ZFLNCG11346
Basic Information
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Express profile
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Express in top 10 samples
Sample | Tissue | Condition | FPKM |
---|---|---|---|
ERR023145 | heart | normal | 6.49 |
ERR023143 | swim bladder | normal | 3.84 |
SRR630463 | 5 dpf | normal | 3.50 |
SRR1205160 | 5dpf | transgenic sqET20 and GFP+ | 3.38 |
SRR630464 | 5 dpf | injected epidermidis | 3.06 |
SRR1299124 | caudal fin | Zero day time after treatment | 3.01 |
ERR023146 | head kidney | normal | 2.89 |
SRR1049952 | embryo | transgenic TgOMP-Gal4 and UAS-GCaMP1.6 and treated with gallein | 2.69 |
SRR1048059 | pineal gland | light | 2.64 |
SRR592698 | pineal gland | normal | 2.55 |
Express in tissues
Correlated coding gene
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gene | correlation coefficent |
---|---|
etnk1 | 0.74 |
spsb3a | 0.72 |
cbx8a | 0.72 |
pfkpb | 0.70 |
ppm1k | 0.67 |
si:dkey-23c22.6 | 0.67 |
dnajb14 | 0.67 |
LOC565221 | 0.67 |
arrdc3a | 0.67 |
LOC100005846 | 0.66 |
Gene Ontology
Download
GO | P value |
---|---|
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GO:0090304 | 1.59e-04 |
GO:0007340 | 1.61e-04 |
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GO:0006995 | 4.65e-04 |
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GO:0044260 | 5.85e-04 |
GO:0016070 | 6.11e-04 |
GO:1990904 | 8.88e-04 |
GO:0030529 | 8.88e-04 |
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KEGG Pathway
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Conservation
Zebrafish lncRNA Transcript | Human lncRNA Transcript | Mouse lncRNA Transcript | Methods |
---|---|---|---|
ZFLNCT17590 | NONHSAT176729; | Direct blastn |
OMIM
OMIM of this lncRNA gene hava does not exist!
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>ZFLNCG11346
TCCATATTTATTAGATTATCTGTACTTTTTAATATAAAAAATAATAATTATAAGCAAAAAGTAAATTAGT
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TTTATTTCAGTTCCTTTTCAATGCCATGTATATCTTTTATTCCTTTATTTATTAATTTTTATTTATTTAT
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TTCGTGTAAACTACTTTTTCAAATACTCATAATCAAAAAGCAATCTACATGTAATCCAAAAGTACCCAGA
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TAAAAGATTATCTCACTGACTACAATTTTAGTCATATAATTGATATCTGACTACAGTTCAAATGTAATCT
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ACACTCTTCAGGTCTTATATTTCACGACATATCTAGAGCGGGATAATCGATTATTTAATCAGATTACAAA
ATTAAAGTAATTAGAATAAACTACTTACATTAAATACCCATAATCAAAAAATAATCTACAAGTAATCCAA
AATACTCAGATTACTTTACCATAAATGTGTAATATAGCAGATTATAGTTCAAAAGTAATCCAAAAGTAGT
CAGATTACTTTAGCGTAAAAGTGTAATCTAACAGATTATATTACTGAAGCTTTACACTCTTCAGATCTAA
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GAAAAGTAATCTGAGTTTAATCCAAAAGTACTCTGATTACGTTACCATGAATGTGTAATCTAACAGATTA
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TCGTTACCTGTTTCATCCGGTCGAAGTCCAGCGCGTCTGAATCGCTGATGCTGCCCACCGGTCGAACCCT
GCAGACCCATTAAACACCTCATGAACTCTCTCCCCCCTCAGGGTTCAATAAGAAACTTAAATAGGAAGAT
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ATCAATATAATATATTAAAAACAGAATTACAAAGGACAGAATAAACAGCGCACATTAGAGAAAAGCTGCA
AATACATTCAACATTTTATCATGCTCAAATGAACAGCCTAGTATACAGAAGCTGAATCAGACAAATTATT
ATTAAGAATTATTAGAATTAGAAGCGATCAAATCTAATTTTCTAGAAGGTATAGTTTAAATATACTTTAT
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ATAGGGAGGATCTGCTCTTTGATGATGTTTATTCCACCCTTTATATAAAGATCAACAATCTGGGAAATCT
GTATTTGTTTATTTATAGAACATATTTGAACATGTTTGTAATTCCAATCATTGTAAGACTATATACGAAA
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TCCATATTTATTAGATTATCTGTACTTTTTAATATAAAAAATAATAATTATAAGCAAAAAGTAAATTAGT
TTGACTGTACAATATTACATACAGTTGATTATATTATGATGCGGGCTAAAAATAACATTATGCACATCTA
AACTGAAAACAAACTTGTTTAAATGTCTTTCATATGTATATATTTAAACTATATTACATAACTGTAGTAT
TTAAAAAGCAGATTTACACTGTATTAATGTTAGCTACGCCTGTGTTTGACACACACTGAAGTATGAGTTA
TATGGTAATTCTTATTTTAGATTCGTGGCTTTCTATAATCAGACAGAGTTATTAATAGCACACACACACA
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AGTGGTGTTATTAATCTGAGTGTTCCTCTATTCCTCATATCCTCAGCTTCAGCGCGCACACACACACACA
CACACACACACACACACACACACACACACAGATAAAGACACACTCATCCAAGACAAGACATCCTTCACAG
TTTATTTCAGTTCCTTTTCAATGCCATGTATATCTTTTATTCCTTTATTTATTAATTTTTATTTATTTAT
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GCAGCCAATAAACATTTTATTAACAACATGATCACAAATACTCCGATGTTTGTTCATTAGACTGAAATAA
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AGGATTAAAAAAACTTTTTTAAAAAAGTAGTGAGAGAGGTATGAGAAATGTGCTCAGGGAAATCAAAAGG
CTAATTCTGACGTGATGTGCAAATATATTATTATTATCATCATTATTATTATTATTATTATTATTAATTC
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CAGCGTTTGCTTTAATACGGCTGTAACGCTGCCGGCGGCTTCAGTGGTCGGCTACAGCAGGATCTGCGGG
GCTCTCAGAAAAGATGGAGGACCAGGGAATTATGGACATTATGTCGTGCTAATTCTACTGAGTTCATGTC
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AGAACCAGTAGCTGATTACAGTTCAAAAGTAATCTAAATGTAATCCAAAAGTAGTCAGATTACTTTAGCA
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TTGTAAAAGATAACAGATTATATACCTTTAGCTTCACACTCTTCAGATCTAACATTTCATGACATATCCA
GAGCTGGATAATAGCTATTAATACATGTAATCTGGATTATGTAATCAGATTACAAATATCAGAATATAAA
TTCGTGTAAACTACTTTTTCAAATACTCATAATCAAAAAGCAATCTACATGTAATCCAAAAGTACCCAGA
TTACATTACCATTAATGTGTAATCTACCAGATTATTTTACTGGTGACACATCTAATCATGTAATTTATAT
TAAGTATCTGATTGCAGTTAAAAAGTAATCTAAATATAATCTAAAGGTAGTCCGATTACTTTACCATTAA
TGTGTAATCTCACGAACCATATTAATGAAACCACACTATCTTCAGATCTAATATTCCACAGCATACCCAG
ATCTGGATATTAGCTATTAATATATGTAATCTGGATTATTTAATCAGATTACAAAATAAAAGTAATTAGA
GTAAACTACTTATATTAAATACCCATAATCAAAAGTAATCTAAATGTAGTCCAAAAGTAGTCAGATTACT
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ACCCAGATTACATTACCATTAATGTGTAATTTAGCAGATTATATTACTGACGACACATCTAATCATGTAA
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ACCATTAATGTGTAATCTAAGAATCATATTACTGAAGCTACACACTCTTCAGATCTAATGTTTCATGGCA
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CAGATTACTTTAGCGTAAAAGTGTAATCTAACAGATTATATTACTGAAGCTTTACACTCTTCAGATCTAA
CATTTCATGACATATCCAGAGCTGGATAATAGCTATTAATATTTGTAATCTGAATTATGTAACCAGATAC
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CAGAATACTTTACCATTAATGTGTGATCTAACAGATGATATCACTGACTACACACTCTTCAGATCTAATA
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ATTAAAGTAATTAGAATAATCTACTTTTTTAAATACCCATAATCACAAAAGTAATCTACGAGAAATCCAA
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GAAAAGTAATCTGAGTTTAATCCAAAAGTACTCTGATTACGTTACCATGAATGTGTAATCTAACAGATTA
TATTACTGCCTACACATTTCATCATGTAATCTGTATTTGCACAGTATTCAGCATGATTTTCAGGAGTAAA
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GCAGACCCATTAAACACCTCATGAACTCTCTCCCCCCTCAGGGTTCAATAAGAAACTTAAATAGGAAGAT
AACTCTGATGTATATGAGGAAAGGAAACTTCTGTTAACATCATATCTGTCTACACTGGGATGGTTAAATT
AAGACAAGCCTCCTCCAAACAACAACAAAAATTACGCAAATTCCTAAATCTGTTATTTACAGTTGAAACT
ATCAATATAATATATTAAAAACAGAATTACAAAGGACAGAATAAACAGCGCACATTAGAGAAAAGCTGCA
AATACATTCAACATTTTATCATGCTCAAATGAACAGCCTAGTATACAGAAGCTGAATCAGACAAATTATT
ATTAAGAATTATTAGAATTAGAAGCGATCAAATCTAATTTTCTAGAAGGTATAGTTTAAATATACTTTAT
GATTAGTTATTTACACCCTTCATATTTAAGAGCAAGGAGCGCCCCCTGCTGGTCCGGCAGTACTATGCGT
ATAGGGAGGATCTGCTCTTTGATGATGTTTATTCCACCCTTTATATAAAGATCAACAATCTGGGAAATCT
GTATTTGTTTATTTATAGAACATATTTGAACATGTTTGTAATTCCAATCATTGTAAGACTATATACGAAA
ACAGCATTGTGAAATAAAGCACATGTAAAATCC