LncRNA Gene

ZFLNCG11598

Basic Information

Chromesome: chr21

Start: 21892062

End: 21898214

Transcript: ZFLNCT17994

Known as:

Genome Browser
Express profile Download
Express in top 10 samples
Sample Tissue Condition FPKM
SRR658537 bud Gata6 morphant 6.96
SRR1049952 embryo transgenic TgOMP-Gal4 and UAS-GCaMP1.6 and treated with gallein 5.96
SRR516133 skin male and 5 month 4.37
SRR1049946 embryo transgenic TgOMP-Gal4 and UAS-GCaMP1.6 and treated with DMSO 4.16
SRR797917 embryo pbx2/4-MO and prdm1-/- 3.95
SRR594771 endothelium normal 3.86
SRR516126 skin male and 5 month 3.71
SRR749515 24 hpf eif3ha morphant 3.67
SRR1035984 13 hpf normal 3.64
SRR1035981 13 hpf rx3+/+ or rx3+/- 3.64
Express in tissues
Correlated coding gene Download
gene correlation coefficent
nr5a1a 0.54
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KEGG Pathway Download
KO P value
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Conservation
Zebrafish lncRNA Transcript Human lncRNA Transcript Mouse lncRNA Transcript Methods
ZFLNCT17994 ENST00000443989; NONHSAT083113; Direct blastn
OMIM

OMIM of this lncRNA gene hava does not exist!

Sequence Download
>ZFLNCG11598
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ATCCTGCTTTAATAAACACATGGCAGTTCATAGTGCAAAACCTTCACTCTAAAGAAAGACTTCTTGAAAT
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TTTGACTCTCGTGCTGTCAGCTGAAGTTGATTGGCTTCAACTCGTTTGACCTTCATCCCACTGTTACTAT
TTAGCCGACTTCGTCAATTCTTATATACAAAGGATTATCGGTGCGTGTATGTTTATAGCCTGAAACTATA
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CCTCTTCCAGAAGCTCTGCTAGTTATAATTTTTAATCAATTCTTAAATTAATGCAGCCTAAGCGAAGCAA
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TAAATTAAATGTTGTGTAGTTTCACTGCTTTAACTATAAGGATAAATTCATTGCTGGAATTTGTTAAAAG
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ATATAAAAATATATTTTCTTTTTCATGTCTAGGTATCAACACATTGGGGCTGTACAGGATAGGTGGAGTA
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TTTTACATTGTTAGTAAACTTTAAGGGTGTTTTCCCACTTGAAGTTTGGTTCTCTTGGTTCTTTTGAATT
TAAATAAATTTAATTTAAATAAAATCTAAATGTACAATGTTTATTTTGCTAGTGCATATTCTTATTCTTT
AGGTGAACAATTATTTCATGCAGGGTAATCTACTGAAAAGATTTGTTTTAGTAAACTTTAATGGAATTGT
TCCTTTAGTAAATGGATTGGCACCTCAGTCAGACTGAAAAGCATTTATGTAAACCTTTTTCAATCCAATT
AAGTACCAAATAATTTTTTTTAAGAGGAATTTCTGTGTTGTACACAAATGAAGATGTGCTGCAAATATAT
GAATTTCTGATGCCTGTATGGGCAACATTATACATCAGCAACATTTTGCGTGACTACGAAAAGAAAAAAC
AGCATCCTGTTCTTATTGTGGTCTCATCTTGTGCCATCATATCCTGCTTTTGGTTAAGGTATTGTTCATG
TTTCAGTTGTACCAGAAAACAGCTAGTTTAAAAACATATTTTCAGTAATCTCCAGTGTACACTAAGGTTA
AGATGGCACATTAGTCGCATTAGCTTCAACCAAACAAAATTGCCAAGTGTGAACACATCCAAAAAATAGA
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TAAATTAAAAAATAGAAATTTATGGCTTTAAAAAGTCTTAAATTTGCTGTTCTAGGTCTTAAATATTTTT
GCACAGGTCTTATTTTTGCGATGTCCATGTAACGCTACATCTAACGCTCATTTAAATTCTTTTTGTTGTT
GTTGCTAGGTTTTTGGGGTGTTGTAGTTCTTTATTTCTCTAGTCCAATTGTAATTTGCGGTATTACAACT
ACAAAAAAGTCAACTTGCAATAGCCAGTCAGTTTTCTGATATTAAACTCGCGCGGCGAATGTGACATCAT
TTCGGCTAGCAGAGTATGCCGTTATTTCACTGACAAATGTCGCAAGCGCAGTTTTATAAGTCGGGAGCGC
TTTAATACGAGAGAGCGAATCTCTGCTCACGCACCGGTTTCCTTTGTTCATGGACAAAACTGCTTTCAAG
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TACAGTAAAGTGTGTTGAATTGTAGAAAAATATACCCTATATTGTAAAAAAAAAATAAAGCACTGGGTAG
TTTGTTTTTAATACACCTGTTGTGTTACCATAGCAACTATAGTCTTACCACAACAGAGTAATTGAAGTAC
TTTACTGTACTTCACAAAACACTGTACAGCAGACACTAGTTCACTTTATTTTAGTGACAAAATGGGATTG
ATAGTGGGATTTATTTGAAGAGTGAATAGTACAGTAAGCTATAATACCTAATCAAGTTTTTACCTATTTT
CTATCACAGTTACATTTCTGCTTGCCAGAATGACCAATAATTATTGGCTAGAAATTGCAACAGCCATGGG
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TTTAGAAAAAAAAATCTCAATGGTGAACGTGTCCAGTATAAAAGCCTTAATCCGTTTCGTGAGTTGTGCG
ATGCAGTGCCAGGTGAAAGTATAAATCTGCATTAAGATGTTTGTTTTTTCTGTAGTTCAATGGTGCATTT
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CTCGCGTGTTTTTGATATTGCGATATAGGTCTTAAATTTAATGCTTAATGGTCTTAAAAAGGTCTTAAAA
GGTCTTAAATTTGACATCTGCAGAGAACCTGCATTAACCTTGAAGGGCTAGCTCATCCAAAAATAAACTT
TGTCAAATAATTATATTTTCCAAAATGTTGATGATCGCCATTAAATTCCATAGTAGAAATAACTGCTGTG
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AATAAGTTCACTTGACCCTTCTAGCGGCCAAAGCTCCTGCAGACTTGGACCTTGATCCAGATACCTGGGA
TAACAAGACCATCACCAGTGGCTTGAAGAACTACCTCAGGTTTTCAGCTAATCCTCAAACTCTTTACCTT
TTAATAACAACACATTATCATTAGAAGAATGTACTGTAACTTATTCTGCTTCCTCCAGATGTCTGGCAGA
ACCTCTTATGACCTACAGACTCCATAAAGACTTCATCATGGCAGTCAGTGAGTTCTAGCATTGTCGCCGC
TCAGTTTACTCTTCATCACATCCATCTGCGTCTTCTCTATTTAACATTTAAATGCTCTTTTTGTATTTCT
AGAATCTGATGATCAGAATTACAGGGTCTGTGCTGTTCATGCGCTCGTTTACAAACTTCCTGACAAGAAT
AAAGAGATGCTGAATCTTCTGATCAAACATCTACACGTGTATGTAGCTTTACTTCTTGAACATTGATCTA
GAAATCTGTTTACACCTGGAATCAACGTGCGTTTTTGTTTGCCAACCTGATTTTACTAAGTAGGACATGT
AGCTGGATTAACATCTGTTGATCCTGGACCAACATCCCATTCAGCCAATCAGAATTAAGGGATATGTTTA
CATTTTAAGGCTTGTGGTTAGGTTTATGCATTTCTACATGATCGTTGGGTTTAGGTATAGGAAATAGATA
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