ZFLNCG13213
Basic Information
Chromesome: chr24
Start: 41200579
End: 41206222
Transcript: ZFLNCT20506
Known as: ENSDARG00000097061 LOC101885409
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Express profile
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Express in top 10 samples
| Sample | Tissue | Condition | FPKM |
|---|---|---|---|
| SRR726541 | 5 dpf | infection with Mycobacterium marinum | 2.59 |
| SRR527832 | 16-36 hpf | normal | 2.48 |
| SRR527834 | head | normal | 2.27 |
| SRR700534 | heart | control morpholino | 1.93 |
| SRR516131 | skin | male and 5 month | 1.89 |
| SRR527833 | 5 dpf | normal | 1.83 |
| SRR038627 | embryo | control morpholino | 1.65 |
| SRR594769 | blood | normal | 1.62 |
| SRR516124 | skin | male and 3.5 year | 1.21 |
| SRR1188156 | embryo | Control PBS 4 hpi | 1.15 |
Express in tissues
Gene Ontology
Download
| GO | P value |
|---|---|
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| GO:0000975 | 1.36e-02 |
| GO:0001067 | 1.36e-02 |
KEGG Pathway
KEGG pathway of this lncRNA gene hava does not exist!
Conservation
| Zebrafish lncRNA Transcript | Human lncRNA Transcript | Mouse lncRNA Transcript | Methods |
|---|---|---|---|
| ZFLNCT20506 | ENST00000382990; NONHSAT051755; NONHSAT172511; | Collinearity with conserved coding gene |
OMIM
OMIM of this lncRNA gene hava does not exist!
Sequence Download
>ZFLNCG13213
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GTCTCGGTACGCTTATTTGGTCTGCTTTTGGTGCGCACTCGAGAACGATTGCTGCATTCACACCTGCCCA
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GCACCCCAAGTGTGTTCTAATGTTTAATCCTTACACACATTTAGAGGGTTGTAGATTTAGATTGATGTAT
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GTTTCTTTCTTCTGTTAAACACAAAGGAAGAATGTTGGAGAAAACAGCCATTAATTCCATAGTATTTTCT
GCTCCTACTATGGATGCCAGTGGCTGCTTCTTTTCCCCAGCATTCTTCTAAGTATCTTGTTCTATGTTCA
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GTCTATGCTAATGAGCGAGAGATGGTCACTAGTGGGCGGGGCTTTCCCCCTCTGATGACATGTACAAAGG
GAGAATGTCAATCAAAATCTTTCCGCAGACTGTTTTTATCAAGTCTGATAATAATAAAATAGAATTAATT
ATTTTGAGCATTAGAGGCTGCTTATTTTCACACACTGCTGACAAACAACTGTGTTTAACCCCCTCATAGA
AGTGATTTTTCCATGATAGCTCCCCTTTAAATCCGCAACACACCTGTGAGTAACAGCAGATATGAAGCGC
CGCTGGCCGTCTTGAAGTGCAGGTGAGCGAATACACCGTTCACGTCAACATTGACCCTGGAGCCGAGCTG
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CGTTAGTGAGCTTTAGGTTGGTATTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTCGTACCGGT
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TGACTGCCATTGTAATTATATCTTGATTGTTGCTTGTTGGGAAGAGGTGAAATTAGTCATTTTTACTACT
GATCATATTCCCAGAGATGGGTTGCGGCTGGAAGGGCATCCGCTGCATAAAAACTTGCTGGATAAGTTGG
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TGGAGGGACGACTGCGCTGGCTGATTGTATCCCTGCTTTAGACAAACTATACATTTTGAGAAGGAAGCGC
AGCCGTGGCTGGAAAACAGTGTTTAATGCATCACTCGTCACTTCAGGAGGAGGCGTGAATTAATTTAGCT
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