LncRNA Gene

ZFLNCG11333

Basic Information

Chromesome: chr20

Start: 54253234

End: 54258509

Transcript: ZFLNCT17570 ZFLNCT17571 ZFLNCT17572 ZFLNCT17573

Known as:

Genome Browser
Express profile Download
Express in top 10 samples
Sample Tissue Condition FPKM
SRR886455 128 cell 4-thio-UTP metabolic labeling 47.66
SRR886456 256 cell 4-thio-UTP metabolic labeling 41.23
SRR886457 512 cell 4-thio-UTP metabolic labeling 37.21
ERR023144 brain normal 29.23
SRR1299126 caudal fin One day time after treatment 20.39
SRR748489 egg normal 19.96
SRR1299127 caudal fin Two days time after treatment 18.85
ERR023143 swim bladder normal 18.30
SRR1299128 caudal fin Three days time after treatment 18.07
SRR1569491 embryo normal 17.92
Express in tissues
Correlated coding gene Download
gene correlation coefficent
si:dkey-43k4.3 0.60
LOC100535468 0.55
hsd17b7 0.54
LOC100334729 0.53
zgc:175214 0.52
vamp5 0.51
Gene Ontology Download
GO P value
GO:0006906 8.72e-03
GO:0090174 9.14e-03
GO:0044801 1.17e-02
GO:0061025 1.21e-02
GO:0000209 1.27e-02
GO:0042787 1.32e-02
GO:0048284 1.34e-02
GO:0043161 1.53e-02
GO:0010498 1.53e-02
GO:0016050 1.86e-02
GO:0016021 2.19e-02
GO:0031224 2.23e-02
GO:0044425 2.90e-02
GO:0016020 3.34e-02
GO:0005484 8.50e-03
GO:0000149 1.91e-02
GO:0061630 1.99e-02
GO:0061659 1.99e-02
GO:0004842 4.12e-02
GO:0019787 4.25e-02
KEGG Pathway Download
KO P value
ko00100 8.72e-03
ko00140 1.70e-02
ko04130 1.82e-02
ko04913 2.60e-02
Conservation
Zebrafish lncRNA Transcript Human lncRNA Transcript Mouse lncRNA Transcript Methods
ZFLNCT17573 NONMMUT134907; Direct blastn
OMIM

OMIM of this lncRNA gene hava does not exist!

Sequence Download
>ZFLNCG11333
CACACACACACACACACGCGCACACACACACACACACACACACGCGCACACACACACACACGCACACACG
CACACACACACACAAAAGAATACAATGAGCAGACCCGTCTAAGATGAAAATATAAAACACGTCTTCTTTA
TTTCCTGTATATAGACATATACCACTTGAGATTTGGAGAAGAGCACATATGAAGGCTATTTTTAATGATG
GATCTCATCAGACAGCTGAATGCAGAGACAGAAAAGATCTCAATTACAAATAGTAAAAAAACCAACAAAA
AACATCAGAAATTAAACCTCTAAAACATTTCTAACGCAGATACAGAAGTCTGTCAAATACAACTGTCTGC
AAGTGGCTAATAACTGTTTTCATCTGTACACGAGAGAAAAGATTTGTACAAAATAAGAGATCTACCACTC
AATAGGAGATGGATCATAACAGTACATAATATGTACAATATCAGATGAAGCCGTGGAGTAGGGGGACGCG
GACTAAAGGACACTTTGCAGTATTTTTCTTTGTCGTCAAATGAGTGAAATTCACCACAATAAAAGCTCGG
GAAAGAAACGTCTCTTATTTTGAGTGATCCTTTTTTGGACACCGGCGTTTTCCGGAGGAGAAATGAATCT
TTCGTCGACTACGTTTGAAGCTCTACAGTCATAAAGAGAAGAGAATTTAAATTAAACGCAGAAAACACAG
ATATTAACGTTTGGAGACTGAAAAAAATGAGCTATTGTAATTTTGCACATTCAAATTGAACACCGACAAG
CTTATAAGGGCCGAGAAAATATATATATATATATATATATATATATTAAAATAAAAGTGCGAGCGTCTGA
AATCACGTCACGGACAAACGCAGACCAGAAGATAAACAGTTCAAACCAGGCGAAACCGGATGGAAGTTCA
AACAATGGTTCAGAAGGATTCATAAAGAAGTAAAATAAAGAGGCGTTCAAGTTTATCAGGAAGTCTATCG
TTGGGCTCGTTCGCTAAAAATCGTTTATTTATGCCATTACAGTTATCCTTCATCTACAGAAAGGCACTCT
ATGCAAATAAAGGCTTGGTCGAAAGAGAAAGTGGGCGAATAAACGCTTGAATATTGCCTGTTAGTAATGC
TTGTACTTTTAAATTTGCGTTTACGTTAACAAACAAAACTAAATAAAACATAGTAAGGCCGTTTACCATT
GTTTGAACAACCAAAACCCTCCCCTGGACGAACTTATTGCCAAAGAATTCGCACAAACGTGTTTTTTTTT
TCTTATCGATGTTTCGAACGGCAAACGTTAAGACTGAAATGACACGTAAAAGACACAAACCACCGAAGAG
ACCAAAAGTGCTGCTCTCTCGGCCTCCGAACAACCTGAGAATCGCTCCGAATACAGTCACGTCAAGTGCT
CATGCGCCTGTTTTCATTCGCTACAGGCACAGCGTTTAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGACAGAT
GAACGAAAGAGGACAGAAAGGACTGGACGAGGGTGTGGGACGGGATAGTTTGCGGGTCCGCTGCGTCGGT
GAGACTGGGCCGGTGTTCTGACGAAATGTGCTAAATCCGCAGAATGTGCTAGCGCTAGATCTGACATGTT
TCATCTAAAAAAAAAACAAGGGAAACACATCTTATTCACTTCAAATGTGTACTGGAATAAACTTCCACCT
TAAATTAAGACTGCCACCTTAAATTGGGACTACCACCTTAAATTAGGACTGACACCTTGAATTAAGACTG
ACACCTTAAATTGGGACTACCACCTTAAATTAGGACTGACACCTTGAATTAAGACTGACACCTTAAATTG
GGACTACCACCTTAAATTAAGACTGACACCTTGAATTAAGACTGACACCTTAAATTGGGACTGACACCTT
AAATTAAGACTGACACCTTAAATTAAGACTGCCACCTTAAACTAGGACTGCCACCATAAATTGTGAATAC
CACCTTAAATTAAGACTGCCACCCTAAAAATTATGACTGTCACCTTAAATTGGGGCTACCACCTTAAATT
AAGACTGCCACCTTAAATTAGGACTACCACCTTAAATTATGACTGCCACCCTAAAAATTATGACTGTCAC
CTTAAATTGGGGCTACCACCTGAAATTAAGAGTGCCACCTTAAATTGGGGCTACCACCTTAAATTAGGAC
TGCCACATTAAATAAGGACGTAAAAACAGGAGTAGCACATTTTGTCAGTTTCCAAATTACAATTAGAGTT
ACATACTACCTTAAATAAGGATTTCAACCATAAATTGGGGCTACCACCTTAAATTAAGACTGCCACCTTA
AATTAGGACTACCACCTTAAATTATGACTGCCACCCTAAAAATTATGACTGTCACCTTAAATTGGGGCTA
CCACCTGAAATTAAGAGTGCCACCTTAAATTGGGGCTACCACCTTAAATTAGGACTGCCACATTAAATAA
GGACGTAAAAACAGGAGTAGCACATTTTGTCAGTTTCCAAATTACAATTAGAGTTACATACTACCTTAAA
TAAGGATTACAACCATAAATTGTGAATACCACCTTAAATTAAGACTGCCACCTTAAATTAGGACTACCAC
CTTAAATTATGACTGCCACCCTAAAAATTATGACTGTCACCTTAAATTGGGGCTACCACCTGAAATTAAG
AGTGCCACCTTAAATTGGGGCTACCACCTTAAATTAGGACTGCCACATTAAATAAGGACGTAAAAACAGG
AGTAGCACATTTTGTCAGCTTCCAAATGTCAATTAGAGTTACATACCACCTTAAATAAGGATTACAACCT
TAAATGAAGACAGAAAAAACAGAAGTAGCATATTTGGGCAGCTTCCAAATGTCCATCCGAGTTGAATACT
ACCTTAAATAAGGTTGTAAAAACACAGGTTGGCACATTTTGTCAGCTTTAAAGGTCAATCAGAATAAATT
TCCACCTTAAATGAGGACTACCGCCTTAAATAAGGCTGTAAAAACAGGGGTAGCGCATTTTGTCAGCTTC
AAAATGTCTATCAGAGTTAAATACCACCTTAAATAAGGTATAGCACCTTAAATAAGGATGTAAAAAAACA
GGAGTAGCCCATTTTGTCAACTTCCAAATGTCCATCAGAGTTTTTTAACCCTTATTTAAGGTGGTATCTA
ACTGATTGACATTTGGAAGATTGACATACTGACTGCTTCTAAATGTCTATTGGATTGAGCTACCACCTTA
AAATAAAGACGTTAAAACAGCTGTAACACATTTTGTCCACTTAACGTGTAAATCAGAATAAACTACCACC
TTAAATAAAGATGTAAAAACACAGGTTGGCACATTCTGTCAGCTTCAAGTGTCTATTGGAATAAATGTCC
ACCTTAAATGAGGACTACTGCCTTAAATGAAGGTGTAAAAACAGAAGTAACGCATTTTGACAGCTTCCAA
AAGTCTATCAGGTTTCAATACCACCTTAAATAAGGTTGTAAAAACAGAGAGAGCACAATTTGTCAGCTCT
AAATGTCTATAGGAATGGACTTCCACCTTAAATAATGATGTAAAAACACAGGTTGGCACATTCTGTCAGC
TTCAAGTGTCTATTGGAATAAATTTCTACCTTAAATGAGGACTACTGCCTTAAATGAAGGTGTAAAAACA
GAAGTAATGCATTTTGACAGCTTCCAAAAGTCTATCAGGTTTCAATACCACCTTAAATAAGGTTGTAAAA
ACAGAGAGAGCACAATTTGTCAGCTCTAAATGTCTATAGGAATGGACTTCCACCTTAAATAATGATGTAA
AAACACAGGTTGGCACATTCTGTCAGCTTCAAGTGTCTATTGGAATAAATTTCTACCTTAAATGAGGACT
ACTGCCTTAAATGAAGGTGTAAAAACAGAAGTAACGCATTTTGACAGCTTCCAAAAGTCTATCAGGTTTC
AATACCACCTTAAATAAGGTTGTAAAAACAGAGAGAGCACATTTTGTCAGCTCTAAATGGCTATTGGAAT
GAACTTCTACCGTAAAATAAGGATGTAAAAACATGTAGCACATCATGTCAGCTTCCAAATGTCCATCACA
GATAAATGCCGGCTTAAATGAGGATGTACTGTAAAAACAGGGGTAGCAAGTAGAACCCACTGTCAGCTTT
CAAATGTCAATCATCATAAAATGTTGAAAATGTGTTCACGTATTATTAGAGTGGTAGCTCATTTCAAAAG
ATGTTTAGAGCTGACAAAGTGTGCTACCCCTAATTTTACATCCTTATCTAAGGTGGAAGTCCTAATTTAA
GGTGGATGTCCAAATTTAAGGTGGATGTCCAAATTTAAGGTGGATGCCTAATTTAATGTGAAAGTCCTAA
TTTAAGGTGGAAGTCCTAATTTAGGGTGGATGCCTAATTTAAAGTGAAAGTCCTAATTTAAGGTGGATGC
CTAATTTAATGTGAAAGTCCTAATTTAAGGTGGAAGTCCTAATTTAGGGTGGATGCCTAATTTAAAGTGG
AAGTCCTAATTTAAGGTGGAAGTCCTAATTTAAAGTGGATGCCTAATTTAAAGTGGAAATCCTAAGTTAA
GGTGGAAGTCCTAATTTAAGGTGGAAGTCCAATTTTAAAGTGGAAGTCCTAATTTAAGGTGGAAGTCTTA
ATTTAAGGTGGAAGTCCTAATTTAAAGTGAAAGTCCTAATTTAAGGTGGAAGTCCTAATTTAAAGTGGAA
GACCTAATTTAAGGTGGAAGTCCTAATTTAAGGTGGAAGTCCAAATTTAAAGTGGAAGTCCTAATTTAAG
GTGGAAGTCCAAATTTAAGGTGGAAGTCCAAATTTAAGGTGGAAGTCCTAATTTAAGGTGGATGTCCAAA
TTTAAGGTGGATGTCCAAATTTAAGGTGGATGCCTAATTTAATGTGAAAGTCCTAATTTAAGGTGGAAGT
CCTAATTTAGGGTGGATGCCTAATTTAAAGTGAAAGTCCTAATTTAAGGTGGATGCCTAATTTAATGTGA
AAGTCCTAATTTAAGGTGGAAGTCCTAATTTAGGGTGGATGCCTAATTTAAAGTGGAAGTCCTAATTTAA
GGTGGAAGTCCTAATTTAAAGTGGATGCCTAATTTAAAGTGGAAATCCTAAGTTAAGGTGGAAGTCCTAA
TTTAAGGTGGAAGTCCAATTTTAAAGTGGAAGTCCTAATTTAAGGTGGAAGTCTTAATTTAAGGTGGAAG
TCCTAATTTAAAGTGAAAGTCCTAATTTAAGGTGGAAGTCCTAATTTAAAGTGGAAGACCTAATTTAAGG
TGGAAGTCCTAATTTAAGGTGGAAG