LncRNA Gene

ZFLNCG11557

Basic Information

Chromesome: chr21

Start: 17733340

End: 17737933

Transcript: ZFLNCT17920 ZFLNCT17921

Known as:

Genome Browser
Express profile Download
Express in top 10 samples
Sample Tissue Condition FPKM
SRR658547 6 somite Gata5/6 morphant 7.10
SRR797914 embryo pbx2/4-MO 6.91
SRR797917 embryo pbx2/4-MO and prdm1-/- 6.74
SRR797911 embryo prdm1-/- 6.60
SRR658541 6 somite normal 6.59
SRR658539 bud Gata5/6 morphant 5.80
SRR658543 6 somite Gata5 morphan 5.72
SRR797908 embryo normal 5.67
SRR372796 bud normal 5.40
SRR658537 bud Gata6 morphant 5.32
Express in tissues
Correlated coding gene Download
gene correlation coefficent
smg1 0.61
LOC101885379 0.60
clasrp 0.59
LOC101882918 0.58
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Gene Ontology Download
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KEGG Pathway Download
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Conservation
Zebrafish lncRNA Transcript Human lncRNA Transcript Mouse lncRNA Transcript Methods
ZFLNCT17920 ENST00000438378; NONHSAT083566; Direct blastn
ZFLNCT17920 NONMMUT025710; Collinearity with conserved coding gene
ZFLNCT17921 NONMMUT025710; Collinearity with conserved coding gene
OMIM

OMIM of this lncRNA gene hava does not exist!

Sequence Download
>ZFLNCG11557
TTCCCTGCTCCTCTCCTTTTTTCTTCCTTTCCTCCCACCCCACTGTGTTCCTCTCTTGCCCCCTCGTCCC
TCCACCTGTTTGTGATGGGTCCTTCAGCTGGCGTTGTTGCAGTACCGCCTCAGTATGTCCAGCATGCTGT
GCCAACCCCCCGCCCCACCAGGCTCTGGGACCCTCCACACATACCAAGTACTTTTACCTTTTCATTCAGT
TCCACGGGCTTCCTGGAGGTAAACTTAGAATAGACAAGAGTTGGATTTAGGGGTCGCTTTCAACACTGTT
TTTGATTTGGTCTGATTATCATGTGTGAAATTGAATTAACGTGACTAAAATTTGTCTTGTGAAATGTGAT
GTTGAGAGCTTCTAAATGTGAAACACTTTGTGTTTAATAATGCATGTCTGTTTACATTGTTATTTTGTTT
TTAACACGTTTTATATGATTTGTATTCTTTTATTTGGTGTAATTCTCCCTTTTCGCCTTATTTTCACTTT
ACAAACACTACTAAACTACACAGAATATCCAGACCAAATTGCCCAGACATTTTTTTTTATTATTGTTTTC
TTTGTAGGCCTATATGTACTTATGTATGTAAAAATACATGGTTTCAGCTGTACATGTGAGGCTTCAAGTA
TGATGGTTTCAGAAAATTATTACACTGAATGTTGTGTAATGTGCTGTCAGTCATTATATGCTGCCTGTTT
ACACCCGTCTCAGATGACCAGTTTAAATGTGGACAAAAGAGACAAATTTACACTTGGTACGCTTTTTTGT
TGCCTTCTTAATATTGAGACAAATTTGAAAAGGTTTAACTATTTGGTTTTTAAGTTTAAACAATTATATT
TACACTCCATTTACAAAGTCAACTGCAACCACATGTACTGGTCGCAAATCTATACTTTTAAAATGCTAGT
AGGACTTAAATGGTGTCTAAACTATTACTTTAAACGCAAAATTATGTTAGATGACAATTAAATTTTTTTT
TTCTTTAGAAAGTAATATCAAAATATAAATGCAAAGCAAAAATTTACAAAATCTAAGCTGCCTGCCTTAA
CCAACTACAAAACTGAGTGACAATCACAGTACTAAAAAACACCTGAAATGTCCATATCTGACATAATAGG
ACAGCTTTCCTTATTAACTGCACATCCTGTCCTATCATGACATTTAAAATAATGAAGTACACCATGTAAG
TACACCATGTTCACTATAAATGATTCGTTTTGATGGAGTAGTTAAGTCTGATGTCGTACCATCCAAGTAG
TAGTCTATCATGGAATAGTATGTCATTTATGTGCTTTTCCGCGAAAGTGCTGATTCATAAAAATTGTTTT
TGTGCTTGCATTTAGTATTGTGGCTGATAGCGGTTATTCCCTTCATACATGCTCTCGTCAGCGCATAATT
TCTCTAGTCATTGCTGTCTATAGTAGTTCTGTGCCCCCCCCCCCCCCCCCTTTATTGTAGTTTTGTGACT
ACAATAAACACCATTCCAATTAGGCATGGCACAATAACCATTTTCGTGGTTTGGAAAAGTCAAGGTTTTA
AAACCGCCAAAATTTTCTGTTATACCATTTCTCCTGTATATGTACGATTTTTTTTTTATGTTTTGTTTTT
AGTTTTTAAGACAACAGCGTCTTCAGCAAAAAAGCTATACAAAGATGTCGTGTTAGTGTAAGAAATCTGT
GTTTTTGATACTAATGAAGACAGCAGAAATCAATAATTCATTTGAAATATTTAGCCTGGCATGTTTACTA
TTCAAAAATATTTTAAATGTTTCTAAAATAAAACCTATTGTGTTCAAAGGGACAAAAGTTTTAGTTTTTT
TACCCAGACATTTCAAAAGAACATATTGTAGTGCAGTAATCACAATACTGAAACCGTGATATTTTTATCC
AAGGTTATCAGACCGTCAGAATCATATCCCGGCCCATGCCTAGTTCCAATTCAGCACTAGCATCTTGAGG
ACTAGGTTGTGCAAAAATGACTCAATTGCAAGTGCAAAATACTAGGGCTATGTGATGCATTGAAATACTG
TACAATTTTGCTCCAATTATTATAAAAAAAAAAAAAACTCTAGATAATAAGCTTATTGCGCCATATTCTG
CTACCTTTTCAGCAGTCCACATTTGTTCCTCCGCAAAACAAAATTTGTGAAAATCAGTGAAATTGTTTAA
ATGTGACTTTTTGAAATTTCATTATCTCTAACTTTTATAGTAGTCTATTTCTTAATCCTTAAATTAATAA
TTAAATATGAAAAGTTTGGGTTCTATGGCTTACTCATTTTAATTGTGATTTTAATATTACAATATTTACC
CAAAATATTTGTGATTTTAAGATTTTTCCCTTTATTGGGCAAGCCCTACAAAGCTAGTCATACATTGTAT
TCGTGTGTAGAAATATTGAGCTGTACACAAAGTTTGCAAGTTGATTAAAATGTACAGTTTTATTACTTGG
TTTTCTGATTTAATGCTTTCAAAAGCACATTTCCAAGCCTTTAGTTCCCACACCTTTGCATTCAATTGTC
AGCTCTGGCATTTAAGGTGGCTCTGAAATGAGGCATCGAAATCTGTGTTCTGAGTTGACCCAATTACATA
GCAGTTATAATATTGCACCCAGTTTCAGTTCCCAACCTTAATTTTAATGTTGTTGTTATTATGAAATTTG
TTATTAACAGTTGTTGAACACCAGCCAATAATACTAGGTGTAAATGGAGTCCTAAAAGTCTGACGTGTGT
TTGTTATTTTTTTGATTATGTCTTAGGAGCCCTTCATGCCTTCAGAGGAGCACGTTCTTGTAGTACGTCT
CCTGGTCAAGCACCTGCACACCTTTTCCAGCAGCCTGAAGCCAGAGTCCATCTCTTCCTCGCCATCCGCT
CACTCCCACAGCAGTCCTTTGGAGGAGCTCAAGCGGTGGGTTTTACAACCTGCTAGCATCTGTCAGCTCG
TACCCCGAATCAGGCCATTGAACCAAAACATCTGTAAATCTGAGGTGGCATGTCGTAAAGAGGAGCTATT
CATCCGATCAGGCGCCGGGGACTTGATTGAACTGTCTTCTGTTTTACTGCTCTGTCAATAAGCCTCCACT
TTCTGTCTCCCACAGTGTGGTGGTGCAGAGGTTTGTCCAGCAGAAGCTGTACGTCTTCCTGCAACACTGC
TTTGGTCACTGGCCTTTGGATGCGTCTTTCAGAGCGGTAAATGTCCTTGAGTGCGCAATGATGTTTGGGA
GCCTGTTTTATATGATGGTGATATATATTTAGTGAAGGCTTTGATGGTAGGGAAATGTGTTAAGTTTAAT
GAAATATGTTTTTTGTTTCCTACTTTTGTAGGTCCTAGAGACGTGGCTTAGTTACATCCAGCCCTGGAGA
TACACTGGAGACAAAAACAACACACAAAGTGATGGTCCAAACAGAACCGTTCCTGATAAATGGTACTTAC
TGATAGAAAGTGATACTAATTCATATATAGTTTTTATTTTAAACAAATGCCTTTGTTTCTGTTTACTAAA
AGTTTATTATAAATAAATTTTGTGCTTTTATATCAGCAAATTAAAAGCATTTCTGGAGTACCATAACAAT
AAATACAAGTGTAATGTCAAGGGAAATTCAGCTTTGTCATCACAGGAATAAAATGGCATTTTAAAATATA
TTCAAATAGAAAAGTTATTTTAAGTTATAATGGTATTTAACCTCCTAAACTCTGGGACACGGTACCGGGT
CCGCAACCTCATTTACTTCCGCATTCTTTAAATTTTAAAGGTCTATACTGGCCCAATACCTTCATTAGTG
GTTCCATTCTCTTATCAGTTGGAACAGAATAACCTTTGCATAGATTATGATGGAGACATTTTCTTTTTTC
CTTTGGCTACTGACATGTGCAGGAACCACCAAAATTAATTCCAGAAACCTAGACCACAAGTTCAAATTTT
AAGTTAACAAAAAAAGCATTTTTTTAAGGGTTTAAGGGAAACCCTAAAAAAGCACTTTTAGAGGTTTAAA
ATGTTTGTTTTACTGATAATGTAAATTAAGTCTAAGTAATAGCTTTGAGGTATTATTTATTAAGGTATTT
ATTTATTCATGATGTGATTTGATTTGTTTCTGTAGTTCTTAAAGTTTCAATTTGCTCCTTTCCTCAAACT
AAACCTTTAAAACCTTATAAATCGTCTAAATTCATGAATTCCTGGCATTTAATGTTGTATGTTTTTTTTT
TTTTTTTTTTTTTTTTTTCACCTTAAAAAATTTAAATTATTCAGATTGTGTACCAATGAGATCCATGTAA
TCCACAGGGCTTCATTTGTTCAGGAGAATCTGCTCTTGTACACAAAGCTTTTCCAGGGCTTCTTGAATCG
GGCCATGCGCACAGACTTGGTCAATGCCAAAAATGCCCTGATGGTCTTCAGGGTCGCCAAAGTCTTTGCT
CAACCAAGCCTGTCAGAGATGATTCAGAAAGGTATATGATTCTAAGTGGTGTTTTCATTGTATTTAGTAT
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GAGCAGCTGTTTTTGGAACCAGAGCATGCCATACTGCAGCGGC