ZFLNCG11266
Basic Information
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Express profile
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Express in top 10 samples
| Sample | Tissue | Condition | FPKM |
|---|---|---|---|
| SRR594771 | endothelium | normal | 38.30 |
| SRR594769 | blood | normal | 29.70 |
| SRR514030 | retina | id2a morpholino | 17.46 |
| SRR1569495 | embryo | normal | 15.05 |
| SRR749515 | 24 hpf | eif3ha morphant | 14.82 |
| SRR749514 | 24 hpf | normal | 12.16 |
| SRR658541 | 6 somite | normal | 11.73 |
| SRR527836 | 24hpf | normal | 11.44 |
| SRR1205151 | 5dpf | transgenic sqET20 and neomycin treated 1h | 10.75 |
| SRR535913 | larvae | krox mut | 10.74 |
Express in tissues
Correlated coding gene
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| gene | correlation coefficent |
|---|---|
| plagx | 0.86 |
| im:7137453 | 0.85 |
| wu:fc13c02 | 0.83 |
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| igf2bp1 | 0.81 |
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Gene Ontology
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KEGG Pathway
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Conservation
| Zebrafish lncRNA Transcript | Human lncRNA Transcript | Mouse lncRNA Transcript | Methods |
|---|---|---|---|
| ZFLNCT17439 | XR_001747325; | Direct blastn |
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>ZFLNCG11266
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ACAGTATTTGTTTTTCTGACTATGGGAGTCGATGGTAACAGGTTTTCAGCATTCTTCAAAATATCTCCTT
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AAACGTCCTTGAAAGCTCCAGTGAATTGACTGTCAGCAATAATTTCAGATCCTTTTCATTCTGTCAAGCT
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GGCAGCGTTTGGCATCTGAAATGTCTCTCATATGTGTTCTGATTAGAAGTGAATGGGATGGTGAATCTCA
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TTTTTAAACTATTTAGTTGCAGTTAAGGATTAATTCCCTCAGTAATGCCAATAAATATCAAACACATTAC
TGTAATGTAAGAAATGTGATCAATTTCTCAAGTGCTTATGTTTCATGTCAGTGTTACGAGTTTATAAAAT
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TTGTTGTTTAAATGGCAAATCCATTTGCGCCACCTTGTGGACTCATGGGTGTACTAGTCTGAAAAGGTGG
TGTGTTAAGGCGAATTGTTGGTGTGTTGCTATTTTGAGGAACTGAAATATACCACGACATTGACCAACTA
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GACGTTTAGAAAAAAAAAAAAAAATAGTGATGACGGCAGCCAGAGGAGAGAATAATGTCAACTTTACTGT
CATGCCCGATAGACGCTGCATTAGATTCGCCTCGTACAAGTGGTAATTCATTTTTTTCATTTGAAGCAAA
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ACGTTCAAGGATTTAAGATGCTGATGGCCGTTAAATGCGTCATAACAGGCTTGTGAGAAGGGTCCATACA
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AATATAAAAACCACGGCCTCAATGCTTTCTTCATGTCAGGGGGCTTTTTCAGTTTATCCATGACAATCTG
CTTTTTGTTATTATTATTAGTAGTATTTAGTATATGCATATTTATATTTGTTTTAATAAAAACAAGTTTA
GATTTGTCAACCAGTCGGGTTTTGGAGACGTCTGCATCACCATAAGGGGCATAAGAATAGCACTTGTGTT
TGGATATAACTCAGTGTTTTGACTACACTTCATTATTATCGTTCATTTATTTGTTTGCTGGAAATTAGAA
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CTCACTAGTAAAGCATTCAGTTTTTCCACTTACAAGTCTGCCATTTAAGTAGCAAATGCACCATGGCGTG
ATGCAACTGACTCTTAAAGGGAATGTGAGATGAGACTCTTATTGATTTAATGCAAGTTATGCTCAAAACA
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GCACGCCTACTTTAGATTGGTAAAATAGAGCCCAATGGGTTGAGAATTGTTCTAAATATCTCTTTGTACA
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GTTCATTTTTGATGAACTAACCCGTTAATATTCATCCCAATAATTTCACATTTCATTCGACTTGATGTTT
GAGTGAGAGTTATCAAGGAACAAATCAAAAATTAATTAGTGTTTTTATATATAACTGAAGCTTGCTTTTT
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TGTGTCATGCGGTTTTATCGGAGGGCGCAAACTAACTGCGTGTGTTTTGGTATAGATGTTTATACCAAAG
ACCGGCTGTGTTTGAAGGCATTGGAAGTGCGAAGTTTGACGCTCATGCTGTGAAACAGCCCAATGAATGT
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TATACAGTGTATTTTTGTACATTTCTACCCACAATTCTTCTCAGGATGAACTTCTCTCAGGGAACGAACC
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CACCGACTCTGTTCTGGTATGTTAGAACTACCTCTTCAGTTACACATAGTCGAATCTTTTAGTTTTGTTT
TCGGTTGTTTTTGTATTTTTTTAGGAGATTAACAGCGTCGAGTCCTTTTAGTTTGTTTTACTAGTCTTCA
TCTTTTGGAGAAAGTTATCATTTGCTTTGTTTACACAGAAGTCTACCTCATTTCTCTCTTTTCATCTCCA
GTTATCGACTTATTTTTATGTCGTTCAATAGAAATCATCTGCTCATTTCTCTCTCCCTCCCTCCCTCCCT
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GAGCAGTTCTTTTGTTATAGTATTTATTCATTTTTGCTAACATTAATAACCAACACATCAGGTTAATGTT
CGCTTGTGGCTCAGGTCCATTCAAATATTAACCAATGCAGCTTTGATTTTATTAATGCATTACTAAATGT
TGGAATTAACATTAGACCGAGTTACTTTCTTTGTAAGTTTATGATGAACCTTATTGTGAAGTGTTACTTG
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GTATGTTTAACTGTTTTACTTGATTGATATTAAACCTATTATATCAACATTAAATATGTTGGAGAGAAAT
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GAAACTATACATTCTCTCATCTTGTGTCGTCACATACAAAAATAACTTTCAAAATATTATTTTATTTGAT
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CGGAGGAATCAATTATGTCATATGTATATGCTGCATATATTTCAAAATGTATCAAACATGAATTATATAT
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TTTTTAAACTATTTAGTTGCAGTTAAGGATTAATTCCCTCAGTAATGCCAATAAATATCAAACACATTAC
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CAATTAAAATAAATCCCTAAAGGGACAGTTCACCCAAAAATGAAAATTACCATAATCATTTATTCCCCTA
TATATTTGAGTTTCTTTCTTCTCTTGAAAATAAAAGATATTGTGAAGAATGTTGGTTATTGACACCCATT
AACTTTCATAGTAGGTAGCATTTTTTACTTTGAAAGTCAATACATTATCATGCACCCGGCGCAACAAGAT
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