ZFLNCG11796
Basic Information
Chromesome: chr21
Start: 43827463
End: 43830816
Transcript: ZFLNCT18297 ZFLNCT18298 ZFLNCT18299
Known as:
Genome Browser
Express profile
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Express in top 10 samples
Sample | Tissue | Condition | FPKM |
---|---|---|---|
SRR1648856 | brain | normal | 9.02 |
ERR594417 | retina | normal | 6.57 |
SRR1648855 | brain | normal | 5.76 |
SRR1562528 | eye | normal | 5.42 |
SRR1648854 | brain | normal | 5.33 |
ERR023144 | brain | normal | 3.79 |
ERR594418 | retina | transgenic flk1 and develop tumors | 3.50 |
SRR1167762 | embryo | ptpn6 morpholino | 3.38 |
SRR942772 | embryo | myd88+/+ and infection with Mycobacterium marinum | 3.31 |
SRR1167753 | embryo | bacterial infection | 3.18 |
Express in tissues
Correlated coding gene
Download
gene | correlation coefficent |
---|---|
LOC101882495 | 0.91 |
LOC101882983 | 0.91 |
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Gene Ontology
Download
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---|---|
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KEGG Pathway
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Conservation
Zebrafish lncRNA Transcript | Human lncRNA Transcript | Mouse lncRNA Transcript | Methods |
---|---|---|---|
ZFLNCT18299 | NONMMUT137475; | Direct blastn |
OMIM
OMIM of this lncRNA gene hava does not exist!
Sequence Download
>ZFLNCG11796
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TTGATAATTATAACAGGTTTGACACGCTGTCCCGGGAGGAAAGCCCTGAGCTCAGAGATACAGTAATTGA
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CTGATAAAGGAGGAAAGGAGAGATGGGGTGGATAGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGATAAAACGAAGATAAG
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GTACATTTGTGTTCATTTTTGCATTTGTTTTGTAAACTATCCCTTTAAATCTGCCGTTTCCTCAATGATT
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GCAGTGTGCGTGTGTGCGTGTGTGCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCGCGTGTGTGTGTATTATTTGTTCTC
TTTAGCACTGAAATGCCAGCCTGACTTTTGCCAACTAGGCAGAAATGAAGCGTCTCGTGCCTCATTGAGT
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CCATCAGTCGAGCATGTGAAGAGCTGTCGTCATTTGTTGTCGCTGTTCAGTAAATCAGAAACCAGCAGAA
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CATTATAGAGTTTACATTAATCTGTTGTGGTGATTCCACAGTTATTATGGTAACACTACAACTATAATAG
TCAAATTGTTGTGGTAATTCTACAGTTGCTATGGTAACACTTCAATTCTAATATTAAATTATTGCAGTGA
TTCTACAGTTGCTATGGTGACACTACAACTATAATAATCAAATTGTTATGGTGATTCTGCAATTGCTATG
GTAACACTACAGCTATAGTGGTCAATCGGTTGTGATGATTCCACAGTCACTATGGCAACACTACATCTAT
AATAGTCAAATTGTTGATGCGATTCTACAGTCGCTATGGTAACACTACAACTATAATAGTCAATCTTTTG
TGGTGATTCTACAGTTGCTATGGTAACTGCAACTATAATTGTCAAATTGTTGTGGTGATTCTACAGTTGC
TATGGTAACACTACAACTATAATAGTCACATTTTTGTGGTAATTCCACAGTTGATATGGCAACACTACAT
CTATAATAGTCAAAATTTTGTGGTAATTCTAAAGTTGCTATGGTAACACTTCAATTCTAATATTAAATTA
TTGCAGTGATTCTACAGTTGCTATGGTGACACTACAACTATAATAATCAAATTGTTGTGGTGATTCTGCA
ATTGCTATGGTAACACTACAGCTATAGTGGTCAATCGGTTGTGATGATTCCACAGTCGCTATGGTAACAC
TACAAATAAAATAGTCAAATTGTTTTGGTGGTTCTACATTTTCTATGGTAACACAACAACTATAGAAGTC
AATCTAATGTGTTGATTCTACAGTTGCTATGGTAACACTACAACTATAGAAATCAATCTGTTTTGGCGAT
TTCACTGTTGCTATGGTAACACTACAGCTATAGTAGTCAAATTATTGTGGTGATGCTACAGTTGCTATGG
TAACACTACAACTATACAAATATAAACAAATGAGCCAATACTGTAGTTTTCAACAACTAAATGTCATGTT
ATATTACAATACACCATAGCTTACTGTAGTGAACAGTAAACTACAGTATTTATCACAGCTTATCATTTTG
ATACAATTAATGCTACAGCACACATTAACCAACAGCTGTAGATACTACAGTATAATACACTTCACTATAG
TGTGGTTCAAAAACACTCTGGTATTTACTATAAATTACTGTAGTGTATTTGTGTGTGAGACTTTCTGATT
AACATTGAGATCATGACAAAATGCCAAGGGCCTAAGCTCAAGAAGGAATTTTATTTCCATGCGTTTGTTT
GAAAACCCTGTACTGGTGTGTCTTCGTGCTGGTTCATCTATATCTCTATGCAACACATGTTCAGCATTAA
GGCAACTGTTGAAATGTAGATGTCTCTGCTGATTTGACTGATGTATCCTCGTCGTGTAACTGACCACACC
AGCAAAGTTCGGCTCTAGTTTTCAGTTTCCCACCAGATTCTGTTCATGTGTGTTGTGTTTTATATGTTGT
ACAATTGTAAAACGTCACACATTTCAGAAAGATGCTGTCTTTATGTAATTCACAGATGTGCGTCATTAGA
AAGTCGATATTTCATGCTCATACTTTGAATAAACTCCTGTAGTTAGTTGTATGTAACGCGCGCGTAAACA
AGATTTCAGACCCCCCCGAGTGATTTATTATAGCAATGCTTGTATAGAAACCTTTATTGTAAAATGTAAT
ATAGTGTTGCCTGGAATATACTGTACATTTCTTCCAGTTTTACAATAAAAGATGAGACCAGAC
CATTTAAAGAGTCACCTAAAGAAGAAAATAACCTACGATATGAATATTACATTTAACAACAACCTTCAGG
AGTTTCTTTCCTCTGTTGAACATAAAAGAAGACATTAAAACAATGTTAGAAACCTGTAACCACTGAGTTC
CATAGGAGGAACAATAAATGCTGTGAAAGGCAAAGGATTTTCAGCATTTTACAAAATATCTTCTTCTGTG
TTCAGTAGAAGACAGAAGCTTTAGAATCACCTGAGGATGAGTAGTTCAAGAGTTCTCGTTTGGATATTGC
TTGATAATTATAACAGGTTTGACACGCTGTCCCGGGAGGAAAGCCCTGAGCTCAGAGATACAGTAATTGA
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AGAGTAATGCTAGACAGGATATTTATAGTGAGTTTGGAACAATCTGATTGGTTTATTAATGATTGTAGAT
GAGAGACCGATTGTGGTCAATCATCTCACGTGCTCCTCTGGATATTAGTTTGTGTAACTTCACATAGTGA
GTACATTTGTGTTCATTTTTGCATTTGTTTTGTAAACTATCCCTTTAAATCTGCCGTTTCCTCAATGATT
AAACTAGCTGCACACATTTTGTACAAGACTGTCTGTGCTGCACATAATAGCTGTTCTTTTAAAAGTATTT
GCAGTGTGCGTGTGTGCGTGTGTGCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCGCGTGTGTGTGTATTATTTGTTCTC
TTTAGCACTGAAATGCCAGCCTGACTTTTGCCAACTAGGCAGAAATGAAGCGTCTCGTGCCTCATTGAGT
CACACACAAGTCTACATCATTCGTCTTCATTACTCTGGATCGTGCGCAGACTGTTTGTGTCCTCGTCATG
AACATTAGTTTAGTTCAGTGTTAAAGACTCCTCCGTCTTGTGTTTGTGTGTGCTTCACATCATCATTTCT
CCATCAGTCGAGCATGTGAAGAGCTGTCGTCATTTGTTGTCGCTGTTCAGTAAATCAGAAACCAGCAGAA
CAGTGTTTTGTTTTCAGCCATTTGTGTTGAAAATAATGTATGACTTGAAAAAGTTCTGACACCCTGAGAA
ATTCAGATTTTGACATTGGGTATAAAAACTGATCTTTTGGAAGGTCTTAATTTGTGAAAGAAAACCTCTA
ATAAATAAAATGAATTCATTTCTATTTGCATTTTGGAATTTCACTTCAATAAAATGCTTAATGGAAATGG
CGAGATGCACAGTGAAAAACACACTATAATATATGTGCAGATAGACTATGACGGAAACACATTTACTGAA
TAATACATTTCAAAATATGGACGAAACCGTTGGTGTGGTGTGTTGCTCTGCCGTGTTTATGTCTAAAATT
CATTCCTACATGGTGAATGAAACCTCCTCCTTCATCAGTATTCTTCTGTTATTAATCACACAGAGATATT
CAATTCACCAAACATGGTAAAATACTGTAGTGCTTTATAGTAAATATTGTAACATTTTTTAACCATTCTG
CATTATAGAGTTTACATTAATCTGTTGTGGTGATTCCACAGTTATTATGGTAACACTACAACTATAATAG
TCAAATTGTTGTGGTAATTCTACAGTTGCTATGGTAACACTTCAATTCTAATATTAAATTATTGCAGTGA
TTCTACAGTTGCTATGGTGACACTACAACTATAATAATCAAATTGTTATGGTGATTCTGCAATTGCTATG
GTAACACTACAGCTATAGTGGTCAATCGGTTGTGATGATTCCACAGTCACTATGGCAACACTACATCTAT
AATAGTCAAATTGTTGATGCGATTCTACAGTCGCTATGGTAACACTACAACTATAATAGTCAATCTTTTG
TGGTGATTCTACAGTTGCTATGGTAACTGCAACTATAATTGTCAAATTGTTGTGGTGATTCTACAGTTGC
TATGGTAACACTACAACTATAATAGTCACATTTTTGTGGTAATTCCACAGTTGATATGGCAACACTACAT
CTATAATAGTCAAAATTTTGTGGTAATTCTAAAGTTGCTATGGTAACACTTCAATTCTAATATTAAATTA
TTGCAGTGATTCTACAGTTGCTATGGTGACACTACAACTATAATAATCAAATTGTTGTGGTGATTCTGCA
ATTGCTATGGTAACACTACAGCTATAGTGGTCAATCGGTTGTGATGATTCCACAGTCGCTATGGTAACAC
TACAAATAAAATAGTCAAATTGTTTTGGTGGTTCTACATTTTCTATGGTAACACAACAACTATAGAAGTC
AATCTAATGTGTTGATTCTACAGTTGCTATGGTAACACTACAACTATAGAAATCAATCTGTTTTGGCGAT
TTCACTGTTGCTATGGTAACACTACAGCTATAGTAGTCAAATTATTGTGGTGATGCTACAGTTGCTATGG
TAACACTACAACTATACAAATATAAACAAATGAGCCAATACTGTAGTTTTCAACAACTAAATGTCATGTT
ATATTACAATACACCATAGCTTACTGTAGTGAACAGTAAACTACAGTATTTATCACAGCTTATCATTTTG
ATACAATTAATGCTACAGCACACATTAACCAACAGCTGTAGATACTACAGTATAATACACTTCACTATAG
TGTGGTTCAAAAACACTCTGGTATTTACTATAAATTACTGTAGTGTATTTGTGTGTGAGACTTTCTGATT
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