ZFLNCG12858
Basic Information
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Express profile
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Express in top 10 samples
Sample | Tissue | Condition | FPKM |
---|---|---|---|
SRR594771 | endothelium | normal | 52.17 |
SRR038626 | embryo | control morpholino and bacterial infection | 38.24 |
SRR776509 | embryo | Salmonella infected | 35.01 |
SRR038624 | embryo | traf6 morpholino and bacterial infection | 33.68 |
SRR776510 | embryo | Salmonella infected and miR-146 knockdown | 33.31 |
SRR776507 | embryo | normal | 32.42 |
SRR038627 | embryo | control morpholino | 31.81 |
SRR776508 | embryo | miR-146 knockdown | 31.62 |
SRR1708345 | embryo | SIBAS | 31.19 |
SRR514030 | retina | id2a morpholino | 28.14 |
Express in tissues
Correlated coding gene
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gene | correlation coefficent |
---|---|
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Gene Ontology
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KEGG Pathway
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Conservation
Zebrafish lncRNA Transcript | Human lncRNA Transcript | Mouse lncRNA Transcript | Methods |
---|---|---|---|
ZFLNCT19921 | NONMMUT135115; | Direct blastn |
OMIM
OMIM | Phenotype |
---|---|
121050 | Contractural arachnodactyly, congenital |
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>ZFLNCG12858
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AACTCATATGCAGTGCTCAGCATATATGCGCACACCCCTTACTAATCTATCCAAATTCATGATCAATGGG
AAGCTCTACAATGTTATATTTGTGCATATACATGAGATTAGTCAGTACCGAAGCCAAATCTAGAGCTTAT
CTAAAGAGATAACTTACGATAACCATCCAAAAATAATACAGCCAAATTTATATGTTATAAAAAAATATTT
AAAACAAATTGAAAAATCAAGAGAAGTAAAAAAAATGGAAAATTAAGCTGGATTGCAGTATTTTGCTTGA
ATTTAATTGTATTAATTTTCAATTTCTAATTACGTTTGGTGACTAAAATATTACTTTAATAAATATATCT
GTTTAATAAATCTGTTTAAATGCAGCAAAACACATCGCCTATATTCACTGAGAAATGCAGCAAAATATTA
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CCACGGACCCTCGCGCCGTGCGGTCGGTCCAGCAGACCACCGTCTCTTATGCACACCCGCCGGTGCCATG
TCCATCCGCTCTGCTCCTCATCCTTCCCATGATGCAGTGCTGATGCAGACGCTACAACCGTCAGACCTCC
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TGAGCTTCTTAGAGAACGGATTTATTATTGAGTGTGCTTCAGTGTTCATTCATCTCTGTGATTCAACGCT
GGTGGTTCAGTGGTTAGCACTGCAAGAAGCTCTCTGGTTTGAGTCTCGGCTGGATCAGTTGGTGTTTCTG
TGTGGAGTTTGCATGTTCTCCCCGTGTTGGTGTGGGTTTCCTCCGGGTGCTCCGGTTTCCCCCACAGTCC
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ATAATGATCCTCGTCATTTTCAGATTTTAATATATGTTTGTTTGCTTCATAGTATTGTGCAATCTGTTAT
ACATTTATGATTCTTTGTTAAACAGTTTAAAATGAGAGCTTTTGTGAATAATATCAATATTTTTATTATA
AATACAGCTATAATATGTTTAAAACATGCATATTTACTGTCAAAACTAAACTGGAAATGAAAGCTTTTCT
TTTGAACTGTTTCTTTTGTTAAGAATCCTAAAAGTAAAATGAGTAAATACATATACAACATTTAAATGCA
TATATATATATATAATGTAAAAAAAGAAAAGATTGCAAATTCAAGACCACTGGGCTGCCGTGCCACCCAA
TCTAGGAGAAAAAAGGGGGATGAAGGAGATGAAGGAGGGATTTCTTCTAGACCAGGAGTGTCCAAACTCA
GTCCTGGAGGGCCGGTGCCCTGCAGATTCCTGCCTCAACACACCTGCATGGATGTTTCTAGAACGCCTAG
TAAGAGCTTGATTAGCTAGCCCAGGTGTGCCTGATTGAGGTTGGAACTAAACTTTGCAGAACACCGGCCC
TCCAGGACCGAGCTTGGACATGCCGGTTCTAGACAAAGACGATGTGTAATGAAGACTGGGGTTATTTAGA
GTAACGTAGGCATCATATGATTGGAGGATCATGATGAGCTGATGCAGCACCGGCTGTGGTCAATCATAAG
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AGAATCCTAAAAGTCTTTTCAGCTCTGATGATGATTTAGTGATTTAGTGATTTTCCACCAGTAACAGCCG
AGCTTAACATATCCAGACATGAACAGAAGAGCAGAACTCAGCGTTGAGTCGCAGGAATGAATGAAATATG
AAGCTCATTCAATAAGAGCGCACTTCTCTAAAGCTGCAGTGATGCGTCACAGTTCAGCTGGGTTTCAGAT
CAGATAACGGCAGTTTCAGTGAACAGAACTCCTGCAGTCTCCCAGCGTCTGAGCGCTAGTGTGGCTCAAT
ATAGCAAACTTTACTAAGCCATAGCTTTTACAACACATCGTGGCGACTTTTTCTAAGCGAATGTACACGA
GCAACTCTGCTGAAACTCTTATGGGACCAAGCGTTCACATGTACTGTATAAAAGCCAACACACACACACA
CACACACACACACACTCATGTAGCAGCGGGCGGACAGTGTCAGCAAGCCTGCAGGACGAGAGCGTGCGGA
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GAAGAGGATCACCTCACTGCTAATCAGCACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACAC
ACGTCTATACTTTGTTTACATTCACACCGATATGCATTTAAATAGTCTGATTTACGGGTTTACATGCTAA
CTGATGACCTGCCAACACACACACACTTACAAACACACACATTTAAAAACACACACACTTTCACTCACAC
ACTCACGCAAACAAAACCACACACTCACACATGCGCTCACTCTCTTTCTCTCTCTCACACACACACACAC
ACACACACACACACACACACACACACACACACACACACATGTATTTCAGCAGTGTGAGCACTCGTATATC
TGTAGCTGTTGTGTTTACCGCGGTGCAGTGAATCGCCGTCAGCATTGTTAGGATCATCTTTAGTCTCTTC
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GCGCGTGTGTGTGTGTGTCTGACTCTGCTTTGGTTTCTATGCGTTTAGCAATAACAACACACACACACAC
ACACACAGCTCACTTATATTCTCATTCTGCTGGACTTGTGTGCTGTAGAAGCTGAAGGTGTGTGTGTGTG
TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTTGCTTCACACACC
AGTGACTCCTCAATGTGTCTATGTAATGTGTGAGCCTAGCTTCTATAAATAATGTGTAGATGTATATAAG
TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTGGTACAGATGTGAACTGAAGGAAAAACTGTGTG
TAAACTCGGCAACCGCAGGAGAAACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACTGA
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AAATAAAAAGCCAGAGATGAAGAAATATTGAGTCAAAGACAAACTGTCCTGCATCATATCAGTGTTTATC
AGTGTCTGCTTTCATACTGCAGTGGCGTTTGTGAAGACTTGTTAGGATGATGTTGTGTTCTCCTCGTGTG
TGGAGGATAGAGTGATGATAGAGTGATGTGTTGCTGGAGGAAACTGATCTCTTATTCCGTCAGATTGAAA
ATCAATATTTCCAGCAGATATAGCCGTGTGTTGTGGGGCCGGCTGCACCAGCGGTGTGGAAGTTAACTTG
GTTGTGATTTAAAGGGACTCGTAAGCTATTACTCTAAATATATTAGTGTTCCAGCACTGAGCTCAGTGTA
AACACACGCTACGCTCCAACACAACGTTTACTGCAGCATCCCCTCATGTTTAATGCTGGGAAAGAGATTC
GTTCACGCTGATCGTGCAGAATGATCTCCCTCTGCTCACACTTGTTTATTAATTTGTGTTCAGGGAACAA
GAAGTTTCATTTTCTCTTATGCAGTGTTTTGTTAATAGTATCCATCAATCAAATCAAGATATATTGTTGG
ATATAAAGACCTGAGAACAAAGTTTAATGTTTGATAAGCTCATGTGTATTGTGCGTGCATTCACGGCTCG
CGATGCAGGTGTGTGTGTGTGTGCGTCTGTTATTAGTGACGGACTGTAATGACATGCACTATAAAAATGC
AGTTCATCATTTCATTTTAATTGGACAGTTATATATATATAGATGCATGCATTAGTGTATTAAATGCTTT
ATTTTTTACCTTTATTATGTAGGACAGTAGAATACATGAGGAGCAGAGAGAGGGGAGAAGGATCGGCAAA
GGACACACGGTCAGGAATCAAACTCAGATCACCGTGAGCGCTTCAGTGCTACAGTTTAAGTCAGAATTAT
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GCTGAACACTAGTGTCTTGAAGAATATCTAGTCTAATATTGTGCTGTCATCATGATGAAGAGGAACACAT
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AAGAAAAGGGCAGCTTTTTGTCTTTGACTCCTCTAAAGTTCACAGATGTTAATAAATATTTCTGTCTTGT
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GAAGTTAATATTATTTTTATTTCCTTCCCCCCTGGTCAGATTATTCTGCTTGTTTTAATGAAAACCTCAC
TTCATATTTCTGAAAACAAGACCACATGTTTACTTCTTTAGCAAATGCTTCTCGATTATTAGAATTGTTA
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GCTCATTGTTAGTGTTAGATTAGGCATTATCCACTGAAACCTTATTGTCGAGTGTGTTATGTGTCATCAG
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TGTGAATTCTCAAATGTTACCTTCCATACATGTAGCGTTTCAATAAGATGGAAACTGGTGTTAGATGCTG
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AAGAACGCTGTGAGCTTGAAGTCGTCATCTTATTCAGAATAAGGTCAGCGACTCTGTCTGAAATCGCCTA
CTACTCCAGTGTTTAATTTTACTACGTGACCGTAATCTGTTCGATATAGTATGAATCTAATTCGTTCATC
CATTGTTCACATGACCTATTGCTTCACTTCGCCTACGTTCATGAATTCTCTTGCGGTGCATTATGGGATA
GCTCAGCGTCCATCAGATGCGCACATACCATATTATATTTTTGGCAAAGTTATGGAGTTTGCGCAAGTAA
AAATAAAATCAATTTAAGCACAAATTTAACAAAAAACATCCTTCAGAACATCTAGAGCAAGTGATGTGAA
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GCAGCGTACATATGTATAAAGACAAGTTGCTTTGAAAATGCTGTCACATTCACGTCAAAAGCGTTTCAAA
TGCAAGGAAAAACTTCCATTTTTGACTGTTGTTTTTGTTTAAACGTAGCCTGTGTGTCACTGTCGTCGGG
TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTCTGCTCTGTGACCAACACCACAGTAATGATCCTTTAATACAGATT
CACAAGATATCGCAGACGTCCGTTCTTTCACTGAAGCTCACACTCTTATGTTTATTACAGTGTTATAACA
CACTGAGATTGTTCTGGAGAGTCTGTAGCTGTGTCCCAAATCCCATACTACTCCAAAGTGTTTGACAACT
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AGCATTATTGGGTTTGTTTTCTTCCGGTTCGGGATTACAAGTGCTTTACTGATGTCATTCTGTCCTTTAA
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AAACTCCAGAAAGAGAGAGTAGTGGAGGATTCAGATGCTGTATGATCTGCGTCTCCTCGTGATTTTTAAA
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TTTTGTGTTCAACAGAAGAAAGAAACTCTGTTTACAACCACACGAGTGTGAGTATGGATGAGTATGGGTG
CACTGTGACTATAAATATCTGATATACACAAATTTGCACAATTCTTTTCCCACAGCCTTTAAATGTATTG
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GGGGCACGTGCTTGGAGATTGTTAAATATGTGCCCTGGCATACATCCTAAAACTAAAGCTTCTGTTCCTT
TCCAAACTACCACTGACCGCTTGCCTCCATATGGAGGAGCTTTCCGGAGCGGTCAGTTTGCTCAGTAGCT
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AACTCATATGCAGTGCTCAGCATATATGCGCACACCCCTTACTAATCTATCCAAATTCATGATCAATGGG
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TCCATCCGCTCTGCTCCTCATCCTTCCCATGATGCAGTGCTGATGCAGACGCTACAACCGTCAGACCTCC
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AAACACATGCGCTATAGGGGAACTGATCAACTACACTGGCCATAGTGTATGAGTGATTCCCAGTACTGGG
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CCCTGATGAATAAGGGACTGAGCTGAAGGAGAATGAGTGAATGAATGATTATTAATACTACTAAATAATA
ATAATGATCCTCGTCATTTTCAGATTTTAATATATGTTTGTTTGCTTCATAGTATTGTGCAATCTGTTAT
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TATATATATATATAATGTAAAAAAAGAAAAGATTGCAAATTCAAGACCACTGGGCTGCCGTGCCACCCAA
TCTAGGAGAAAAAAGGGGGATGAAGGAGATGAAGGAGGGATTTCTTCTAGACCAGGAGTGTCCAAACTCA
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TAAGAGCTTGATTAGCTAGCCCAGGTGTGCCTGATTGAGGTTGGAACTAAACTTTGCAGAACACCGGCCC
TCCAGGACCGAGCTTGGACATGCCGGTTCTAGACAAAGACGATGTGTAATGAAGACTGGGGTTATTTAGA
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ACGTCTATACTTTGTTTACATTCACACCGATATGCATTTAAATAGTCTGATTTACGGGTTTACATGCTAA
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