LncRNA Gene

ZFLNCG11641

Basic Information

Chromesome: chr21

Start: 26215316

End: 26219700

Transcript: ZFLNCT18052 ZFLNCT18053 ZFLNCT18054

Known as: LOC101883049 LOC101883097

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Express profile Download
Express in top 10 samples
Sample Tissue Condition FPKM
SRR535978 larvae normal 4.03
SRR1035978 13 hpf rx3-/- 3.52
SRR1035237 liver transgenic UHRF1 3.43
SRR658543 6 somite Gata5 morphan 3.24
SRR658547 6 somite Gata5/6 morphant 3.18
SRR1035239 liver transgenic mCherry control 2.97
SRR1708343 embryo MUTAS 2.81
SRR658545 6 somite Gata6 morphant 2.56
SRR658541 6 somite normal 2.43
SRR1035981 13 hpf rx3+/+ or rx3+/- 2.24
Express in tissues
Correlated coding gene Download
gene correlation coefficent
cdc42l 0.53
elf2b 0.52
p2ry11 0.51
arf6b 0.51
Gene Ontology Download
GO P value
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KEGG Pathway Download
KO P value
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ko05212 4.53e-02
Conservation
Zebrafish lncRNA Transcript Human lncRNA Transcript Mouse lncRNA Transcript Methods
ZFLNCT18054 NONMMUT031627; Direct blastn
OMIM

OMIM of this lncRNA gene hava does not exist!

Sequence Download
>ZFLNCG11641
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AAAAATGCTATAATGTTTAAGCGGGCCCAATACATCTCCCGATTATCCCACAGTGTTGTTTAACTGTTTG
TGTTCTTTAAGACTTTCTATTGTATGAATTACGACTGCATGGACTGATATTAAATGGAGGTGCATTTGGT
AATGCGCGTTCAGACGCGTGATGCGCACAGAAATCTGCGCTCTATGCTGAATTAGTTTCTCTTTCATCTT
TTGCAGACTGAATTTTTTTTAAATTAATAAAACAGAATACTTTAATCAAGATTGTAAATGAGTCTGGCTT
GTCAAAACGTGTTTTTTGAAGCTCACGCGGTCACAATTCTTTAATTGATCAACTATTCTGATGCACAGAT
TAAACAAATAACCCTTTATTCTCATTTATTAAGATTACATGTATCAGTATAATTGGCAACAGTCAATTGA
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TTAATATTTTTCTGTCAGACATTTGATAATTATCTCTTTTACTTTTGAAACGTTACTTTATATGTGCTGA
CTGGAGAACGTAACATTACATAATCAACGTTTACAGCAAAATAAAATAGGCTATAATTTAAAGCCTCTTT
ACACCCTTAGCAATTCTACAGTGCACTGTACAGTAGCTCAACAAATACGAGTTTAACACAAGGAATTGTC
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GAGTAGAAAGGCATCCACTTGGTGTACTTTTTATGGTTACTAAAGTTTCAAATGTGCTCCTTTTATTAAG
GCATGTTTGCTCCTACTATGAAATAATTAAGCAGGTATTTTTGAACGCAAATCAGGTATAGATGCGGCGA
ATCTCGCAAAGGGGGTTTCGGTTTCGAAGTTCAGCCTCCGCAGCGCTAGAGCGGTGACGTCACGCCCCAT
CCCCTATTGGCTGAATTTCTCTGAGAGCCCACGTTTTGGTTGGCAGATACACAAGTCACTTTTGCACCAA
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TGAGACTCGTAGCGGCAGATTTGAGCAGTTGCAGGAACATATTTGTGTTCGTGCTTGGAAAAAAATAAAT
CAAACATTCTACACACGTTCAGCTATCTTTGTGCGGATACACATTCTAATCTACAGATGTGCAAGTTTTG
TCTGTGACTTCACATTTCTGGATGCAGGTGTGTGAATGTGTTTTGCACCATATTCACTGAAACAATAGTA
GCAAAGAACATGAGCAGATGAGTTTCTGCATTTGTGATTCGTCCGATGGGATTTGTGCACCTGTACTGAA
GGATTTGTGCAGGTGTAAATGTTGCGTTGTGTTTGTTGGAGACAAAAAATACCTACACATTTGCAAATTT
GCTCTGCAAGTACAAATTTACTGATACACATTTGCAAATTTGCTCTGCGAGTACAAATTTACTGATACAC
ATTTGCAAATTTGCTCTGCGAGTACAAATTTACTGATACACATTTGTGGCTATTCTTTACAACTACAAAT
TACACTTTTACAGCTGCTTGGGAGATTTGCCCCAAAAATACCTT