ZFLNCG12279
Basic Information
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Express profile
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Express in top 10 samples
Sample | Tissue | Condition | FPKM |
---|---|---|---|
SRR1205157 | 5dpf | transgenic sqET20 and neomycin treated 1h and GFP+ | 45.63 |
SRR891512 | blood | normal | 34.58 |
SRR372791 | dome | normal | 30.74 |
SRR372793 | shield | normal | 28.38 |
SRR1534351 | larvae | 500 ug/l BDE47 treatment | 24.04 |
SRR1205160 | 5dpf | transgenic sqET20 and GFP+ | 21.64 |
SRR516129 | skin | male and 5 month | 21.03 |
SRR519727 | 6 dpf | FETOH treatment | 18.94 |
SRR519732 | 7 dpf | FETOH treatment | 18.19 |
SRR519752 | 7 dpf | VD3 treatment | 17.93 |
Express in tissues
Correlated coding gene
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gene | correlation coefficent |
---|---|
LOC101882061 | 0.58 |
foxk1 | 0.57 |
scara5 | 0.57 |
LOC556200 | 0.56 |
LOC556289 | 0.54 |
LOC100334365 | 0.54 |
LOC561756 | 0.53 |
agrp2 | 0.52 |
kcnq5a | 0.52 |
ptpru | 0.52 |
Gene Ontology
Download
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---|---|
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KEGG Pathway
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Conservation
Zebrafish lncRNA Transcript | Human lncRNA Transcript | Mouse lncRNA Transcript | Methods |
---|---|---|---|
ZFLNCT18983 | NONHSAT166701; | ENSMUST00000118479; NONMMUT072284; | Direct blastn |
OMIM
OMIM of this lncRNA gene hava does not exist!
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>ZFLNCG12279
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TTTCTGAGACTCAAACTAGCCAACATGCGCTGCCACATGAGTTACTGTCTACCATATTCTTCTGGATCCT
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TGACTTCCTCGTTCGTACTGTTGACGGGATGTTTTGAAAGTGAAATACGCACGCCTGATTTCTATCATGC
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AACATTGTATTGCACTTGAATTTGGCAGTTCATTCGAAGTGTGATTCAACTGATATGATGTAACAAGCCT
GACAGGACTTGCTTATTCCCTAGAAAAAAGATGGCTAATGCAAACCCGTCTTTCTTTGTTTTTTTTTCTG
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ACCATTCCTGCTAAATTTAGTTCTGGTTTCCAAAATCTCACGTTTAAATTGGGCACTACCAAAACAGAGA
GAGAAAACGCTTAAAAGTGTAGGCTGTGCAAGGACTGCAGGCTATATGTTAGTTTTGTTTGCCCTTTTGT
GAGGAGACATGAGTGCCGCGTTACGTGCGGTCAGATTTACAAACATATCCACTTAATATATTTGCCACAA
CCGATTGTGTTTCATATATCGTTCATTCATTCATTTTCTTGTCAGCTTAGTCCCTTTATTAATCAGGGGT
CGCCACAGCGGAATGAACTGCCAACTTATCTAGCAAGTTTTTACGCAGCGAATGCCCTTCTAGCCACAAC
CCATCTCTAGGACACACACACTCATAAACTATGGACAATTTAGCCTACCCATTTCACCTGTACCACATAT
CTTTGGACTGTGGGGGAAACCGGAGCACCCGGAGTAAACGCAGGGAGAACATGCAAACTCCACACAGAAA
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CACTACAGCGGATGCGCGCACTCTCTCTTGCTTGCTTGCTCCCTCTCTCACTATCTCTATCTCGTTTCAA
ACCGGAAGAACAAATTTGCTGGAAATAAAGCAAAAACAACCAATTTTCACTCTTTAGTAAAATATATGTG
TCTTTAGCAGTGTGGGACACGTATACGGCTGTCAATAGCTCCAAACATGTGTTTTAGTGTACAGTTACAG
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TGCGTTGTTGATCAAACGTAACCCCCTACTCAACATTGCATATCCTTTGATGGGACTATTGAGGACAAAC
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CTTCTCGTCCTGGGACTCCTTTCCAGTCTCGTTTGCCACTCGCTGGAGAGCCATGCTTCGATTTTATACG
CGCCGCTTGGCTTTCCTAGTATTAGACAATCATTTTTGGGAGATTCCTTTTGGCTCCGGGGATGAGTTTG
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CGATCTCCAAACGGAACGTCTGGGCGTTTTCCAGAGCATGATAAAGTCCCCCTTTTTGTTTTCCTCTCGT
CTGTTTTAGTTTTACTGTTTGCATATATTTATTAGAGGGCTGCTATTTTCATAATGTAAATGT
CACACACACGCCTCCCAGCCAGAGCAGATTCCTTAAATCCTGAAGAGCCTTTCATGGAAACACACTTCTG
TTTCTGAGACTCAAACTAGCCAACATGCGCTGCCACATGAGTTACTGTCTACCATATTCTTCTGGATCCT
CGCCTACTTATTCAGGGAAATTAGTGGCGTACAGAGCACGATGCAGGTAAATGTTGAGATTTATACACCC
AACAGATACGCGATTTGTTTTCTGTGAGAGAATTCATTGGCTCGTGTGCTGTGCTTTTGGCGGCTTTCTG
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CACGTACGCAGCGTCCCACTAGCGCGGTGTTGAGTTCGTTAATATAAATACAGCGAAAATTTGATTAATA
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GCGCTCCCTATATTGTTTACCATGATACTTTGAATATTCGGTCTGAAATCAGATGTAAATATGACCTAAA
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CCACCTTTACCTCAGTAAACACTTGCATGGCGGATAATAATCCGTTATTAACGTTTTTTTCACGTAGCAA
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CAAGCTGGATTCAGTTTGAATATTGAGGCGCGAAACTGACAAAACGTAATTTGCTGAATCTAAATTATTT
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TGAGATTTTTTGTGTCACCTTGGGAAGTTTAGACTAAACAGGAGCAAAGGCTACCTGATCAACATTGCAT
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CGCCTATAAAAATAACGGCTTGATCTTTATACTGTAAAATCGTGACAAAATATCGTTATCTTGTTAATAG
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CTTCTTGGTTTAGTGTGCAATGTAAAGAATTATATGATCAATTAGTCATGACAGCATATGTTTTAGTTTA
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CCATCTCTAGGACACACACACTCATAAACTATGGACAATTTAGCCTACCCATTTCACCTGTACCACATAT
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CGCCGAAAAACTGAGCCGAGGCTCAAACCAGCGTCCTTCTTGCTGTAAGGCGACAGCTATACTTACTGTG
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CACTACAGCGGATGCGCGCACTCTCTCTTGCTTGCTTGCTCCCTCTCTCACTATCTCTATCTCGTTTCAA
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