ZFLNCG11838
Basic Information
Chromesome: chr22
Start: 1321063
End: 1330494
Transcript: ZFLNCT18351 ZFLNCT18352 ZFLNCT18353
Known as: LOC101885140
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Express profile
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Express in top 10 samples
| Sample | Tissue | Condition | FPKM |
|---|---|---|---|
| SRR800045 | muscle | normal | 10.47 |
| SRR800049 | sphere stage | control treatment | 8.63 |
| SRR1028004 | head | normal | 6.81 |
| SRR800046 | sphere stage | 5azaCyD treatment | 6.55 |
| SRR592702 | pineal gland | normal | 5.59 |
| SRR1049946 | embryo | transgenic TgOMP-Gal4 and UAS-GCaMP1.6 and treated with DMSO | 5.42 |
| SRR1647682 | spleen | normal | 5.39 |
| ERR023144 | brain | normal | 4.98 |
| SRR592703 | pineal gland | normal | 4.56 |
| SRR1565813 | brain | normal | 4.52 |
Express in tissues
Correlated coding gene
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| gene | correlation coefficent |
|---|---|
| LOC101885180 | 0.51 |
Gene Ontology
Gene Ontology of this lncRNA gene hava does not exist!
KEGG Pathway
KEGG pathway of this lncRNA gene hava does not exist!
Conservation
| Zebrafish lncRNA Transcript | Human lncRNA Transcript | Mouse lncRNA Transcript | Methods |
|---|---|---|---|
| ZFLNCT18352 | NONMMUT029184; | Direct blastn |
OMIM
OMIM of this lncRNA gene hava does not exist!
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>ZFLNCG11838
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TCTTTCTTCTTTGCTGTAGGCCTATACTGAAAGGCTGAATACGTTAAAGCCTATAATCACTATAGCCTAA
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AAAAACCCAAACTAAAGGTTTGATCCGGATCAAAACCAAGATTGGATTACGTGATCTAATCCGATTAGGT
AATCCGTTTTTTCTTTTGAAAAACCCATTTTCAAGATTTGATCCAATCCCTTATCCAAAATCCTAGTGGG
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AAAAAGACGCAGCTCCAGTAGGTGTTGATTGTCCTGTCTGTACTTATACGACTGTCAACAGCTCAAAAAT
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GGTTTCTTGAAAGGCGCTTTAAATAAAATGTGTTATTATTATTATTAATATTAGTGTGGGTTGTCTGGAA
GGGGGAAATATTTACGCCTAGGCTCAGTTCAAGGCAAAGGTGCCTAGTGTGAGTACAGCCTTAAATGTAT
CATACAGGGTGCAAATTTATTTAACCAATTACACATTTCAGCCAATCAGACAAATTCTCTAAAAACTAGC
CCAGAGCAGCATGTGTTGTTAAAAACTAGCTTCTTAAAATGTAATGTATTTAATTCATTTCAGATGTGAT
TGTGAAGGAGGAGAGTGAAGAACTGAGTGACGATGAGGAGAAACATCATGTCAAAAGTGAAACTGAAACT
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TCACACCGGAGAGAAACCCTACGTGTGTTCACACTGCAACAAGACATTCAGTCGGATACAACCATTGAAA
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GGTGTGGCTAGAATGTTATGAGGTCATCATTGATTGGCTGCTGGACATTGAGCTCTATTTTAATAATGTA
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GTGTTCCTGTGTTTCGGACCACATAGGTGCATAACTAACACTATCTTTAAATTACAAAAACTCTAAGCTA
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ACAATGCCTTGAAGTGTAGCTTAATATGAGTGGTTCTAAATGAACAGAAATAACAAATATCTATTAGTGC
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TTTTACTTATCTCACATAAGTATTCATTAGCGAGCCGATGGATGATGCAATACTCGACGCCCGTGACACA
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GATCCGGATTTAGTAATCCTGTTTTTGCGATCCGTGATCACGTAATCCAGCTTACTTTTTGAGCCAGTTT
TTCAAAGCAACATCGGATTGGATCAATCTGATCCGGATAGGAATTTTTCAGGATCACTAAATCTGGATTA
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GGTCAATATAACTTTATTTTTATTTGAAATGAAAACTAAGAAAATTTAATAATAAAATAATAATAATAAT
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AATCCGTTTTTTCTTTTGAAAAACCCATTTTCAAGATTTGATCCAATCCCTTATCCAAAATCCTAGTGGG
TTACTTTTGAAAAACCGAGCGCTGCTGAACTCACGTGTGTATCAGTGCGGCAGAAATCCATTTGTACGGA
ACATTTTTTACCCGAGAGCTTTTCTCATCTGGTAATGGTGGAATCCGGATTTGCTGCTCGTCTCCTTTAA
AAAAAGACGCAGCTCCAGTAGGTGTTGATTGTCCTGTCTGTACTTATACGACTGTCAACAGCTCAAAAAT
GTGTTTTGTGACCCTTTAACTGCAGTGTTTGGGTTCTTTTTTTGCCATAAAAGTCAAGATATTAATTTAA
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GGGGGAAATATTTACGCCTAGGCTCAGTTCAAGGCAAAGGTGCCTAGTGTGAGTACAGCCTTAAATGTAT
CATACAGGGTGCAAATTTATTTAACCAATTACACATTTCAGCCAATCAGACAAATTCTCTAAAAACTAGC
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GACATTCTTAAGACCTTTAGACTTGAAGATCCATCTTAGAGTTCATACAAAGGAGAAGAACTATTTGTGT
ACTTTGTGCGGAAAGAGTTTTACAACGCAGTCAACTTTAAGACTACATCAGAAGATCCACGCTGGTCTGA
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