ZFLNCG12649
Basic Information
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Express profile
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Express in top 10 samples
| Sample | Tissue | Condition | FPKM |
|---|---|---|---|
| ERR594418 | retina | transgenic flk1 and develop tumors | 2.75 |
| SRR801556 | embryo | RPS19 and p53 morpholino | 2.48 |
| SRR801555 | embryo | RPS19 morpholino | 2.39 |
| SRR1048061 | pineal gland | dark | 1.97 |
| SRR1291417 | 5 dpi | injected marinum | 1.89 |
| SRR1562533 | testis | normal | 1.76 |
| SRR1167763 | embryo | ptpn6 morpholino and bacterial infection | 1.75 |
| SRR592698 | pineal gland | normal | 1.52 |
| SRR1005530 | embryo | RPL11 morpholino | 1.50 |
| SRR942772 | embryo | myd88+/+ and infection with Mycobacterium marinum | 1.40 |
Express in tissues
Correlated coding gene
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| gene | correlation coefficent |
|---|---|
| tmie | 0.79 |
| uts2a | 0.79 |
| si:ch211-106h11.1 | 0.76 |
| LOC101884183 | 0.76 |
| b3gat2 | 0.76 |
| si:ch211-117c9.5 | 0.76 |
| atp1a1b | 0.75 |
| chrna3 | 0.75 |
| eef1a1a | 0.75 |
| fgf12a | 0.75 |
Gene Ontology
Download
| GO | P value |
|---|---|
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| GO:0005230 | 5.50e-11 |
KEGG Pathway
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Conservation
| Zebrafish lncRNA Transcript | Human lncRNA Transcript | Mouse lncRNA Transcript | Methods |
|---|---|---|---|
| ZFLNCT19532 | NONMMUT115471; | Direct blastn |
OMIM
OMIM of this lncRNA gene hava does not exist!
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>ZFLNCG12649
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AATTCAACTTAGTAGGTTGTCATTTTTTCCCCAATATTTTGCTTGAATTTAATTGTATCATCTTTTAATT
TCTAAATATGTTTGCTGACTAAAATATTATTTTAATAAATATATCTGTTTAATAAATCTGTTTTGTTTAA
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CTCAATTATGCTGAGCACTGAATACATTCTGACATAGTAATTAGCACAGTAATAAAACAAAAGCGAAATG
TTTATAAATATTTTAAAAGACAAAGACTATGTTCTTTACCTGCGCAGCTTCCAGCGATTCCCAGGTGGAT
CTGGTTGTGCAGAACACTGCGTTACACTGAGCTTAAAGAGTCTTCTCCACAATTTATATCCTCAGAGGAG
CCTGAGCAATAACCTTGTGTTACCTGGTCCATAAACCCTGCCAGGAACTGAC