LncRNA Gene

ZFLNCG12545

Basic Information

Chromesome: chr23

Start: 20637009

End: 20643474

Transcript: ZFLNCT19379

Known as: LOC103909676

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Express profile Download
Express in top 10 samples
Sample Tissue Condition FPKM
SRR514030 retina id2a morpholino 1.78
SRR1648856 brain normal 1.26
SRR514028 retina control morpholino 1.24
SRR1205151 5dpf transgenic sqET20 and neomycin treated 1h 0.58
SRR1205154 5dpf transgenic sqET20 0.51
SRR1648855 brain normal 0.51
SRR801555 embryo RPS19 morpholino 0.48
SRR1534350 larvae 5 ug/l BDE47 treatment 0.44
SRR1648854 brain normal 0.40
ERR594418 retina transgenic flk1 and develop tumors 0.38
Express in tissues
Correlated coding gene Download
gene correlation coefficent
six6b 0.59
six6a 0.58
mab21l1 0.58
atoh7 0.57
tfap2e 0.57
pou4f1 0.57
sox12 0.57
pcdh10 0.57
barhl2 0.57
tfap2b 0.57
Gene Ontology Download
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Conservation
Zebrafish lncRNA Transcript Human lncRNA Transcript Mouse lncRNA Transcript Methods
ZFLNCT19379 ENST00000608023; NR_135299; NONHSAT009146; ENSMUST00000194584; NR_015566; NONMMUT004504; Direct blastn
OMIM

OMIM of this lncRNA gene hava does not exist!

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>ZFLNCG12545
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GCCTGCACATATGAAGGCGACGCCATACCTTTCAGCACGACCGATTTCAAATGGTGCTAGAAAAACCCAG
TCCACTCTGAACACCAGAGGAAATCAGTCACGCTACAGAAGGTAAAAGCATAGCGGAGGAGTTTTTTTTT
TTTTTTGTGCTGCCACTTTAAATGAATTTAAAAGGTCAAACAAATCGAAATGGCAGTCTTGGTCAGTTTA
AACATATCTGCTAATGAGGAAAAAATCTTCTTCTAGTCTCTGACCAGTCTTATTTACTCATTTCGATTTA
TGGATTGCTTCTTTAGGAGATTTCCAGACATAGCATGCACATTTTTTTCACGTTTTTGGTGGCCTGTGTG
TCTCAGTGGTAATTGGAGGGCCCCTCTGAAGGACGCGGCAGTGTGTCACTGCAGTTTATCCATGGACCAT
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AGGCACATTTAGTCCACTATTTATTTTACTAAATTGTTTAGTATTTTCCTTTTATATTTTCTTTTTCTCA
TCAGAGTAGAAATGTGGATATTCTATACAACGTATGAAGCTGATCGGTCAGTTCTTGTCAGGTGATCACA
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GCCTCAGTGTTTAATAAAGTATGCATGGGGATTCACCTCTGTGAGCTCTGAACTTTGAAGTTGCACAAGT
TTGGCACAACTTTGTTTAGATTGTTTAGTCAGTTGCTTTGTGCAGAAACGCAGTGTTGAGAACCCCTACG
ATTAATTAATTGTGACGATTTAAATGTGGTCAATATTGAAATGAGCTAATCATTGCATCCCTAGTATCAA
TATGTTAGACTTCTGCATGAAGCTAAAGTTGCCAGTATGATGATATTTTTCCAACTGAAACTGAATATTG
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GGCATGGCTAAGTATATTTTACCCTAGCAACACAGAAGGACTGCTTTTTCAGGGTTAGACTTGGATTAAA
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AGACTTTATGATCATCTATATGTTAGTATACTCCAAATCATTGAAAAATAAAAAAATAATCACTCTTAAG
CTTCATATCAGATATTCTGTGCTAACTAGAATCTGATGCGTTCCACCCCATAATCCTGCTTATTTCAAGA
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TAAAGACACACTACACATATGGCATGTATGCACATCTCGACATGTTGGTAGTCACTACACACATACATAT
AAACACACACACCCACAATGAAATTAGAGCATTCATCTTTAACATTTGTTTTAGGCTTTAACCTGCTCTC
TTGATTCCATATGATTTACATTTATACAACATTTTGAGAAACAGAGATTCATAAAAGCAACACATTCCAG
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CTTCTTCAAGTATTTCTGTAATGATTTATGACATTATTCTGTCATCATTTACTCATTATAATGTAGTTGC
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TCTCCTTATTATTAAAATGTTGCCTGTTTATTGTATTGTATAAAGTAGGATTTTATTCTACATCCTTAAT
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ACATGAATCGTCAAATAATATTTACAGCTTTCAAACTTAGCTCACTGTAACCCAATGTGATTCATGTTTT
GTGAATAAAAGCTAAAATAAAACCAGTTCATCGCATTATGCCATCTCCTCTCTAGACTTGGAAAAAGTGT
ATTTGTTCATTTCTTTAAAATAGTTTTAAAGCTTCAATTGCTATGTTTCCATACAGTAAATTGAATTCAT
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CTGCTGGTTTGTCCATTCACACACATTTTTATCATCACGTAAGTAGGCTAAAACATGACACAAAACATGA
TTTCAGTAAAAGTGTTTCCATCATAGTTTATGCACATTTTTCCTTTTCAAATAAATAGTTTATCCAAATC
AGTTATGTGCATAAGTTTTTTGTGCACATTTTCAACATTTATGTCCATCAACCATGTGCATATCCAAAAT
GTGCATGAAAATAGGTGGATGAAAAATGTTTTGATTGAACAAGTTTTAAAAGAAGGTACAGGACTTTCTT
AAATTTCATTAAAATATTTGAGTTTTAGAGATTACGAGAAGTCTTAAAGGGATAGTTCATCCAAAAATAA
AAAATCCTTTACCATTTACTTACACTCAAGTTATGACTGTTTTGCCTTACTCCACTTAAGCACAAAACAA
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TAGATGTCAATGGCTCGTTCGCCCAGCATTCTTCAGTATATTTTCCATTGTGCTCAGTTGAAGAAAGGAA
CAAGTCGAGAATCATTTAATGATGACAGAATTTTTATTTTTGGTGAACTGTCCCTTTAAGGGTTTAAAAC
AACCTGAGGGTAAACAAACGATAACAGAATTTTCATTTTGGCCTGAACTAATCCTGTCATTTTCTCTTAT
CCAGTATAACAATTATACAGTAGAAAACACACTGATCACTAGAACAATTTTCACTATTAGTCTTGAAGTC
CAGAACAATTTTCGTCTTACAATATGTCACTAAAAAAAGAACAACTTAGCATTGATTTGACAGCAGTTAC
TGTTAAGTCTTGTACACTGTAAATAATGTTTAGTTCCATATAACCGATTAGTGTTGGGACAACGTGAAGG
AAGTTAGTGTATGAATATGAATATGAATATGAGTATGAAACAAAGTTAATGAATAAGATTGATCATTAAA
CAAATATGTTGACCCAGACAAAACTCAAGAATTGTGTTGATTCATCTCATTTTAAATAAGCAGTTTGAAC
AAACAGCAGTCATTTTTGGAGTGTACAGTATGATCCTGGTTATGTAGTGAGACTGGGGGCTGGTCTGTCT
GATGTGAATTAGGTCAAGGCTGTTTTCTGCACTGCAAACCAGGGCTGTTTGACTGAGTCCTCCATGTGCA
TTAACCAGGACTCAAACAGATATGAACCAACTTGTCCACTGACACTCCCTTATCATTAACTACTAAAGCT
TCTCATTTACAAAAAGTAGTTGAATCTAATTTAGTTTTTTTTGTGAGTGTGTGACCTCAAGGAGAGCACA
TGGCATTGGGATAAATAAATGTGGGTTTATTGTAAACTTAAAGCAATACTACATGATTCACTGTAATGAA
ATTCTTCAAGGGAACACTTGGAGTTACACTATGTTCTTTAAGTGTTTCCTATATATATTTTTTAGAATAT
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TTATTATTATTAATATTATTATATATAACATAATTGACATAATTATATAACTACAACTAGTTTGCTATTA
CATAGAAATATTACCTTTTTACATTCATTTAACACTTACCTGAGAGAGTAAACTGGATTAGCAGCTGAAA
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