ZFLNCG12927
Basic Information
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Express profile
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Express in top 10 samples
Sample | Tissue | Condition | FPKM |
---|---|---|---|
SRR514028 | retina | control morpholino | 12.86 |
SRR514030 | retina | id2a morpholino | 3.32 |
ERR594418 | retina | transgenic flk1 and develop tumors | 3.31 |
ERR594417 | retina | normal | 3.24 |
SRR630464 | 5 dpf | injected epidermidis | 2.95 |
ERR023144 | brain | normal | 2.88 |
SRR1049946 | embryo | transgenic TgOMP-Gal4 and UAS-GCaMP1.6 and treated with DMSO | 2.68 |
SRR1342219 | embryo | marco morpholino and infection with Mycobacterium marinum | 2.67 |
SRR942769 | embryo | myd88+/+ | 2.62 |
SRR630463 | 5 dpf | normal | 2.46 |
Express in tissues
Correlated coding gene
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gene | correlation coefficent |
---|---|
znf385c | 0.78 |
LOC100333605 | 0.78 |
eml6 | 0.77 |
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mpp2a | 0.77 |
LOC556195 | 0.77 |
ssh1b | 0.77 |
LOC559232 | 0.76 |
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Gene Ontology
Download
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---|---|
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KEGG Pathway
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Conservation
Zebrafish lncRNA Transcript | Human lncRNA Transcript | Mouse lncRNA Transcript | Methods |
---|---|---|---|
ZFLNCT20045 | NONMMUT016512; | Direct blastn |
OMIM
OMIM of this lncRNA gene hava does not exist!
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>ZFLNCG12927
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TGAGTTGAAGCTACACAATTCAAAGTTTTTTTGGGTGCAACTTGTCAATTGTTTTATGTTTAATCTACTT
AAATTTGTAAATATAATTGCGATAAATTTAATCTATTTTTGTTTGGACAACAGCAATGAATTGTAACCCT
GCATTTTTACAGTGCAGTTAATTTAATTGTTTTAAAAAATTTAAGCGGATTGAACACAAAACAATTAAGT
TGTCCCAAAAATACCTTATGGACTGTTGGTTCAACTCATATTAAAAAAAGTAGTTTGAATAAGCAGCAAA
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AATTAGGTTGTCCTAAAAGTACCTTATGGTAGTGGTTGGTTCAACTTATATTTAATAAGTAGTTTGAATA
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TTTTGAGCGTGTTATACACTTAAAAAATGCAGGGTTCCACACAATTCATTTATATTGTCCTAACACAAAT
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AAATCTAAATAATTGTGTTGTTTTAGCTGATTTTAAATAAGTAGTTTGAACAAGCAATACAAAAAAATGT
TTTTTGAGTCTACCTTTACTACACAGACAAAAACAACCAAAAGCATGTTGGTGATGGGAAAGTCATATAA
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GTGAATTCTGGGATTTACTGATAATCATTACTTAATAATTTACAGTTATTCATCATATAAAAGGAAACAT
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ATAGTTAATTCTACTCATTTGAAAAGAGTTTTGAACTCCGTGTTTAAAGTAATGAGTTAAATAAATACCT
TATTACTTCAACTTAAATGGAGAAACTTTACAGTACTCATATAGATTTTTTTTTTTAACTCAAATGGGTT
GTAGCAATCGGTTTCCTCAAACTGTTTGAGTTCTCTTCATTTATTGGGTTTTTCTGTGCTCAAATTGCTT
CCTTTACCCAAATGGATGAAGTTCACAGTACTCATTAGGATTAGTTTTTGAACTTAAATGGTTTGTTGCA
GTCCTGTTTCCTCAAACAGTTTGAGTTACCTTAACTTTTTGAGTTTTAAAGTGAGGCAAAATCAAAGACA
GCAAAGTCACATATTTACTAAATGGCCCGAGGGTGAGTAAATTAAGCAGATGTTCATTTTATGTCTCTGT
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GAACATTTACTATACACTAACTAAAAAATCATCCACGTAACAGAAATCTCGGCTCATATTAAAAGAGATG
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AATATGTAACCGATTGAAGAAAATTGATTAAACGGAGGAGTATATCATTTCGAATTACCTCAGCACTGTC
CTGCTAAGTAGTGAGCAATGTCAAAACACGATACCTTTCTGTAAAAGTTCAACATGAAGGACTTGTGTAT
ATGTTTGTAAGTAGTTTTCAGATTCTCACCTGCTTTACTTTTACCATGTGCTTTCCAGGGTCACGTGTAT
AGAACAGACGATTGTTACCTGACTTTCTTCTTTTTTATCATTGGGTTTCTGCATTGTTAATGTTTGTTTT
TCTCTTTCCACTATGTGAGATGCATTTTTGAGTTTGATTGCCTGGAATTGCCCTGTATAAATGGAGAACA
AAGAAAAGTTGGCAGTTCAACGCAATTGCTTTCGAAAGCTGATGGAAACCTTTTGAAATTTATTGAAGAA
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AATTCTCCCCCAGACACACCATCCTGAGAAGCCACTTTTTCCTACCACAGGAAGCCCAAGAGAACACTAT
AGCTAGCAGTCTGACAGGCAAACTGAACCCTGGCCTTTTATATCCTGCCAGGTTCGAGAAGTTGGACATC
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ATGACAGAAATCGCTGAGAAACTGAACTATGATCGCGAGGTGGTGCGCGTCTGGTTCTGCAATAAGAGGC
AAGCTTTGAAAAACACTATAAAGAGGCTTAAACAGCCTGAGGGACTTGTGCCGGGCGCACCGATGGACCC
TCTGGTTGATAATATGGAGGAACACCAGTGAGCATCCAATGCGATGGTCAAACATCTGATGTTGCGGACT
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TATTGTCAGTGTTATCATCACAAAAGCAAAAACCAAAAAAGTCAAGAAAAAAAAAAAAACAGAGTTGTGT
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GAAAGAAAAAAAGGAACAAAAAAAAGAGGGATGGGGTTGGTGGGTGTGACATTCAATCTATGTCTTATTT
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TCGGATGTTTTATTTTTTAAAGCAAAGGGTTTTATTTTACTCGTCACACTCAACTAAATATATTCTATAT
ATAAATATATTCATAAAGATTTCAAGTAAATGAGATGGATTACTTTTAAAGATTTCTCTTGGGTTATGCA
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TATACATACTGTAAAAAAACAAACACAACTCCTTCATATTGTCCCAACACAAATCAATGAAGTTAATTGG
TAAGACTTTATTTTAATGGTCCCTATTGCGCATTTTGTTGACTAAAAATTGCATTGCAACTACTTCTCAT
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AACCCACACTGTAAAACCTAACAGTCAACTTTATCAAATGAAATGAGTGTAGTTAATTCAGAATTGACTG
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GTAGCAATCGGTTTCCTCAAACTGTTTGAGTTCTCTTCATTTATTGGGTTTTTCTGTGCTCAAATTGCTT
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GCAAAGTCACATATTTACTAAATGGCCCGAGGGTGAGTAAATTAAGCAGATGTTCATTTTATGTCTCTGT
CCTCCACTGAACAAGTCAAAAACTACAAAGGGGGCTTGCTTTATGGCATTTAAATATGCTATCAGAATTC
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GAACATTTACTATACACTAACTAAAAAATCATCCACGTAACAGAAATCTCGGCTCATATTAAAAGAGATG
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GCTGGACCAAAGCTCAATAGTTATATGCACATTGTACAGAGAAATGGCTAAATGTCGCTGACAATCTTGA
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