ZFLNCG06128
Basic Information
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Express profile
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Express in top 10 samples
Sample | Tissue | Condition | FPKM |
---|---|---|---|
SRR372793 | shield | normal | 123.36 |
SRR658533 | bud | normal | 97.41 |
SRR372796 | bud | normal | 95.14 |
SRR1035981 | 13 hpf | rx3+/+ or rx3+/- | 86.08 |
SRR658535 | bud | Gata5 morphant | 85.19 |
SRR658539 | bud | Gata5/6 morphant | 83.73 |
SRR514028 | retina | control morpholino | 83.65 |
SRR1035978 | 13 hpf | rx3-/- | 78.20 |
SRR1049946 | embryo | transgenic TgOMP-Gal4 and UAS-GCaMP1.6 and treated with DMSO | 71.78 |
SRR1035984 | 13 hpf | normal | 68.90 |
Express in tissues
Correlated coding gene
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gene | correlation coefficent |
---|---|
ppwd1 | 0.78 |
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arf6b | 0.76 |
tmed10 | 0.76 |
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Gene Ontology
Download
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KEGG Pathway
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Conservation
Zebrafish lncRNA Transcript | Human lncRNA Transcript | Mouse lncRNA Transcript | Methods |
---|---|---|---|
ZFLNCT09447 | ENST00000439535; NONHSAT200129; | NONMMUT053279; | Direct blastn |
OMIM
OMIM of this lncRNA gene hava does not exist!
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>ZFLNCG06128
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GTTCCCGTAATTTCCATATCCTTGATTCCAGTAATTTCCGTATCCCTGGTTCCAATTTTGATTGGGACCT
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GTGTGAAAAGTTCTTTTTTGAATGTACCAGTAAAGTTGTTGTGGTAATTTTCCGGATATTTAACGGTATC
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GCTCGCATGTGAAGGATATGGTCAATAGAGTCAACTTGATTTCAGCTCTCCTCGACGCACACACCAGCAA
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GTCTCTGAAGTTGGGGCTGACGTGATCGTTATAGCAGCGTCAGCCAATAAAATTAGTCTGCAATCGGCTA
CTGTTTAGACTGGTGTATTTCCATAAAGCAATCTGATTGGCTGACGCGAAGGTCCAAATTCTGCAGTGAG
CACGGATTCACAATGCAGTTCGGAAACGTCTGACATCACCCATTAAAAGTGAATAGGAAGCGTTGACGCT
GACGCTCCATGTGAATGGGGCGTAAGGCAACTAATCTTTTCACGACCTGACGGCTAACTGCTCAGAGAAA
ACGCAATAGTATAGAGAACAAAAAGTGTGATGCGCACCTCCTCTGCCTCTCCCTCTGGAAGTGTATCCTC
CTCTTCCACCCCACTGCTGCTGCTGCTGGTACTGCTCCTTCGACATCGCCACCTTCACCTCACACTGCAT
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TAAATGATTGTGTTTAAAGATGCCTTAATAGCATATAGATATAGATATGTGGATCATTTAGCACTTTCAG
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ATAACGAGTCTTTAGCCGTTTCGGTGTGACGTTGAGACGAAACTTAAGCCAATTGTTGCGCGCCCGGAAA
AATTGATAAACACTGTAGAAGATCCAGGTGGAATCAAGTCGTGTAAACATTGTGCTCAGCTGGACATTAT
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AGTCTATTGATGTATGAGACTTTGTCAGAGCTCGACAGGAACTTTACAGTGCACAGTTCATGGACCAGTT
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AATGATGTATTTAATTGTGTTTTGTTACATGAAATCGCTTGTAGTGTATTTGGTTAACTCTTTATGTTCT
CCTATCGCGTCTAATGCTGCATTGAAAACGCGACGCATGCTGCTTTGTTTACGGCTTTAAATGCGTTTGT
GAGCTAGCATTATACTGACGTTTGTCATTGCTATGGCCACCATCAGCTGTAATTACAGGAGTTTTCCAGG
ATTAATAACAAAACGGGAGGGTGGTGGGAGATGGGTCTGAAATACGAAAGACTCCCCGGAAAAACAGGCA
TGTTGGAAAGTATGCTCAGACATACACCATGCACTGACTACTTCAATATTGTTGATAAGCAATTCACTCT
GTCTAGCGCTGAAGGCTGTCGACCAATTGCAACAGACTGTCATTGGCCCAATCAGCGCAGGGGAGGGGAG
GGGTTTGGGAACAAATGAATCACTGAACAGATCGTATGGGGGTCGCTGGAATAATTAGGTAAAAATAAAT
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TATTCATTTCCATATTCCCCCACTGCATTATCAATACTATATACATTTCAAAATGGTCTTATAATACACA
AAAGCAGTCAGGAATAAACCCAAAACAATTGTTGTCTGCCACTTAAATGGATTAATTTCTTCTGACAAAT
AGGCTTTAATTAAAACTTGGCTGCCAAATGCAGTAAAAACGCACAAATTAATTTGAAATCTGTGCTAACA
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TTACTACTTCATAGGCCTGATCAGAGATTCAAATACTCCTTTGCTTTAGCAAACTCTCAGTCACAGTGGT
ATCAATAGTAAAGTCTCCGTTTCAGACTAAACAAACACAAGGTTTAAGGTCAAACGAAGTAGTGGAAAAC
TATGTGGTTTCAACCAAATTTTTGTGTAAGAAACGCCATTTACAATGTTCAAATGAAGTCATCATTGAAC
TAAAACAAAGGAACAAATAACAATTAATCTTATGGAAACAAATATTTAAAGGACTGGTTCACCCAAAAAT
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TTCTGAAGAAAGCTGAAAACCTTTTGGTTACAGGTTTTCAGCTCTCTTCAGAATATATAGCTTGTATTTA
ATAGAGGACAGAAACTTAAACAGGCTTACAACAAGTGCAGGATGAGTAAACAACGATTTTCATTAACTAT
TCCTTTAACGCAGGGGTGTCAAACTCAATTCCTGGAGGGCCGAAGCCCTGCACAGTTTAGTTCCAACCCT
GCTCCAACACACTTACCTGTAGGTTTCAAACAAGCCTGAAGGACTCAATTAGTTTGATTAGGTGTGTTTA
ATTAGGGTTGGAACTAAACTGTGCAGAGCTGCGGCCCTTTTGGAACTGAGTTCTTCTGTAGATTTTAATA
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CTGTTATTACAGACACGCTCAGATCCAAAAGTGCTATTAAACCGTACCTTGCTTAACCCAATGTTGTGGT
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CACCTAGGATTATTTCGAGTCAGGATTTCAATTATTCAGTCAAGACCATAACAAAAATACTGTTGATTCT
GGTAAGCATCTATCCAAAATGATACCTTTTCCACACTTTCAGCTTCTTTAAAC
GAATGTTTGAAAACTGTTTATTATTTTCTAAAAACGACCACTGTCCAGCGGTTGTTTTTTGCATGGCCTA
CAGATTTACATGTCCGATGGATTCAAAGGCACTTTGACAAATGTGTTTTGAAGCTAAGACATCCCTTTCT
ATATTTAGCACCATAGTTATTATAATACATATGTACAATATAGCTTTGTGCAAGCAAGCCTTCCCTGTAA
GACAAAAAGCAACTGCAGCAAGGTTCTAGAGTTTTCTCTCGGAAGCGTAAGGCATGTATGATACAAGCAT
GTGCATTCTGCTCTCAGATAATTTAGTGCACAATTGTCATAGTCCGGGTCGAGTACCGACAATCCATGAA
ACAATATATCCTTAGTTTTTTCATCTGTGCGTTCACAAACAGTATTACATACTGCTGTAGTCACCATATC
CGTAGTAGTTGTTGTAACCCGAGTAATCATAGCCCCCGTATCCACCGTAGCCTTGATTGTTGTAGCCATA
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GTAACAGACACCAAACGTACATCACTATTAATAATAGCTCAAGTGTGACTGCAAAGGACAATGCAAAAAT
ATACATATACACTAATAAAAATGAAGTTTACAAACACAGCGATGTCGTAGATGAGCTGTTTTTCGATTCG
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TGACTGTGTGTGCGTCTGTGTCTGTGTGCGTCTGTGTCTGTGTGGTCACGTGATGTGCATTTTCAGTGGT
AGTGAGGAAGGAGGGCTGCTCAGAAATGCTACACGTCAGTGTGGATGTGGATCGTTGTTGTTCTAAAATG
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ACGTACATAGCAGAGCTTGCAAACTGTGTTTTTTTTTTTGTCGACAAAATCCAAAATACTTCCACACCGG
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CTTTAACGAGCGTGTTTTTTTTCCCCGCTTGGCAAGCCAAGCTGACATGACATGGGGGCGTGGCAGCATC
GACGATTCCATTTTTTGATTCGATAATCGAAACTGAGCATAAATTTAGATCGATTTCGATTTACCCTTAT
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ACTTCAGCAACTTCTGTACTAAGGGCTGTTAGCACTTGCTACTTAATGCGTTTTCTCCCAACTGATAGCC
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GTGTGAAAAGTTCTTTTTTGAATGTACCAGTAAAGTTGTTGTGGTAATTTTCCGGATATTTAACGGTATC
GCTGTTAATGATTGGTTGATGTTCGAATTTACTCTTGGCCACACAAAAGCTTTTTATTTAGCTAATTATA
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GACGCTCCATGTGAATGGGGCGTAAGGCAACTAATCTTTTCACGACCTGACGGCTAACTGCTCAGAGAAA
ACGCAATAGTATAGAGAACAAAAAGTGTGATGCGCACCTCCTCTGCCTCTCCCTCTGGAAGTGTATCCTC
CTCTTCCACCCCACTGCTGCTGCTGCTGGTACTGCTCCTTCGACATCGCCACCTTCACCTCACACTGCAT
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