ZFLNCG12279
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Express profile
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Express in top 10 samples
| Sample | Tissue | Condition | FPKM |
|---|---|---|---|
| SRR1205157 | 5dpf | transgenic sqET20 and neomycin treated 1h and GFP+ | 45.63 |
| SRR891512 | blood | normal | 34.58 |
| SRR372791 | dome | normal | 30.74 |
| SRR372793 | shield | normal | 28.38 |
| SRR1534351 | larvae | 500 ug/l BDE47 treatment | 24.04 |
| SRR1205160 | 5dpf | transgenic sqET20 and GFP+ | 21.64 |
| SRR516129 | skin | male and 5 month | 21.03 |
| SRR519727 | 6 dpf | FETOH treatment | 18.94 |
| SRR519732 | 7 dpf | FETOH treatment | 18.19 |
| SRR519752 | 7 dpf | VD3 treatment | 17.93 |
Express in tissues
Correlated coding gene
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| gene | correlation coefficent |
|---|---|
| LOC101882061 | 0.58 |
| foxk1 | 0.57 |
| scara5 | 0.57 |
| LOC556200 | 0.56 |
| LOC556289 | 0.54 |
| LOC100334365 | 0.54 |
| LOC561756 | 0.53 |
| agrp2 | 0.52 |
| kcnq5a | 0.52 |
| ptpru | 0.52 |
Gene Ontology
Download
| GO | P value |
|---|---|
| GO:0055072 | 9.86e-05 |
| GO:0055076 | 1.48e-04 |
| GO:0007185 | 5.69e-04 |
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| GO:0055080 | 2.65e-03 |
| GO:0098771 | 2.76e-03 |
| GO:0050801 | 2.83e-03 |
| GO:0070207 | 3.41e-03 |
| GO:0098662 | 4.19e-03 |
| GO:0005576 | 1.85e-03 |
| GO:0008076 | 1.86e-02 |
| GO:0034705 | 1.86e-02 |
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| GO:0005581 | 3.09e-02 |
| GO:0034703 | 3.86e-02 |
| GO:0070287 | 5.69e-04 |
| GO:0001664 | 7.89e-04 |
| GO:0005001 | 1.14e-03 |
| GO:0070996 | 1.14e-03 |
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| GO:0005251 | 1.47e-02 |
| GO:0005044 | 1.64e-02 |
KEGG Pathway
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Conservation
| Zebrafish lncRNA Transcript | Human lncRNA Transcript | Mouse lncRNA Transcript | Methods |
|---|---|---|---|
| ZFLNCT18983 | NONHSAT166701; | ENSMUST00000118479; NONMMUT072284; | Direct blastn |
OMIM
OMIM of this lncRNA gene hava does not exist!
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>ZFLNCG12279
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CACACACACGCCTCCCAGCCAGAGCAGATTCCTTAAATCCTGAAGAGCCTTTCATGGAAACACACTTCTG
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TGAGATTTTTTGTGTCACCTTGGGAAGTTTAGACTAAACAGGAGCAAAGGCTACCTGATCAACATTGCAT
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CACTACAGCGGATGCGCGCACTCTCTCTTGCTTGCTTGCTCCCTCTCTCACTATCTCTATCTCGTTTCAA
ACCGGAAGAACAAATTTGCTGGAAATAAAGCAAAAACAACCAATTTTCACTCTTTAGTAAAATATATGTG
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TGCGTTGTTGATCAAACGTAACCCCCTACTCAACATTGCATATCCTTTGATGGGACTATTGAGGACAAAC
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AAGAACTCTACGAGCGGAACTCTGTTTTGGAGAGGGAAAACGCAGTATTGAAATCTCTGGCCAACAACGA
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