LncRNA Gene

ZFLNCG11578

Basic Information

Chromesome: chr21

Start: 20167195

End: 20175255

Transcript: ZFLNCT17966 ZFLNCT17967

Known as: si:ch211-191j22.3

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Express profile Download
Express in top 10 samples
Sample Tissue Condition FPKM
SRR1648856 brain normal 41.04
SRR1049952 embryo transgenic TgOMP-Gal4 and UAS-GCaMP1.6 and treated with gallein 38.71
SRR1299125 caudal fin Half day time after treatment 36.81
ERR023143 swim bladder normal 36.17
SRR527844 24hpf normal 35.22
SRR1299127 caudal fin Two days time after treatment 33.33
SRR1205169 5dpf transgenic sqET20 and neomycin treated 5h and GFP+ 32.61
SRR1299126 caudal fin One day time after treatment 31.44
SRR1205160 5dpf transgenic sqET20 and GFP+ 31.08
ERR023146 head kidney normal 29.66
Express in tissues
Correlated coding gene Download
gene correlation coefficent
dynlt3 0.53
tmsb4x 0.52
sft2d1 0.50
Gene Ontology Download
GO P value
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GO:0003785 8.53e-04
GO:0003779 2.78e-02
GO:0008092 4.55e-02
KEGG Pathway Download
KO P value
ko04810 3.66e-02
Conservation
OMIM

OMIM of this lncRNA gene hava does not exist!

Sequence Download
>ZFLNCG11578
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GCTGCCAATGACTATCAATGTACAACATTGTTCACAGTCAATTAAATATTGTTAATGTTGTTTTAAGTCA
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GGTATTACTAAACGAATGTATGAATATAAAACCAACTTTGCCTTAATGATTATTTGCTGCTACATCATTA
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GTGCAGAGCTGGTGATCCTCCAGGAATGTGGTTGAGAAACACTGCTCTAATAAACTTGTATCATTTTTGA
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ATCGAGGTGTTCAAAAGAGTCATGAAAACCTCCATTAGTTTGGATCAGCTGTGTTTGATAGGGTTGGGGC
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GCTGATTGTAACTAATGTTAGTTATGTACTCTAACAGCTTATTTTTTCTCTTCCAAGTTACTTTTACTGA
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TGGATAAGTTGGACTAAGCCGAAGGAAAATTAATGAATGAACATGGGTTGTATTCATTTAACACTAAGCT
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TTCTTTTAATAGCAATAACTTTTAAAAAAGAAACAAATAAAAAAAAAACTTGTTTATATTAATGAATATA
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CAATTGCGAAATGTGTTGTTTTTTTCCTTGCGGAACAAGAACAAACTTCAGTGTAAACAGGAAGATTGTG
CGAGCGGTGGCAGCGGAGCTAATACGCTAAAATTTAACTGAACTGTTTAATATACCTTAATTACCACGTA
ACGTTACTGCATTTCTTTTTATTATTAAGAAGTGCGTTATTATGGCGGAGTCAAACGGGATGACAGATGC
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GCTGAAGAGCGACAGTGCCCAGTGTAAGGATTTTCTCACTGCGGTCACCGGGCTGCAGGTCGGCCGGGAG
CTGCTGGACAGACTCTCTGGGCAAAGCAGAATAGATGCTTACAGGGTAAGAACCTTAGAACTGATGCATT
TGCTTTTTACTGGTGTCTTGCTAAAATTTACTGTGATTGTAAAGTGATTTGATGTTGAGCCTAGGCAAGG
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AATGTAAATTACAAGTGAACACTATCACTGATAGTGATTTTTTTTTACTTTAGCTATTTTTATTCGTTTA
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AATGGGGTAGCTATACATGAACAAAGAAAAGTTAAGTAAAAAAAACTAAAAAAAGAAAAACAAAACAAAA
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ATACAACCCTAAAATACTGATTGTCAATTTTACTGTCAATCTTTATCGTTTTTATATTTTTTTACTTATC
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ACTGAATGGAATCCGCTGTGTAAAACATAGGCTGGATAAGTTGGTGGGTTATTTTGCTGTGGCAACCCTG
GATTAATAAAGGAACTACGCCGAAGGAAAATTAATGAATTAAATAAATCTGTACAACATCAGAACAAATA
GTGGCAGCTCAAAACCTTTTTTTGGTATTAATACACAATTCTGACCTAGGCAATATTCTGTATCAGACAA
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GAGTGTTGCAGACTATGTGAAGAAAAATCCCAGGGCTTCCCAGCGAGAGCTCAACGCTGAGGTTGAGAAG
AACGTGCTGCTGTTTGCGTCTAGAGTGCAGGCTCTCTAAAACACTCAGTGAACACGTCACCACAGCACTG
ACCTTCACTCTTCTTTACTGACCAGACTATATCGCTGCTTTTCTTCTTTCTACCTTTTTCTTTTTGTATA
TTGATACATGTATCTGTTGAGCTTTATCTAATTTGTTTACTATGCAATTTTTATTTTATTTTATTCAAAA
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TGAGAATTCA