ZFLNCG11827
Basic Information
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Express profile
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Express in top 10 samples
| Sample | Tissue | Condition | FPKM |
|---|---|---|---|
| ERR023145 | heart | normal | 66.11 |
| SRR1299125 | caudal fin | Half day time after treatment | 38.91 |
| ERR594417 | retina | normal | 35.73 |
| ERR145635 | skeletal muscle | 27 degree_C to 16 degree_C | 21.21 |
| SRR891495 | heart | normal | 18.64 |
| SRR1648855 | brain | normal | 17.27 |
| SRR891510 | muscle | normal | 17.04 |
| SRR1299124 | caudal fin | Zero day time after treatment | 16.67 |
| SRR1167756 | embryo | mpeg1 morpholino | 16.01 |
| SRR1648854 | brain | normal | 14.24 |
Express in tissues
Correlated coding gene
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| gene | correlation coefficent |
|---|---|
| cry2b | 0.72 |
| clk2a | 0.65 |
| arrdc3a | 0.63 |
| gpatch8 | 0.61 |
| lgalsla | 0.60 |
| LOC101884966 | 0.60 |
| nktr | 0.60 |
| zgc:158262 | 0.59 |
| spsb3a | 0.59 |
| dnajc4 | 0.59 |
Gene Ontology
Download
| GO | P value |
|---|---|
| GO:0015937 | 8.31e-05 |
| GO:0033866 | 2.89e-04 |
| GO:0015936 | 2.89e-04 |
| GO:0034030 | 2.89e-04 |
| GO:0034033 | 2.89e-04 |
| GO:0033865 | 7.49e-04 |
| GO:0033875 | 7.49e-04 |
| GO:0034032 | 7.49e-04 |
| GO:0043553 | 3.77e-03 |
| GO:0090219 | 3.77e-03 |
| GO:0044424 | 1.32e-05 |
| GO:0044464 | 4.24e-05 |
| GO:0032991 | 3.27e-04 |
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| GO:0008236 | 1.45e-02 |
| GO:0017171 | 1.45e-02 |
Conservation
| Zebrafish lncRNA Transcript | Human lncRNA Transcript | Mouse lncRNA Transcript | Methods |
|---|---|---|---|
| ZFLNCT18338 | NONHSAT163953; | Collinearity with conserved coding gene |
OMIM
OMIM of this lncRNA gene hava does not exist!
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>ZFLNCG11827
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TGGTGTGGATGCTAATATAGCTATCATTATCATCATCTTCCACTGGTGTGGATACTAATATAGCTATCAT
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TACTTCATCTTAAAGTTGTTTTCTTATTCACTCTTCAGGTCTGCTTGCCACTGTTCCATCCAACCACATA
GAAGACGCAGCAGCAAATGTAAACCGTGGAGCAATGGCGCCCCCAACACGCCGGAAGACACGAAACGACG
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GATGCTAATATGGTTATCATTTTAGTTATCGTCTGCTGGTGGATGCCAATATAGTTATAATTTTAGTTTC
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TGGACGCTAATATATTTAGAATTTTAGCTATCATCCGCTGGTGTAAATACTAATATATTTATATTTTAGA
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AACCACGAGTTTGCCGTTCCACAACAACCAGGTTAATTTAATTTTTTTTTGCGCAGAACTACATTAGCTA
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GGGACTGGAAAAAAAGAAGGGGAGGCTGAGCACAACTGTTGCCGTGGTGACAATGGCCCCTCCTCCTCGG
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GCTTTTGAATTCCGCAATGCATGCAGTGACCAGTTAGTGGCGCCGTCTCAACATGTTGAGGTATATAAAT
TTTTTTTTTCTTAAATTTTTATTAGTAGTTCTTTAAAAAAGGTCTTTAAAAAGTCTGAAGACGTCAATTG
AACAGGAAATGTTTGTGATTTTGCAAGGGAACGCAAATTTTGTCCACGACCACCACGTTTCTTTAGGGCA
GGGGTGTCCAAACTCGGTCCTGGAGGGCCGGTGTCCTGCAAAGTTTAGTTCCAACCCCAATCAGACACAC
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CCTCAGTGTGAACTCCATTGAAGGAAGTACCAATGATATAGCTAATAATTAGCAACATCAATAATGTTTT
TGTGTGTTCGCCTCGGATCGTGGCTGGGTCTCCCATGATGCCCTGCTGCGGTGTGAGGTTGTGGTCTGGT
TTTGTGGAGGTTGTGATGAGGCGCTGCGGTTTAATCTCTCCCTCTGATTGCAGACGTTACTTACCTGTCC
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ATGCGTGATCGGTGTGGACTATCCCAAACCCATGGTGAACCACGCGGAGGCCAGTCGGCTAAACATCGAG
CGGATGCGGCAGATCTACCAGCAGCTGTCAAGATACCGCGGACTCAGTAAGAGCGCAATTTAATTAAATA
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TTATTGATACTAATATAGTTATCATTTTATTTATCGACGACTGGTGAAGATGCTTCCATCGTTATCGTTA
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TGGTGAGGATGCTAATATCGTTATTGTTATATTTATTGTCTGTTGGTGGAGACGCTAATACAGTTATCAT
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GCTAATTATCAATATATTTATTGTCTGTTGATGTAGACACCAATATAGGTATCATTTTAGTTATTGACGA
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GCTAATTTAGTTATCATTTAAGTTATCGATGACTGTTGGGGATGTTAATATCGTTATATTTATTGTCTGT
TGGTGTAAACGCTAATATAGTTATTGTTTTAGCTATCGTTCGCTGATATGAATGCTAATATAATAGACGC
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TGGTGTGGATGCTAATATAGCTATCATTATCATCATCTTCCACTGGTGTGGATACTAATATAGCTATCAT
TATTATCCATTGTTGTAGGTGATAATGTAGTTATCATTATATTTATCGTCCACTAGTGTGTATGCTAATA
TACTTCATCTTAAAGTTGTTTTCTTATTCACTCTTCAGGTCTGCTTGCCACTGTTCCATCCAACCACATA
GAAGACGCAGCAGCAAATGTAAACCGTGGAGCAATGGCGCCCCCAACACGCCGGAAGACACGAAACGACG
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GATGCTAATATAATTATAATTTTATTTGTTGTCCACTGTTTGGATTCTTATAAACATGCTAATATAGTTA
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GGGACTGGAAAAAAAGAAGGGGAGGCTGAGCACAACTGTTGCCGTGGTGACAATGGCCCCTCCTCCTCGG
CACTGAAAGCGCAGCAGCAAGACAACGAGGTTTGCAGAAAATGAAAACTGTGAGGATATTGGTAATTTAA
AATTGAACTTCACTTAACGTAATTAACTCCTGTTTGTTTCAGAAGAGGCGGGAAGATGCAGAGGGTGTGG
CCTTCTCTACCTAAGCCCCACCCACCAATGGATTCGCTAAATGTGTTATAACTTCCCTTTGCGTGTTAAA
CAGTTAAACACGACTCGTCCAGATTGCGTCTAAACAATTTTAATGTTTATAAAACGAATTTTAAGAACTT
AACCAACAAATATATTTATTTTTAAAAATCTGATGTACATATGTCTTTATGACATTAAACTACAACTATT
TAATTAAAAGTCCCTCCACACCAAATGCCAAGAGAATTGTCTGTCTATTACAGCAAAACGAATATTCGTC
AGGCTAAATGAAAAACCGATGTTTTATTAACAGAATATTAAAACGATTGTTAAACTTTGGTGTTAAACGT
AATTTTAATGTAATATAAATTAAATTAAGTATGATTTACACTTTTATAATCCCAAATGCTGATTTTAAAA
ATCCGTAAATACTGTACTTAAGATGCTAAATGTACAAAGATACGAATGTTTATCAGGCTGAACGAAAAAA
GCCACATTTTTCGATATTTGTATTAATATGTGTACTCCATGAACTTGTGAACCAAAGCTCAAGTTTTATT
GGTCGCCGCTTTTTTTGTCAGTTTATATTTTAATTCGCTGTGAATGGACCTTA