342219 | embryo | marco morpholino and infection with Mycobacterium marinum | 0.01 |
| SRR1562528 | eye | normal | 0.01 |
| SRR592703 | pineal gland | normal | 0.01 |
| SRR891495 | heart | normal | 0.01 |
| SRR726540 | 5 dpf | normal | 0.01 |
| SRR941753 | posterior pectoral fin | normal | 0.01 |
| SRR1205160 | 5dpf | transgenic sqET20 and GFP+ | 0.01 |
| SRR516123 | skin | male and 3.5 year | 0.00 |
Express in tissues
Correlated coding gene
Correlated coding gene of this lncRNA gene hava does not exist!
Gene Ontology
Gene Ontology of this lncRNA gene hava does not exist!
KEGG Pathway
KEGG pathway of this lncRNA gene hava does not exist!
Conservation
| Zebrafish lncRNA Transcript | Human lncRNA Transcript | Mouse lncRNA Transcript | Methods |
|---|---|---|---|
| ZFLNCT17332 | NONHSAT201119; | Direct blastn |
OMIM
OMIM of this lncRNA gene hava does not exist!
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>ZFLNCG11196
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CTGTGCGACTTCCTCTCTGACTTCCTCTCTTAAAAACTTCACAGGCACATCCAAGGTTATATGTCAGAGG
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GCCAGCTGCGTCACGCCATAAGCGCATTTTGACGTAAAGTAATTTCACTTTCGCTTTTGCTCTTGTGGAT
AGGGAACCCTTTACGCACAGACATCAATTAGCCTATAAATAATTAATTTGTTTGTTATGTGCAAAGATTT
GTTTCAAAACTATTTCTAAATTCAGTTCTAATTTCCAGCAAACGAATAAAAGAACAATAATAACAAAGTG
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AAATATCCTTATTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATCCTTAAGATATTATA
TATTTTTCATATGTAAAGATATTTGATTATTGCTCTGCATCTTGTTTGTAGTGTGTAAGCCAGGTGCACT
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GCTCTGACTTTAATGTTCTTAGTGACACAGCCATCCTCCATACACTTAAAAATATAACTGGATACAGCAT
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TGCATTGTTGTGGCTCTTCTTTCAACCGACCACCCATTCCTCCTGCTTCCAACTGCTGAAGCTTTTTTCT
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TCATCAAAGTTGTAAGTTATCTGTGCTCTTTGCTCTGATTAACTGTTTCTATTTTAAACATGTCATATTA
AAGGTGCTGTATGTAAGTTTTTGACTCTTTTGAAGCACAAAAATACCAGAATATGTTTGCAGATATTTTA
GAAACTTGCTAAGTGTCAGTTATTCTCCTCTGTCTATAATCTGCCCACTGGTTTTTCTGATAGACGTCTC
TAACAGTTTTTACAGGAATTAACTTTTCCATCAAATGATCTGAACAACTGTTTTTCTTTTAGGGTGGGTT
TGAAAAACCCCTTCCATCAGAGATCGCTCTGCACTATCTCGCCACTAAAGGCCCCAGGGTTAAACAAATT
GCTGAGCTTCTGGACTGGAAGGTGGAGGCTGAACGTTACATCATAGTCGTGGAGCGGCTCATACCCAGTA
TGAACTTACGTGAATTTTTAATCGACAACAAAGAAGACACCCCTGAGGACTTGGTACGGAAAATCATGTT
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TTGCTGATAAATCCGGAGACCTTTGAAGTCAAACTGATTGACTTTGGGTGCAGTGTCCTCCTTACTAAAG
ACTGTTACCATCACTATTCAGGTATGTAAATCCCTCAAAGCTCTAAGGAGCTCTTGTGATGGGTCAAGGC
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TTAAGTTTAGCTCCAACTTGCCTCAACACACCTGACAGAAAATGTTTAGTATACTTAGTAAGAGCTTGAT
TAGCTTGTTCAGTTTCATCTTAGTGGGGCTGGAGCTAAACACTGCAGGACACAGATCCTGGGTTTAATCA
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CAATTTGAATGTCAATGAAAAAAGCATGTTTAAACTTCAAGCCAATATTTACATGTACTGTATTTCTTTC
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CTCTCCGTGCCCATGCCTGGTTTAAGGTGATTAATACATTTTGAAGATTTTGACAATAGTCAAATGAATC
TGTCATGAGCTGAGTTTCCATCCTGATGTGAAGCACAATGTGAAGTTCACTAAATATATATTTATATATT
TTGTAATTTTAAATAAGAATTATGACCAAATAATTTCCATCAAGTTGGTCGAGCAGCTGAACTGTAGTAT
TGGTAACCTCGTAACCAACAGTAAACAAGGGGAGTATAATTGAGAAATGTTCGCTACATCAAAGTTCATT
TGACAAATGCATTTCCATCATGAACCCTTTTTCACACAAATCCAAAATGACCTCAAGTGAGCATAAAACA
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GCTGATGGAAACCCAGTTAGTGTCAGACGACAATCCTGTGTTCTTAAACTTCTTTTTTTTAATTGACATT
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TTCAGGAGGAGAACAAGGAAGAATGAGTAGAAATACCCTAATTTAATGGGTAGATCTAGTCATTCCAGCC
ACACCATGGTCCTATAGCTGAAAAAAATTTTGTGTAAAAAAAAAAAATGAATAAATAAAAAAGCACTTAA
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GCTAAAAAAAAAACAAAACAAAAAAAAAATAAATATATATATATATCTCAGTCGTTCCCAGTCCAGGTCC
ATATATTTTGGGTGTCTCTCTCTAAGAAATGTAATTTGAGCCAGAGGAGAGAGACTCCTGACCAAAGACT
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ACTGGAAAAACAATTAATAAAATAAAACAATAAAAAAGTTTAAAATAGAAAAATAAAAAACATCATTAAT
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TTAACTAAAATATCTTCATTATTTTCATTCAGATATCTTCATTTGTGTTCTGAAGATGAATAAAGTTACT
ACCTTTAGTATTTGCTTTAATATTGTCCTCATATACAACCTTCTCTAGTCTAATGTTTTGCTAATGTGGT
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