ZFLNCG06545
Basic Information
Chromesome: chr10
Start: 45038766
End: 45045385
Transcript: ZFLNCT10024 ZFLNCT10025
Known as: LOC101882797
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Express profile
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Express in top 10 samples
| Sample | Tissue | Condition | FPKM |
|---|---|---|---|
| SRR514030 | retina | id2a morpholino | 7.86 |
| SRR514028 | retina | control morpholino | 7.85 |
| ERR023144 | brain | normal | 1.49 |
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| SRR1205172 | 5dpf | transgenic sqET20 and neomycin treated 5h | 0.58 |
| SRR519717 | 2 dpf | FETOH treatment | 0.55 |
| SRR1569495 | embryo | normal | 0.54 |
| SRR516129 | skin | male and 5 month | 0.50 |
| SRR038627 | embryo | control morpholino | 0.48 |
| SRR519737 | 2 dpf | VD3 treatment | 0.45 |
Express in tissues
Correlated coding gene
Download
| gene | correlation coefficent |
|---|---|
| thsd7a | 0.79 |
| cadm3 | 0.76 |
| LOC100332515 | 0.76 |
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Gene Ontology
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KEGG Pathway
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Conservation
| Zebrafish lncRNA Transcript | Human lncRNA Transcript | Mouse lncRNA Transcript | Methods |
|---|---|---|---|
| ZFLNCT10025 | NONHSAT193138; | NONMMUT062985; | Direct blastn |
OMIM
OMIM of this lncRNA gene hava does not exist!
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>ZFLNCG06545
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AATCCATTTTAAAGGTCAATATTATTAGTCCCTTTTAGCAGATTTTTTTTCTCGATAGTCTACAGAACAA
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GATATTTCTAAAAACTGATTTATTTTGTAACGATGACAGCAGTGGCGCAGTAGGTAGTGCTGTCGCCTCA
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AGATTATTGTGCTTGTCATAAAGAAAATAACCCAACATTTATTTTAAAGAGTAAATAATGACGAGCTCAG
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CACACACACACACACACACACATATACACACACAATATGGCCAATGTAGTTCATCAATTCCCCTATAGCG
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GTGCATCTGTTTATCAAACTGAATTCAATTCTGATGGTCTCAGTTCAGGCATTGAGCTTTGAACCTATAA
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TTTTAAAAGAGTACATCTGTCAGATGCATTTTGATACAAACATCAAAAGTTTAATTCAATGCGTTTGGTC
TCAGTTCAGGCCATGAGTTTGGAGCATTAACCTACAGAACATTCTGCTTTATCTACAACACACACTCTAA
AACATGCCGGGCTGTTGTACCCCATATTTGGGTCAGAAATTGACTGAACCAACCATGTGGTTAAAAAGTG
TACTTACATTTTTAATTTACATCCCACTCTTTTTTTTAATGATGGATTATTTGTACACTTTTAACCCAAT
GTTAGTAAAGAGAATATAATGATGGGCTCTAAAATTTTATTGCCATTACAGTAAAGCTGGGTTGTTGTTT
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TTTTTTTTTTTGTCATGGAATTTTATTCTTGCAAATAGCATTTAACATATTATAACAACCCACAAAACAA
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AAAACATTAGGATAGATTTTAGAAAGTTTGGCATTTGAGAGATGAGACTGCATTTCTTTAAGAATAAATA
ATGTTGAAGTCATTAAATATGTGCATCTCTCTGACATTTTTATTATCTCAGTTTAGGTGATGAGCTTTTT
TTGTTTACACCATACACTAAACAATGCTGGGTTGTTGTAACCCAATGTTGGGTCAAAAATGGACAAACCG
AACTATGTGGTTAAAAAGTGTACTTACATTTTTAATTTACATCCCACTCTTTTTTTTCCCTTTTTTTTAA
TGATGGATTATTTGTACACTTTTGACCCAATGTTGGGTTAAATCAACCCAGCATTTTATTTAAAGAGAAT
ATAATGATGAGCTCTACAATTCTATTGTCATTTTTTTACCATTTTAGCAAAAAAAAAAAGCTGGGTTGTT
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GCATAACAGGTTGTCTTTAACGTTACAAATGTTTGTGCCTGAACGCTTTAAACTCTCTTTAAACACAATC
AAATGATCAAGTTTCACCCTGTTATGGTCAAACTTTGCAATGACTCTCATGTGTTCTCAATTGTTGATCA
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CTTCTTTATTTTCCACAGCCAAAGACACCTGTTTTGGTTTTTTTTGTTCTCTACTCTGCTTCATTCAAAG
CATTTAGTCTCCTGCTTAACCCAGCACTTTAAGCACACAGTGAGGGGGATGATTGCATCACAAAGGAAAG
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ACAGTCGCTGCTTCATTATTATAATCATAATATCAGATCATTATTAGCGTCCGGCATCGCTGAGAACTTC
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CCGCAAGAAGGTCGCTGGTTCGAGCTTCGGCTGGGTCAGTTGGCGTTTCTGTGTGGAGTTTGCATCTTCT
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