LncRNA Gene

ZFLNCG11433

Basic Information

Chromesome: chr21

Start: 5812247

End: 5817739

Transcript: ZFLNCT17718

Known as:

Genome Browser
Express profile Download
Express in top 10 samples
Sample Tissue Condition FPKM
SRR658537 bud Gata6 morphant 22.99
SRR700537 heart Gata4 morpholino 18.17
SRR038626 embryo control morpholino and bacterial infection 17.94
SRR038624 embryo traf6 morpholino and bacterial infection 17.65
SRR1569495 embryo normal 17.59
SRR038625 embryo traf6 morpholino 17.37
SRR065197 3 dpf U1C knockout 16.91
SRR749515 24 hpf eif3ha morphant 15.39
SRR941753 posterior pectoral fin normal 15.26
SRR1004787 larvae impdh1a morpholino 14.85
Express in tissues
Correlated coding gene Download
gene correlation coefficent
lamtor1 0.66
si:dkey-20i20.2 0.62
nr5a1a 0.60
v-fbpl 0.58
LOC101887193 0.58
napgl 0.58
arid1aa 0.58
si:dkey-159f12.2 0.56
LOC101886105 0.56
atf6 0.55
Gene Ontology Download
GO P value
GO:0032439 2.27e-03
GO:0000956 3.17e-03
GO:0006402 4.27e-03
GO:0030728 4.54e-03
GO:2000058 4.54e-03
GO:2000114 4.54e-03
GO:0010606 4.54e-03
GO:0007049 5.91e-03
GO:0006401 5.96e-03
GO:0031442 6.81e-03
GO:0044611 4.54e-03
GO:0071986 1.13e-02
GO:0035861 1.13e-02
GO:0030014 1.58e-02
GO:0030015 1.58e-02
GO:0031224 1.70e-02
GO:0016021 1.71e-02
GO:0031902 2.70e-02
GO:0044424 2.76e-02
GO:0090544 2.92e-02
GO:1901363 1.72e-04
GO:0097159 1.88e-04
GO:0003676 5.32e-04
GO:0004801 2.27e-03
GO:0005488 4.38e-03
GO:0004958 4.54e-03
GO:0016744 4.54e-03
GO:0003677 4.62e-03
GO:0030331 6.81e-03
GO:0042974 6.81e-03
KEGG Pathway Download
KO P value
ko05162 3.59e-03
ko04141 1.17e-02
ko05134 1.59e-02
ko05130 1.71e-02
ko05212 1.97e-02
ko05222 2.25e-02
ko05200 3.66e-02
ko04912 4.03e-02
Conservation
Zebrafish lncRNA Transcript Human lncRNA Transcript Mouse lncRNA Transcript Methods
ZFLNCT17718 NONHSAT097049; Direct blastn
ZFLNCT17718 NONHSAT203516; NONHSAT203515; Collinearity with conserved coding gene
OMIM

OMIM of this lncRNA gene hava does not exist!

Sequence Download
>ZFLNCG11433
TAGAGTCTGCGGGCACGGGATAGGAAGTTGGAGGGGAAGTAGGGACCCTCGGCATCGCTGCCCAATGAGC
TGCTCAGACTCTCTTCACCAGAGCTCAAGTCTTCACTTGAATCCTCACTGTGGAAAGAGGAAAAGCCCAG
TCAACTTCAATATTCATATAGCACATTTAACCAAGTCAAATTGCTCAAAGTGCTTCACATAACCTGTTGA
AATGTACACCTTGCAAAACCCAAGTCAACTTTATTAAATAAAATGAGTGTAGTTAACTCAATTTACTGAA
AGCTGATTCTACTCATTTGAAAAGAGTTTTGAACTTAGTGTTGAAGGTAATGAGTTAAATACCTCATTAC
GTCAACTTGAATGGAGTAAGCTCACAGTACTCGTATAGATCAGGTTTTTAACTCAATTGGTTTGCTGTAA
TCGGTTTCCTCAAACAGTTTGAGTTGCTTTAACTTTTTGGGTTTTACAGTACTCAGTTGGTTTAAGTTCT
CTTCATTTATCGGGTTTTACTGTGCTCAAATTGCTTCATTTGCTTAAATGGATTATGTTCACAGAACTCA
TAAGGATTCGTTTTTGAACTTTAATGGTTTTGAGTTACATAAACTTTTTGGGTTTTATTCAAATGACATT
ATAGTCTGTGTTGGGGTAACGCATTACAAATACGGGGAGTTACGTAATACTATTACTTTTCTAAGTAACA
AGTAAAGTAATGCATTCAAATAAACAAGTAATAATATTTGAGTTACTTTTGTAAAATGTAACTAAAGTTA
CTTTTTGGTTAAATATTTTTTTTTTGTCAATTGCTAAATTTAAGTTGAGATCAGAGAATGTGTTCGTTAT
TTTGAACACATGGAGGAAAACAAATTTTGCTTTAAAATGGTTTGTATTTCACTAATACCACAAAAAGTAC
AAAAGGAGTAAACACACTGCTTTAAACTGTCATTAATCTGTATATAGAGCTCAGGACGTTCTTAGAAGAA
AGGGATCAAGCCTCAAACAACGCAAAAGTAACGTAACGCATTGCTTACCATAAAAAGGTACGCAAAAAGG
TAATTTTAGGAGAGTAACTCAATACTGTAATGCCTTCCTTTCAAAAGTAACTTTCCCCAACACTAGTCAG
ATGAAATCATGATTTCTACATGAAGTGGTTTCAGAGTTTGTTTTGGGAATGCCTTCTATTTCCATTGTTT
GTTTGGAGGCAGCATTAATGTTTCTTTAATCTTATTTAATTAATTTAAAACTTTTAATTGACTTGAGTTT
AGATTTTTATTTTTAGTTCAAGCTTGAGTAAACCAAAATATTTTAATGAATAATTTTGACACTTTTTGTT
GATGTTTTTATGAATTCTTAAAATAATATTCTGGGTTCTAGTGTTATTTTAATATTATATATTGATTTTA
TGCTAGATTATATTTGTTTTAGTAATTTTAGTTCTTAAAATGACATTCTGAAAAGCTGAATTACGTGTTT
CATTTTATATTTCTATTTGAAAAAAATTATTTACCAAATTTTAATTATATCATATTAAATTTAAATTTTT
ATTTAATATTTAAATTGAAAGATCTTATGATTTTTTTATATATATATACTTTTAATTGTATTATTCTGAA
GCTCAATATGATGTTAAATTAATATTTATTATTTATTTCTTGTATAATTATTATGTAATATAATTATTAT
ATAATACATCTATATTATATTTTCTTTACATTCAAAGTCAAATAGCTTGTAAAAAATGGCAGCATCTAAA
CTTTTCTGATCTACTTTAGTGTTTTTTAAAGTTTTACAAAGACTGCTGTTCAATAGTTTTAGAAAAATTT
GATGAAAGATGTTGATCCACCTCAAGTATTGACTACTGCATATATTGCAATATATCTAAATTCTCAAAAA
CAAAAAGTCTTGTACATTGTCTAGTCAGCCCCACCTCTCACACCCATTTCTTACTCACAGGTGATGCACA
ACCTGTGACGTGTTGGTAAACACACACACATCAAGCTTTACTCACATTCCTCAGCTGCGCCTACGTTGGC
GTGTGCACATATCTAACTTATTAGCCTTCCCAAAGCAGTGTGTCCTGTCTGGATTTTCAGCCTGTAATCA
GCTGTGTTGCTGAGCCTCAGGAATGACTTATTGCTCCTTGTGAGTAAATATGGTTGGGTTGGTTACTCGT
GTCGTGACTAACTATTTGTGGCTATCAAGTAACACAGTTGAACACCTGATAGTGGGATATAGGGCGCGGC
GTACAGGACGAACTTCAGCCTGTGCTGACGAGGCTGTGACGTAAATGGTGTGTGTCAGTAAAACGCAGAG
GGTTCAATTATGTCATGGAACTGAAACCAGATGTTTTAAAGGAAAAATGGATACATTTTATAGCAATTAT
TCCCAAGTTTGTTAGTTTGCGCTTATTCTCTAATGTATAGATCGAGTTTTGACATTTTTTTATTTTTTAA
TCTTTGATTTTCTTTGAGTTTACAAAATACTATTAGTTGCAATGTTATTTTAATGCCTTCATTATATTAT
ATTGTGATTTATTTATTTTTTATATTTTGAATTTTAACCAAATTTTTGTCATGTTGTGTGTGTTATTAAA
GGGATGGTTCAAAACTGAAAAATATGTTTAAACATTAATGCTAATTTCTGGGATGGAAGTCAATGAATCC
AAAAACAAGCATTTTTCACAATATTTTTTGTTTCTGAAAAACGAAACTTAGATTTCAGACGAGATTAAAT
GTGATTTTTTTTTCATTTTTTAGGTGAACTATCCCTTTAAGAGGTTTTTAATATTTTAATTTATACACAT
TTTTAAATTTTCAGATTGCCATTAAAGTAGCCGTCTCGTTTTTTTTTTTTTTTTTAATCTGAAAAACCTA
AAATGTTTACCTGAAATTGTTTTTTTTTTATATATAGTTTTAGTGACACTAACAAAGCTGCAAGTTTCTA
CTGCCGCAGAAAATCATTTCGACTTGGACATGAACATCCATTGCGAACATGCACGCTTGTAGCTTTCACA
AACTGAATAACGTGTCGAAATAATTTTCTGTGGTTTTCAAGCTTGACTAAAGCCATCTGTATGCGGTTAA
CCCAGATTATTTCTACCCTTTCCTCTTCTATAGACTGTATGAGTGCACTAACGCCTGCATCTTTCCACAG
GTGATCCGTTTACCTCTCGCTCTCGTCCCACACGCCCTCAGGAATGGTGGGCAGCTCAGGTATGCTGCAG
TAGCTGCTGTGCAGATTCTGTGCTGTTCTTCGAGAGACGATCCACACCAGTTTCTTGTGGTCCGGTTTGG
CACATTCTGGAGAGGAGTAATCTCTAATACACTGCCCTACCAGGCCTCGCCAGCGTCCCAGGTCAGCCTT
TGAGATCTGCAAACAGACACCGCTGCATTAGACACCAACTTACATAAGTACAGGGCACAGCGCCAGCATC
ATTTTGGATGGGACTGACGAGTGTAAACCAATAGTGTGCTGGCGTCTGGACACTTCAAGTGCTTTAGATT
CTTCTTACGCCATTGATGTAAGTGCTGTTCAAACCAAATATATATATATATTTTTGATCAATTGATTGTT
TTGAAAGTGGTTTGATTAAAATAGTTGTTCTACTTGGAGCCAAACTTATTTTTCAGTTTTTGGGAAGGTG
CAATTGTGAAACTCGTGGGAGTTAAAAGAATGACCTACTTATGAGTTTTTACCTTCAAGTGTGTCTGTAT
GCGGTGTGCGATTTCTAGCAGGTCCGCAGACTGTAAGGCCTCGATCTCAAGCATCAACAGCGACAAGGCG
AGCACCGATGGCTAAAAAAGAAAAACAACCACAATTTAAACTTGTCATGTATCTTGACCTATCCAGTCTA
TTTGTTTAAGCTCTGCTTACTTTTGCTTTGGAGAAAACAATTCTGCATAGGCAGGCTTTCAGCTGGGCTT
CCAGTTTGTCAAGATTCAGGACGTCTTTTCTGCAGGGGTGAAAAGATTTGAGATTGTATTTAGTTTGAGA
GAGATTGTCAGCTGAACTGTTTGTCATTTAGCAAGCTGTCGTGTCTAGTCAGAAGATAATCTCCTAGTTC
ATGACGCCGGCCTTAACTGTGACCCATATACTGTGAAACGCTCAAAGTGCACTTGGCAGATTCGGTTTAT
CAACCTTCACAAGACAAAGTTTCCTATGCTGAACTGTTAGTTTATCTGGTATTTACAGTTAGTTTTATAA
TGATAGCTATTCTTACCTGTTGGACGTGTGTGAAAGTGCAATGGCGTGGTACAAATGCAGGAAGGTTAAG
GCTGTGACGGCTTTGAACTGGAAGTTGAGTTTTTCTGAAATGATCTTCTCCATTCGGCTGAGGTCTGAGA
CGGTGAACTTGCACTGGCTGATGCGAATGAGCTCATGGCTGGACGAAACATTGCACTCGCCTTCAGTCAC
TCGCACGGCGATATGGAGGCAGCCAATGCTGATGCAGGCCAGATATTTGGGCTGAACCTGTATTTGAAAA
ACACAGAACAATTAGTTTTAACAGCCGAAATGTCATTTCACTCATTTCAATTTGTACACACCACAGAGTT
TAACAAAAAAACTGAAAATTGCATGCATTTTGGCTGTCTATGTACACTAACTTTTGAGGGAAACCATTAA
ATGGGTTACAAAAATTGTGACATCATGCATGTGCATTTAATTGACAATCAAAACAACACTGGTGACTACA
GGACTGTATGTGCTCAGGTGCGTAGTGTTTCTTTTCAAGGTAACATTGCTATCTACTGGCCTGGCATGGA
CAATACAGCAATTGAGCTTGTTTTGTTTATCTATGTATGTGAATCTTAAAGGAATAGTTCACCCAAAAAT
GAAGTCTGTCATCATTTACTTAAGCTTCACTTGTTTAAAACCTATTTGACTTTTTCGTCTGTTAAACAGA
ATTTAAGTTATTTTTTTAAGAAAGCTGGAAAACACTCGAGGGAGAGTAAATAGTGAGTACATTTTCATTT
TTGGGTGAACTATCCCTTAATGCAATTCAAACTCAGATGGTTTGATTTAAAATTAACTGTTTACCTTCAT
CATAGCTAGAAACCTGTCCAGCAGGTTGACGGCTAGTACAAAGGTCTGAGTGCTGTAACCGAAGAAATTG
GTCAAGCTCCAGAGATCCTCAACTCGAGCATCTCTGCATTTTGCTGAAACTCCGTTACTGTTCTGTGTGG
ATGAAGAGAAATAACATTTCATGTTTAAACTTTTATTTTTTCAGTTGCATGTTTCGTCAATTGTACATTT
GTATATAAATGTAAAGCTAATATAAAGTTGTTTTTTTACATTGTTTGAAGCAGTTTTAACATGTATTTAT
TTACATTAAGTTTTAATAAAGTTTATACGTGTATTTTAATCTACAGAAGTTAGTGAGACTTGTTTACCTC
TTGGGTGGACTCGATCAACCGGAGACCCGTTTCTTTCGGTAGATATTGAACCTCCAGATCCAAATTGCTC
TTTAGCTCCTTCATCAGTTTGAAGGCCTCCAT