ZFLNCG00242
Basic Information
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Express profile
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Express in top 10 samples
Sample | Tissue | Condition | FPKM |
---|---|---|---|
SRR1648855 | brain | normal | 6.38 |
ERR594418 | retina | transgenic flk1 and develop tumors | 4.40 |
SRR1648854 | brain | normal | 2.65 |
SRR065196 | 3 dpf | normal | 2.59 |
SRR527834 | head | normal | 2.49 |
SRR633544 | larvae | exposed to cold stress | 2.36 |
SRR726540 | 5 dpf | normal | 2.25 |
SRR891511 | brain | normal | 2.21 |
SRR942772 | embryo | myd88+/+ and infection with Mycobacterium marinum | 1.98 |
SRR1167757 | embryo | mpeg1 morpholino and bacterial infection | 1.92 |
Express in tissues
Correlated coding gene
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gene | correlation coefficent |
---|---|
grm6a | 0.67 |
scamp5a | 0.65 |
LOC101884882 | 0.65 |
atn1 | 0.65 |
kirrelb | 0.65 |
nxph2b | 0.64 |
ldb2b | 0.64 |
ptena | 0.64 |
LOC101885310 | 0.64 |
LOC100535524 | 0.64 |
Gene Ontology
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---|---|
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KEGG Pathway
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Conservation
Zebrafish lncRNA Transcript | Human lncRNA Transcript | Mouse lncRNA Transcript | Methods |
---|---|---|---|
ZFLNCT00355 | ENST00000513127; NONHSAT198527; | Direct blastn |
OMIM
OMIM of this lncRNA gene hava does not exist!
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>ZFLNCG00242
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CAAGGTAACACAAAATCTAATACACTAACAGTTACAAATTTGCAGTAATTGGATTCTTAATGTTTCTGAA
ATAAGTCTCTTATGCTCAGCAAGGTTATATAGAGTTGACGTCAGAATTATTAGCCCTTCTTTGAAATTCA
GTTCTTTTAAAAACGAAGTGCTGTTTAACTTAGAGAAGTTTATTAGCAAGTTTTAGAGTAGTTGTATTAT
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CCTAATTACCCTGACTTGCCTAGTTAACCTAATTACCCTAGTTAAGCCTTTAAATGTCACTTTAAGCTGT
ATAGAAGTGTCTTGAAAAATATCTAGTAAATTATGTACTGTTTTCATGGCAAAGATGGGTCCCACTTTAT
ATTAAGTGGCCTTAACTAATATGTACTTACATAGGAATTAATAGTTTGTTACAATGTACTTATTGTGTAA
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GTTTTATAATTCTGACTTCAACTGTAAGCCATTATTAGTAGCTGACAGCAAAAGAAAATATTCAAAGACT
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ATAATGCGTTGTTGTCATTTACTGTGGCAAGGATAGTATAGAGGAGTACTGCATGTGCAGTTATTAAAGT
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CCCTCAGATCAGGCCTTCCCTCTGATACATCCCACACATCCATACAAACTAGAGCACTTGGCTTTTTTCA
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GACCCTCCAGCATGTCTTTTTGTAATATTTATTTATTTTTAATCCTTCTGAGATGCTGAAAAATAGACTT
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CACTGTCTGTTAGATCTCTAATTATAACACTGTTACATATTCATGCCTTTTACTGACTACACACCGAGAG
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TTTTTAGCTGTAAGAATATGCGTATGATACAGCTGAAGGTGTAAGTTTAGAGACACTCATTCATCTTAGA
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GCCATCGCCACCAGTCTGCACGAAATCTGCTCTAGGGTAAGATTTACGTGCTAAACAAACAACATCCAAC
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ATACATGTATTTACTGTGTACTTATGCTTGATTAAATACCTGTATGTAGTTACATCTGTAATTAACTTTT
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AACACAGTAAGTACATTGTATTTATTTTTTGATGTAAGTACATAGTAGTTAGGGCCACTTAATATAAAGT
GGGACCCAAAGATGAAATAAATCAGTTATTAGAAATGAGTTATTAAAACTATTATGATTAGAAATGTGTT
GAAAAAATCTTTCTCTCTATTAAACAGAAATTGGGGGAAAAAATTAACAGGGCGGCTGATAATTCAGGAA
GTTTTATAATTCTGACTTCAACTGTAAGCCATTATTAGTAGCTGACAGCAAAAGAAAATATTCAAAGACT
GGAGCAATGGCTGCTGAAATATATCTTTGCCATCCTAGGAATAAATTACAATTTAATTTTCATCTCAACT
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