ZFLNCG13384
Basic Information
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Express profile
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Express in top 10 samples
Sample | Tissue | Condition | FPKM |
---|---|---|---|
SRR514030 | retina | id2a morpholino | 285.34 |
SRR514028 | retina | control morpholino | 269.91 |
SRR1035237 | liver | transgenic UHRF1 | 153.27 |
SRR658537 | bud | Gata6 morphant | 123.97 |
SRR658539 | bud | Gata5/6 morphant | 107.11 |
SRR658533 | bud | normal | 92.01 |
SRR658535 | bud | Gata5 morphant | 91.05 |
SRR527832 | 16-36 hpf | normal | 83.82 |
SRR658547 | 6 somite | Gata5/6 morphant | 83.48 |
SRR1299125 | caudal fin | Half day time after treatment | 79.82 |
Express in tissues
Correlated coding gene
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gene | correlation coefficent |
---|---|
dnajc8 | 0.59 |
cmbl | 0.58 |
rps28 | 0.57 |
ost4 | 0.55 |
zgc:136866 | 0.55 |
psmb6 | 0.55 |
zgc:110091 | 0.55 |
thumpd1 | 0.54 |
LOC101884591 | 0.53 |
sar1b | 0.53 |
Gene Ontology
Download
GO | P value |
---|---|
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GO:0071034 | 3.12e-03 |
GO:0006407 | 3.12e-03 |
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GO:0051029 | 3.12e-03 |
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GO:0098856 | 4.68e-03 |
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KEGG Pathway
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Conservation
Zebrafish lncRNA Transcript | Human lncRNA Transcript | Mouse lncRNA Transcript | Methods |
---|---|---|---|
ZFLNCT20808 | NONHSAT017210; | NONMMUT064161; | Direct blastn |
OMIM
OMIM of this lncRNA gene hava does not exist!
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>ZFLNCG13384
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TATTTTTATTTTATTCTTTTAGTTTAGGTTTACTTATTAACCTGCTTATAAATTTATAGTATTCATAATA
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TTTTCACAGTATGTCTGGTAATATTTTTTCTTCTGGAGAAAGTTTGTTTGTTTTTTTCGGCTAGAACAAA
AGCAGTTTTTAATATTTTATTTTTTATATAAATTTTAAGCTCAGAATTATTAGCTCCTTTAATCTATATA
TTTTTTTCCACTGTCTATAAAACAAACCATTAATATACAATAACTTGCCTAATTACCCTAACCTGCTTAG
TTAGACCCCTTTTAACCTAGTTAAGCCTTTAAATGTCACTTTAAGCTGTATAGAAGTGTCTTTAATAATA
TCTAGTTAAATATTGTTTACTGTCATCATAGCAAAGATAAAATAAATCAGTTATTAGAGATGAGTTATTA
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GTTTGTTTGTTTGTGTGTGTGTTTGTTTTTGTGCTTTCTTTTGCCCAGATTAAGGGCATGAAGGACCGTC
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TCATTTTTGTTTTCCCTCAAAAAGCCCGATCTCGCAGCTCAAGAGGCCAAACTCATGCAGAAGATCCAGT
TACTGTGTGTCATGGAGGTAAACGCTACTGTTTCTGTGCTAGTATTCTGAGCAGGTTCATTCATTCATCC
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TCGCCCTCAGGCCATCCAAGATCTCAGTGAATTAAATTAATTTCTTAAGTGGGATATTTAAAGAGGATTT
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AGCAAGTGATGTGGTGCTCCAGCTTAAGGGTGAATAAATGAAGATGACATTTTATTTTAGGATGAACGAT
CTCTTTAAGAGGCACTACTTTGAGTAACTCATAATTCAGTTGCTGATTGGTTGTCTTCTTCACAGATGAC
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AACGAGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCGCGTGCGTGT
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ACGAGGTTGAGAAGAAGGTTCACATGACTTGGGTTCAGCCCCGAGTGCTGGACGTACAGCAGGTAAGTTT
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TTAGACCCCTTTTAACCTAGTTAAGCCTTTAAATGTCACTTTAAGCTGTATAGAAGTGTCTTTAATAATA
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ACTGGGGGGCTAATAATTCTGACTTTAACTGTATATGCTGAGAAATCAGAATTTGTATAGAATTTTGTTT
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TGCATCTCATTACATAAAGTTTTATGTAAATTAATGCAATTTTTATAGTCTTTAAATTCCCCATTTATTT
ATTTATTTATTTATTGAAAACATTTAGAGTTTCGGTCTCCTGTAGCTTTTGAAGAAACCTGCATTTAATA
AAAACATTTGTCTCTATAATTTTGTTTAAGAACAGAAAGTGTCTAACCTGTAATCTGTGTGTGTTTGTTT
GTTTGTTTGTTTGTGTGTGTGTTTGTTTTTGTGCTTTCTTTTGCCCAGATTAAGGGCATGAAGGACCGTC
TGGACTTCTGGTGTGGAGACGTGAAGAACATGGCAGTGTTGGTGGAGCAGCGGGCGCAGGACATCCTCAC
CTAAACAAACACAGCTGACCTTCCAAGAGTCCCTCACTTCTTCTCTGTGTATCTGCATTCTGTCATTAAA
GTTCCTCGTTTTCACAAT