ZFLNCG12981
Basic Information
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Express profile
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Express in top 10 samples
Sample | Tissue | Condition | FPKM |
---|---|---|---|
SRR658537 | bud | Gata6 morphant | 22.06 |
SRR527835 | tail | normal | 20.85 |
SRR1035978 | 13 hpf | rx3-/- | 13.36 |
SRR658539 | bud | Gata5/6 morphant | 13.08 |
SRR527832 | 16-36 hpf | normal | 10.69 |
SRR658535 | bud | Gata5 morphant | 9.94 |
SRR891504 | liver | normal | 8.20 |
SRR941749 | anterior pectoral fin | normal | 7.34 |
SRR658543 | 6 somite | Gata5 morphan | 6.35 |
SRR1035981 | 13 hpf | rx3+/+ or rx3+/- | 6.32 |
Express in tissues
Correlated coding gene
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gene | correlation coefficent |
---|---|
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Gene Ontology
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KEGG Pathway
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Conservation
Zebrafish lncRNA Transcript | Human lncRNA Transcript | Mouse lncRNA Transcript | Methods |
---|---|---|---|
ZFLNCT20125 | NONHSAT052887; | Direct blastn |
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OMIM of this lncRNA gene hava does not exist!
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>ZFLNCG12981
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TAGGCAAAGGGGCGTGGCTGGTGGTTCATAACGATGGGCGGGATATAGTCAAGGCTCAAGAAGGAAACGC
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GAGGCTATTTGGGTTACAGTTGGTGTGCTAAACCTACTTCTTATTGTGCAGTCATTTCTTAACTCTGTTA
CTTATAATTAAATAAATATGCTTGAGTTATAATTTAAAGTATTTGCAACTCATAGACTGAGAAATAGGCA
GCTCAAGATAAGGTACTTTATTTAATATTCATTTGATTAACGCATAAGGTCATGTTAAATAAATAATAAG
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GGCACAGGTAAACAAACAGTCATTATGCTGAAGTCTCTCACATATGTTTTGTTTGATTTTGTTTGTTTGT
TTGTTTGTTTTAAGACATTAAAAAGATTAAAATCTTGTTATTAGTTACTCACCCTCGTGTCGTTCCAAAC
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TTTATTTCCTACCCCAATTATACAACCTGAACCAGCTAATCAAGCAGTTTAGATATATTAGAAACTTCCA
GGCAGGTGTGGTGAAGGAAGTTGTAGCTAAACTATGCAGGACACCGGCCCACTGGGACAGAGTTTGGACT
GCTTTAAAGGGCATCTATGGTAAATAATCTACTTTTCAAGCTGTTTGGACAGACATGTGTATAAGTATAG
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GTCGCTCCATTGGAAATAAAATAGCAAACTTGCCTGCAGGTCGCACACCAGAAGCGCTGCTTGGCGACGT
GCAGCATTGACTTCATATCTGCCGCCCCACAGAGTAGAGGTCTGCATTCCCGCGGCTGTACCGCTGGAGC
GAGCGAGCACGTGTATGTATGTATGTGAATGAGACATCGTGATGCTGCGTTTAGCGTGTTTGTTGGTGTG
TGTGTTGATACAGACAGCTTGTTAGGCTGTCTGGACTCCGTATAGCTGGGTGGTTTTCGGTTTTGTTTTC
CTCCCCACTCGTTAGCGGGAACGGGCACAACGGGTAGGAAACAGGGTGGGTCGGGCAGCGGGAGAACAAA
TGCTCAATATAAGCGGGAGCGGTCGGGTTCGGGCTAAAACCTGGCGGGAGCGGGATTCAAAATTTAGTCT
CGTGCAGATCTCTACCACAGAGCGCCATCTGAACATGCGAATGTCCGTGTCTGGTGTGCCGTGTCGCGGC
TCTAAGCGGGTCATCCGGTGCCTCAGACAAAGTTAATTTAGTGTGCATGGTTATTAGTCTCGGTGTACAA
GCTCGTTACTTTAAACTAGCACACAGTTGGCTGTAAAACTATACAAAGACACAAATGATTTTGTACTCTC
TGCTTGGTCTGTGGCCGATGCGTACATGCACGGCTGAATGCTGATCCTCTCATGCAGCTTCTCTGCCTGT
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AATTTTCATGTGAAGCAACACGCCCCTAAAACAGCGAGCTGTGTAAACGCCCACCACCGTTTAACACGTT
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CATTTTAGGCTTTGTTCTAAATTGTTGCATTTTAGCTACTGTCGCTTTAAATTCACATTAGATTTTGCTA
TTTTCAAAAGAGGACGGAGCTACAAATGAATATAATGAATTAAGTATGAATTACTGTTAATGTTTACCAT
TAGAGGCTTATACTGTTACTGTATCATATACTGTTGCCACACAACTTTAAACCAACAGTTTAAACCACTA
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GAGCTTGGAGATAGATGAGACCAAGGTTCCCGCATGGTCAATGATCATTAGTATGGATACGAGATCAGGT
ATTTCCCGAGAACCCCCCAGTAAGTTTTTACCTATACTTTGGTTGATAAGGTGGATCTATTAGAATTAAT
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AGGAAACCTGAGTTCCTGGGGGAAACCAATGCAGACACGGGAAGAACATGCAAACTCTGCAGAGAGTGCC
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TTTTTTTTAAGTAATCTTAAACATCTTATCTCGTTTTAAGTTTGGAATAGCTGAACCTGATACTGATTAT
GAATATGGACGTTGAAAGGTTGTTAAAAAAGAAGTAAGAATAGAAAGAAGACTGAAAAATCAAATCAAAA
TCTCAGAATTGGCATGTGCATGGAAAAAAATAATATCTCACCTTAATGTTTTGGAATTTGTAACTTCTTT
TTTGAGAAGAGTGTGATGGAGAAGAAGACGAGGTGGTGGTGGAGCTGCAGGAGTCAGTGCTGGTGTCTGA
TGTGGAGGGTGAGAAGATCGCGGTGCACGGTCTCACTCATGAGGAGCTGGTCATCCAGGAGGCCATCGAG
GATGTGGTGGCGGAGTATGTGCCTTGCACTGATGAAGAGGACGATGTTGATGATGACGATGATGAAGGGC
TTGGCACCATTGCC
AGTCTGGGGGTGGGAGACGCAAACCCGCACGGCCTTGGGAACAAATCGTATATATACTACAACAGGTAGG
CCCCAGGCTTTAACACGGTCTTAAAATACACATGTGTGAGGTTTTGTTGGTTTAGAGGGGAAGTGAAGTG
CGTGTTTATGGGTTTGCGAGATTAACGCCGCTCTAATGGAACGTAGGCCTTTTGTTAGCAGCGAGCCGCG
GCCTGCAGAGGCCTAAAGTAGGCCGCGGAGACCAGACTCTCACGACCCACTTGACTGTTTTTATATACAC
TAATAGAGCTACACGTTGATTTCGTATTTACATTGACTACAGTGTGTGTTGGGGATTATATTTAGTGTTA
GTTTGCTTTGACTAAATTGTATATTTATGAAATTTAATGGATTATTTTAATGTATTCAAAATGGCGATGT
TAGGCAAAGGGGCGTGGCTGGTGGTTCATAACGATGGGCGGGATATAGTCAAGGCTCAAGAAGGAAACGC
CCTTTTTACTGTAAACAGATGGGAGGAGGAGAGGCGTCAACCCTACAGTATCAGATTATAGGATTCATGG
GAGGCTATTTGGGTTACAGTTGGTGTGCTAAACCTACTTCTTATTGTGCAGTCATTTCTTAACTCTGTTA
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TGCAGTTTTAATGCAAACAGGATTGAATTATTTTTATGTAAAGGTTGTGTTTTTAAATTTGTAATGACAC
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TAAAATAAACTATTAACAATGAAAAGCTGCTTGTTTTAGATAACATTACCCTACTACCTAATACTGTAGC
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GCATCCATTAAAATGTTGTCTGAATTAAATGCAGAAACCATCAAAATGTTCACTTGATGCAAGTTCTACA
AGTGCATTACAATATTCATTACAATAGTGATTTGCAAAGCATTTTTATTTCTAACATTTTATAGAAATTG
TAATTATTATATTTAGAAAAGTTTTATTAAATTTCATTTTAAGTAACTTCCATCTTAGTTTTTAATTCTA
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GGCAGGTGTGGTGAAGGAAGTTGTAGCTAAACTATGCAGGACACCGGCCCACTGGGACAGAGTTTGGACT
GCTTTAAAGGGCATCTATGGTAAATAATCTACTTTTCAAGCTGTTTGGACAGACATGTGTATAAGTATAG
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GTCGCTCCATTGGAAATAAAATAGCAAACTTGCCTGCAGGTCGCACACCAGAAGCGCTGCTTGGCGACGT
GCAGCATTGACTTCATATCTGCCGCCCCACAGAGTAGAGGTCTGCATTCCCGCGGCTGTACCGCTGGAGC
GAGCGAGCACGTGTATGTATGTATGTGAATGAGACATCGTGATGCTGCGTTTAGCGTGTTTGTTGGTGTG
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TTTTCAAAAGAGGACGGAGCTACAAATGAATATAATGAATTAAGTATGAATTACTGTTAATGTTTACCAT
TAGAGGCTTATACTGTTACTGTATCATATACTGTTGCCACACAACTTTAAACCAACAGTTTAAACCACTA
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AGGAAACCTGAGTTCCTGGGGGAAACCAATGCAGACACGGGAAGAACATGCAAACTCTGCAGAGAGTGCC
GACTGGCTCAATTTGAACTTGAACCATTGGGCCTCCCGCTGCGAGGCAGCAGCACCAGCCACTGAGCTGC
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