LncRNA Gene

ZFLNCG12057

Basic Information

Chromesome: chr22

Start: 12735976

End: 12742362

Transcript: ZFLNCT18633

Known as:

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Express profile Download
Express in top 10 samples
Sample Tissue Condition FPKM
SRR800045 muscle normal 90.73
ERR145648 skeletal muscle 27 degree_C to 27 degree_C 16.64
SRR519732 7 dpf FETOH treatment 14.26
SRR891510 muscle normal 13.39
SRR1035237 liver transgenic UHRF1 11.86
SRR1049946 embryo transgenic TgOMP-Gal4 and UAS-GCaMP1.6 and treated with DMSO 10.04
ERR145646 skeletal muscle 32 degree_C to 27 degree_C 9.10
SRR519752 7 dpf VD3 treatment 9.08
SRR519727 6 dpf FETOH treatment 8.94
SRR1647684 spleen SVCV treatment 8.03
Express in tissues
Correlated coding gene Download
gene correlation coefficent
zgc:103755 0.52
ptger1b 0.50
Gene Ontology Download
GO P value
GO:0004960 5.68e-04
GO:0004957 1.14e-03
GO:0004955 1.28e-03
GO:0004954 1.28e-03
GO:0004953 1.42e-03
KEGG Pathway Download
KO P value
ko04020 3.68e-02
Conservation
Zebrafish lncRNA Transcript Human lncRNA Transcript Mouse lncRNA Transcript Methods
ZFLNCT18633 ENST00000531489; NONHSAT018749; Direct blastn
OMIM

OMIM of this lncRNA gene hava does not exist!

Sequence Download
>ZFLNCG12057
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CTATGAAGGCCAATAAGTGCCAGAAACCAGCATTTTTCAAAATATCTTTTTTGTGTGTGTTCAAAAGAAG
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TTTAACTATCAAAAAAAGGCCAAAGGAACAGTGCTTATTTCAACAAAAATAACATTTTATAATAAAATAA
ATCTCAGTGGATCATTTATTTTATTCTTGCTGAATATATAATATTTATCCTCTAAATGATTTATTTTGTT
AAATCTGAAATGCAGTTTGTGAGCGGCGCTAAAGAAATCTGCTTCACACTGTGGAGAGGAGGATACTGGG
CCGATTTCATCAATCCACTGTCAGGAAAAGCTGTAAGTACAACATTGCCTCACGCAATATTCATTTCTGT
GGTCCTGGACGATGCT